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专家访谈

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《转》访中科院方向东教授:精准医学“两张皮”--生命组学数据与医疗大数据的规范与整合
《转》访NEJM副主编肖瑞平教授:让中国医疗领域融入国际医学主流
《转》访美国德州大学梁晗教授:要把医疗转化成一个学习的系统
《转》访全球医生组织中国总代表时占祥博士:远程医疗,三米之外即为“远程”
《转》访北京肿瘤医院张力建教授:不忘初心,开展“有中国特色的精准医疗”
《转》访北京同仁医院黄丽辉主任:未语先测听 听力与耳聋基因筛查尤为重要
《转》访张志愿院士:肿瘤靶向治疗“单打”不现实,寻找最佳治疗方案是重点
《转》访血液病专家肖志坚教授:谈髓系肿瘤的精准治疗
《转》访中国医科大学刘云鹏教授:精准医疗刚刚起步,仍需不断向前推进
《转》访胡松年教授:二代测序“实战”——指导高血压个体化用药
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2017热词预测之单细胞测序

2016-12-30

最近几年,关于单细胞测序的报道日益增多。事实上,单细胞测序是一个新兴的领域。单细胞测序分为单细胞转录组测序和单细胞基因组测序。单细胞转录组测序分为:单细胞DGE、单细胞polyA测序、单细胞lncRNA测序。单细胞基因组测序分为:单细胞外显子组测序和单细胞全基因组重测序。 据了解,单细胞测序萌芽于2010年,2013年是单细胞基因组学突飞猛进的一年。2013年谢晓亮教...

单细胞测序,解密小RNA分子的未知功能

2016-11-05

随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘,单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院( Karolinska Institute)的研究人员近日公布了一种新方法,这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列,有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结果以《Single-Cell Sequencing of the Small-RNA ...

Science:最大规模的人脑单细胞测序计划首获成功,大力推动脑部疾病个体化诊疗

2016-06-27

2016年6月24日,一项发表在在线出版的Science杂志上的研究开发了首个大规模高效方法用于人类大脑神经性元不同亚型的鉴定,奠定了“绘制”人脑神经元细胞基因活性方法的基础;同时,可以帮助我们更好的理解人脑正常功能及疾病异常,包括阿尔茨海默氏症、帕金森症、精神分裂症和抑郁症等。此篇论文的通讯作者是来自美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的张鹍教授。   该研究通...

单细胞研究指南:测序方法大比拼

2016-05-13

  多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。   那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞研究(尤其是单细胞...

单细胞技术新突破:在单细胞水平实现蛋白与RNA的同时检测

2016-03-29

  单细胞分析技术有很广的范畴,包括进行核酸水平检测的各种单细胞测序及PCR技术,还有进行蛋白水平检测的质谱流式等等。迥异的检测技术手段使我们很难同时对单细胞的核酸和蛋白进行高通量的检测。2015年底,随着《Nature methods》一篇文章的发表,这种情况成为了历史。   引发这一技术突破的是美国斯坦福大学的Garry Nolan实验室,他们成功的将...

单细胞测序为研究免疫反应提供新方法

2016-03-10

  欧洲分子生物学实验室等机构的研究人员近日开发出一种计算方法,能够从单个T细胞的RNA测序数据中重建配对的T细胞受体(TCR)序列,将T细胞特异性与功能反应相关联。这项成果于本周发表在《Nature Methods》期刊上。   T细胞受体是T细胞表面的特异性受体,负责识别MHC所呈递的抗原。它是异源二聚体,由T细胞发育过程中的V...

干货|单细胞基因测序领域分析(包括市场分析、投资并购、案例分享)

2016-03-02

  什么叫做单细胞基因测序(Single-Cell Sequencing)?   一句话说,就是单个细胞水平上对基因组进行测序。2013年,自然杂志把年度技术授予了单细胞基因测序(Single Cell Sequencing),认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。   我们为什么要进行单细胞基因测序?   ...

北大团队发展最新单细胞多重组学测序技术

2016-02-29

  单细胞三重组学测序技术(scTrio-seq)   单细胞中三种组学之间的对应关系   癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异   2016年2月23日,《细胞研究》(Cell Research)杂志在线发表了北京大学生...

国内首例“单细胞高通量基因测序+核型定位技术”试管婴儿在沪诞生

2016-02-29

  国内首位运用单细胞高通量测序联合核型定位技术对遗传性甲状腺癌致病基因RET进行筛检而生出的健康婴儿昨日诞生。   早报记者昨日从上海交通大学附属国际和平妇幼保健院(以下简称国妇婴)获悉,国内首例采用单细胞高通量测序技术的第三代试管婴儿甜甜(化名)顺利诞生。据介绍,“甜甜”的父亲患有甲状腺癌,此前接受过基因检测,将有50%的机会将...

著名学者Nature综述:单细胞测序之现状

2016-01-27

  每个细胞都是独一无二的,但我们的研究对象往往是细胞群体,忽略了这些细胞之间的异质性。正因如此,单细胞基因组学研究受到了越来越多的关注。   单细胞基因组学领域近年来发展得非常迅速,为人们揭示了复杂生物学体系的许多重要线索,包括微生物群落的生态多样性和人类癌症的基因组。一月二十五日Nature Reviews Genetics杂志...

