研究者在哺乳动物基因组中发现细菌基因

由约翰霍普金斯大学Steven Salzberg教授领导的研究团队本周在科学期刊PeerJ上发表文章表示环境中例如细菌序列的核酸污染物可能在哺乳动物基因组中进行装配，即使这些序列已经被公共数据库所收纳。

通过使用微生物学分析软件，Salzberg和他的同事们发现了美国奶牛基因组中包含了173个已经被证实的细菌核酸污染物微小相的邻片段，这些来自包括不动杆菌、假单胞菌以及寡养食单胞菌属的微小片段甚至已经开始装配。

虽然这些环境污染物作为完整的基因组信息被上传到基因库，没有被编入哺乳动物基因组，但是科学家确实在牛和羊的身上发现了一定数量的污染物片段。研究人员曾报道在家畜身上发现淋病奈瑟氏菌基因，该基因就是被基因库所独立收纳的。

Salzberg和他的同事们在报告中写道：“该研究结果阐明了在将基因组信息提交至公共基因文库之前对该信息进行污染物检测的重要性。基因组信息数量的高速增长是一件积极的事情，但是在急于将测序信息上传到公共基因文库的同时，确实需要避免类似事件的发生。”（转化医学网360zhyx.com）

原文：Researchers Find Sequences from Contaminants Within Genomes Housed in Public Databases

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