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Sander Piersma:从磷酸化蛋白质组学数据中推断激酶活性的工具及应用 | WeOmics-G13

首页 » 产业 » 快讯 2022-11-12 西湖欧米 赞(2)
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导读
11月15日(周二)7:00-8:30PM 免费预约,欢迎观看!
“Westlake Proteomics Series (WeOmics)” 系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室,The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办,并由西湖欧米承办,SCIEX协办。
本期研讨会主题:磷酸化蛋白质组学数据和激酶活性 
直播时间:2022年11月15日(周二)7:00-8:30PM
报告专家:
Sander Piersma,阿姆斯特丹大学医学中心肿瘤蛋白质组学实验室,研究科学家
讨论嘉宾:
陈晨(主持人),西湖欧米研发总监
边阳阳,西北大学生命科学学院教授
张振鹏,北京蛋白质研究中心博士后研究员
张程,西湖大学Guomics实验室博士后研究员
吕梦葛,西湖大学Guomics实验室博士生
本次研讨会介绍:
异常细胞信号通路是癌症和其他疾病的一个标志,其中包括蛋白质的磷酸化/脱磷酸化在内的信号通路是最重要的信号传导机制之一。蛋白质的磷酸化是由蛋白激酶催化的,人类基因组中已经发现了530多个蛋白激酶。异常的激酶活性是肿瘤发生和癌症进展的驱动因素之一,这导致下游底物的磷酸化丰度改变。这种底物磷酸化的足迹可以用来推断上游激酶的活动。目前的磷酸化蛋白组学方法可在每个生物样本中获得>10,000个磷酸化位点,这些信息可用作预测激酶活性。过去十年报道了许多推断激酶活性的软件工具,Sander Piersma 博士将做一个概述。主要的工具包括:激酶底物富集分析(KSEA),翻译后修饰底物富集分析(PTM-SEA)和整合的激酶活性推断分析(INKA)。Sander Piersma 博士会比较这三个主要工具,并展示它们的应用。
往期回顾
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WeOmics-G1研讨会的参与嘉宾是Peter Wild、Christine Koch、Oi Lian Kon 、郭天南和孙耀庭,会议共同探讨了蛋白质组学及多组学分子诊断在疾病诊疗中的应用现状和未来。



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