Bio-Rad和Illumina联合开发新型的单细胞测序系统

2016-01-14

  近日,Bio-Rad公司和Illumina公司达成合作协议共同开发针对单细胞的新一代测序工作站,单细胞分析领域在过去几年里发生着翻天覆地地变化,而两家公司的这项合作也将会对很多竞争性技术的企业带来一定影响。   Illumina公司 CEO Jay Flatley在本周举办的摩根大通(JP Morgan)医疗会议上表示,这项...

单细胞测序助力中科院刊发《science》 表观遗传研究取得重大突破

2016-01-08

  图:父亲的后天饮食可通过改变精子RNA影响后代健康   单细胞测序解决了用组织样本测序或样本稀少时无法解决的细胞异质性难题,正日益成为科研热点,尤其是在生殖领域的研究中大放异彩。近日,安诺基因与动物所周琪、段恩奎研究组以及上海生命科学院营养所翟琦巍研究组合作,在高脂饮食诱导的父代肥胖小鼠模型中,发现一类成熟精子中高度富集的小RN...

2015生物医学领域热词盘点

2015-12-28

  今年生物医学领域好不热闹,热点事件不断,从年初美国总统奥巴马对精准医疗的提出,到屠呦呦获得诺贝尔医学奖,前华大CEO王俊离职,离职市长梅永红就任华大基因并任职基因库主任,再到埃博拉疫苗启动II期临床试验等等。   【1】基因编辑   今年12月人类基因编辑国际峰会在华盛顿召开,再次将基因编辑的伦理问题推上风口浪尖。科学家们经过三天的激烈讨论,最终达到共识:基因编辑技术不应该用...

【盘点】单细胞测序研究这几年

2015-12-16

      单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。最近几年,关于单细胞测序的报道日益增多。实际上单细胞测序是一个近年来的一个新兴研究领域。   单细胞测序萌芽于2010年,2013年才真正发展起来,2014年,单细胞测序的应用被列为《自然—方法学》(Nature Methods)年度最重要的方法学进展,2015基因组学...

《转》访陈重建博士:乘风破浪,单细胞测序再创新突破

2015-12-03

  引言:2015年4月27日,Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,基因组与转录组平行测序(Genome and Transcriptome Sequencing, G&T Seq)。该技术实现了对单个细胞内的DNA和RNA平行测序,能够展现单个细胞的基因变异与基因功能之间的关系。作为国内单细胞测序技术整体解决方案的领导者,安诺基因也一直在此方向投入研发。...

新的单细胞测序全基因组扩增方法

2015-09-10

  北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊课题组和谢晓亮课题组合作,在单细胞全基因组测序研究中获得取得重要进展,2015年9月4日在《美国科学院院刊》在线报道了一种用于单细胞测序的全基因组扩增新技术——乳液全基因组扩增,简称“eWGA”。该方法与已有的类似技术相比,大幅度提高了扩增的均匀性和准确性,可以同时检测出单细胞中的小片段拷贝数变异(CNV)和高精度的单核...

北大谢晓亮、黄岩谊教授PNAS开发单细胞测序新技术

2015-09-08

  来自北京大学的研究人员报告称,他们开发出了一种基于乳液的扩增方法来抑制扩增偏移检测单细胞拷贝数变异(CNV),同时以高精确度检测单核苷酸变异(SNV)。这一方法能够与各种扩增实验方案包括广泛使用的多重置换扩增(MDA)相兼容。这一重要的成果发布在9月4日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。   北京大学的谢晓亮(X. Sunney Xie) 教授及黄岩谊(Yanyi ...

当宏基因组遇上单细胞测序

2015-04-02

  日前,科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。   16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性,但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上,研究者人员向人们展示了在四个温泉样本(北美和亚洲)中发现的一类新细菌Candidatus Kryptonia。这项研究共测序了22个...

新型单细胞外显子组测序法

2015-03-31

      最近,美国MD安德森癌症研究中心和德克萨斯大学休斯敦健康科学中心的研究人员,开发出一种新型单细胞外显子组测序方法称为SNES。与目前大多数单细胞测序方法形成对比,SNES利用细胞核而不是细胞进行分析,从而将会在生物学许多不同领域具有广泛的应用。相关研究结果发表在2015年3月25日的国际著名学术期刊《Genome Biology》。   单细胞测序方法可让我们深入阐述罕见细胞亚群和复...

Fluidigm推出高通量单细胞mRNA测序流程

2014-11-25

  Fluidigm公司近日在美国神经科学学会的会议上宣布推出一个新流程,能实现高通量的单细胞mRNA测序。这个流程综合了集成流体通路(IFC)设计的显著进步,可大规模提高通量和易用性,同时降低单细胞制备的成本。据介绍,商业化的产品有望在2015年上半年推出。   Fluidigm的CEO Gajus Worthington...