Cell综述：肾细胞癌基因全景图

  肾细胞癌(renal cell carcinoma ) 是成年人原发性肾肿瘤中最常见的类型，最新一期（12月3日）Cell杂志的“SnapShot: Renal Cell Carcinoma”这篇文章总结了目前关于这种癌症基因全景图中的几个关键特征，主要途径，肿瘤演变和异质性等多方面内容，并且也介绍了肾细胞癌的相关治疗进展。

  肾细胞癌RCC的出现包含一系列肾脏器官的病理学，分子水平上的临床恶性肿瘤变化。透明细胞癌（clear cell carcinoma）和乳头状肾细胞癌（papillary carcinoma）（1类和2类）占据了这种癌症的大部分。以上为与这两种癌症密切相关的多个基因与细胞通路。
  乳头状肾细胞癌分型
  乳头状肾细胞癌(PRCC)占每年肾癌病例的15-20%。长期以来它被分为1型和2型两类，然而直到现在科学家们还是基于从这一疾病一些罕见遗传形式获得的信息来了解PRCC的基础遗传学。对无肾癌家族史的病例的分子背景却知之甚少。当前，对于晚期PRCC没有有效的治疗方法。
  一项新研究描述了1型和2型之间一些特异的分子差异，以及2型的3种亚型。研究人员对来自161名患者的肿瘤进行了全面的基因组分析，发现1型和2型PRCC的分子与基因组均有差异，应该被视作是两种独立的疾病。他们还发现了2型PRCC的3种不同亚型，每一种以不同的分子改变为特征。
  其中一种亚型的特点为，整个基因组数千基因超甲基化。DNA甲基化是一种DNA分子修饰，控制了基因的开启或关闭，当它出错时会导致肿瘤形成。这种2型PRCC的新亚型叫做CpG岛甲基化表型(CIMP)，在所有PRCC类型中具有最低的总生存率，与参与代谢的一个基因发生改变密切相关。这些改变导致了CIMP肿瘤细胞代谢发生变化，由此支持了它们的快速生长与存活。
  基于CpG甲基化的检测方法
  来自中山大学、德克萨斯大学西南医学中心等处的研究人员报告称，他们开发出了一种基于CpG甲基化的检测方法来预测肾透明细胞癌（ccRCC）的生存。
  由于DNA甲基化是癌症形成至关重要的一个因素，其作为诊断及预后的一种生物标记物迅速获得了临床关注。DNA甲基化几乎只发生于哺乳动物5′-CpG-3′序列胞嘧啶C-5位置。随着全基因组技术的不断发展，了解与RCC等人类癌症相关的CpG甲基化将会迅速得到提高。
  在这篇文章中研究人员报告称，他们开发出了一种基于全基因组CpG甲基化图谱分析的可靠实用的分类器，可利用福尔马林固定、石蜡包埋的样品来预测ccRCC预后。他们在来自中国、美国和癌症基因组图谱数据集等3个独立的数据集中验证了这一分类器。这一分类器独立于临床标准预后因子，预测出了ccRCC患者的总存活率，其成功地将患者分为了高危和低危群体。此外，研究人员还调查了CpG甲基化与基因表达之间的关系，分析了基因相互作用网络。
  表观基因组学治疗新方法
  由美国约诊所肿瘤学家带领的一个国际研究团队，发现了一种新途径，可识别并可能阻止许多晚期癌症的进展，包括膀胱癌、血癌、骨癌、脑癌、肺癌和肾癌。
  这种新的方法聚焦于转移性肿瘤中的表观基因组指纹，在这些疾病中，身体往往会误解健康的遗传信息，从而产生有毒的细胞，与人体正常功能发生冲突。
  研究人员根据新发现的表观基因组指纹，叫H3K36me3缺失，进行了一个试验验证，这可以帮助我们识别更多的侵袭性癌症，或为每位患者的进一步个性化医疗护理，找到最好的药物。（转化医学网360zhyx.com）