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伯豪客户《plos one》发现诊断超急性期脑梗死的新颖标志物

首页 » 产业 » 企业 2016-12-26 转化医学网 赞(7)
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导读
全世界范围内,卒中严重降低其患病者的生存质量。而缺血性卒中占整个卒中的70-85%。快速诊断对超急性期脑梗死的临床决策非常重要。人们逐渐把寻找生物标志物的方向投向循环血的miRNA。但脑梗死病因复杂,分类繁多,使寻找特异性和敏感性高的循环血miRNA标志物困难重重。本研究使用miRNA的芯片及定量PCR数据来判定miRNA对超急性期脑梗死(HACI)的诊断价值,以TOAST及OCSP分型来探讨血浆的miRNA与脑梗死分型的关系,以MRS评分来摸索血浆的miRNA与脑梗死预后的关系。
研究背景

全世界范围内,卒中严重降低其患病者的生存质量。而缺血性卒中占整个卒中的70-85%。快速诊断对超急性期脑梗死的临床决策非常重要。人们逐渐把寻找生物标志物的方向投向循环血的miRNA。但脑梗死病因复杂,分类繁多,使寻找特异性和敏感性高的循环血miRNA标志物困难重重。本研究使用miRNA的芯片及定量PCR数据来判定miRNA对超急性期脑梗死(HACI)的诊断价值,以TOAST及OCSP分型来探讨血浆的miRNA与脑梗死分型的关系,以MRS评分来摸索血浆的miRNA与脑梗死预后的关系。

研究思路

研究结果

1、HACI与健康对照组(HVT)之间的芯片差异谱

以改变倍数大于2,p小于0.05的miRNA作为差异基因。11个miRNA是上调的 (miR-140,miR-106b,miR-130a,miR-16,miR-223,miR-93,miR-484,miR-25,miR-130b ,miR-107,andmiR-151),一个miRNA是下调的(miR-4454)。在芯片的聚类热图中本研究选送的4个对照标本自动聚拢为一个组,说明选送标本代表性良好。该研究中Agilent Human miRNA (8_60K) V19.0 array服务由伯豪生物提供。

2、以定量PCR验证芯片差异表达谱

研究者从芯片差异表达谱的12个miRNA中挑选标准化信号值较高的7个进行定量PCR验证。7个miRNA在定量PCR中的变化趋势有6个与芯片变化趋势相同,一个与芯片相反,说明二者较好的一致性。比较7个miRNA的定量PCR结果仅miR-16有统计差异。

3、基于miR-16的预测靶基因进行生物信息学分析

差异最显著的GO类别(生物学进程)主要包括细胞分化,细胞死亡,发育过程,凋亡,细胞增殖,细胞周期等。KEGG类别包含的主要经典信号通路有:p53,T细胞受体,ErbB,Toll-样受体(TLR),NOD-样受体,MAPK。

4、miR-16诊断HACI的灵敏度和特异度

本研究以ROC曲线来判断miR-16诊断HACI整体 的准确性。曲线下面积 (AUC)是0.775(95%CI 0.653±0.897,P=0.001)。当miR-16的表达水平在最佳截断点处(1.8333),其灵敏度和特异度分别是 69.7%和87%。以大动脉粥样硬化型(LAAS)脑梗死来绘制ROC曲线,AUC是0.952(95%CI 0.879±1.024),其灵敏度和特异度分别是 100%和91.3%。以完全前循环型脑梗死(TACI)来绘制ROC曲线,AUC是0.978(95%CI 0.925±1.031),其灵敏度和特异度分别是 100%和91.3%。以部分前循环型脑梗死(PACI)来绘制ROC曲线,AUC是0.795(95%CI 0.642±0.948),其灵敏度和特异度分别是 70.6%和87%。

5、血浆miR-16与HACI分型相关

本研究发现 LAAS型脑梗死患者的血浆miR-16表达水平比对照组显著增高,TACI型和PACI型脑梗死患者的血浆miR-16表达水平也比对照组显著增高。其余TOAST分型和OCSP分型的脑梗死患者的血浆miR-16表达水平与对照组无明显差别。

6、血浆miR-16与HACI预后相关

研究者按MRS评分将HACI患者分为预后良好组(mRS=0-2)和预后不佳组(mRS=3-6)。预后不佳组的血浆miR-16水平比预后良好组明显增高。

小结

本研究第一次通过临床证据证明循环血miR-16可以作为HACI的生物标志物。血浆miR-16诊断 HACI灵敏度、特异度高。生物信息学分析显示miR-16调节的靶基因与HACI后的众多生物学进程和信号通路相关。血浆miR-16浓度与HACI的TOAST分型相关,与OCSP分型相关,且与其预后相关。本研究对血浆miR-16与HACI的关系提供了令人着迷的新观点,为HACI进一步的机制研究提供了新的思路。

原文出处:

Tian C, Li Z, Yang Z, Huang Q, Liu J, Hong B. Plasma MicroRNA-16 Is a Biomarker for Diagnosis, Stratification, and Prognosis of Hyperacute Cerebral Infarction. PLoS One. 2016;11(11):e0166688.

(转化医学网360zhyx.com)

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