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专家访谈
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【Nature子刊】重大进展！首次从灵长类动物基因组中编辑出类似HIV的病毒
近日，天普大学刘易斯·卡兹医学院的科学家们已经成功地从非人类灵长类动物的基因组中编辑出了于HIV类似的病毒——SIV。这一重大突破使科学家们向开发人类HIV感染的疗法迈进了一大步。 这项于11月27日发表在《自然通讯》杂志，题为“CRISPR based editing of SIV proviral DNA in A...
【中华空间基因组学峰会】3 个小时，讲清楚基因组学这件事！
近年来，随着技术更新，基因组学在生物科学研究中火速蹿红，招来了无数小伙伴的「向往目光」。但进入这个领域的门槛并不低，小伙伴们或许疑惑，这门专业值得投入么？前景如何？ 用一个比较形象的比喻，兴许能解开大家心中的困惑。基因组学：初阶=实验员；中阶=SCI 文章写手；高阶=诺奖候选人。 细心的小伙伴已经发...
【Nature】重磅！NHGRI公布人类基因组前沿战略构想
自从17年前国际人类基因组计划完成以来，基因组学领域已经蓬勃发展，所有生物医学领域中都在大量使用基因组学方法。 本周，美国国家卫生研究院（NIH）旗下的国家人类基因组研究院（NHGRI）在《自然》杂志上发表了“改善人类健康基因组学的前沿战略构想” 。这一构想描述了人类基因组学在未来十年内最引人注目的研究和机遇，...
第十五届国际基因组学大会（ICG-15）在武汉开幕
10月26日上午，第十五届国际基因组学大会（ICG-15）在武汉开幕。本届大会以“组学与人类健康”为主题，吸引了来自海内外20余位院士及百余位组学领域顶尖科学家参会。湖北省委常委、武汉市委书记王忠林，武汉市委副书记、市长周先旺等嘉宾出席大会开幕式。 大会学术委员主席、华大集团联合创始人刘斯奇 &em...
【Cell子刊】汤富酬团队利用单细胞多组学测序 证实结直肠癌基质细胞中普遍的基因组变异
肿瘤微环境中的细胞可能通过与癌细胞的相互作用而促进疾病的进展，但是对于这些非癌性细胞被癌细胞转化的程度人们还知之甚少。为了剖析这些非癌性细胞的变化，汤富酬等人通过单细胞多组学测序技术，揭示了结直肠癌基质细胞中普遍存在的基因组变异，并鉴定出CRC中显示预后不良的特异性标志物。 该研究于10月2...
【新发现】稻米饮食引起基因组适应，东亚人肥胖和糖尿病风险更低！
一项国际研究最近提出了一个有趣的假设：一些东亚人群的传统稻米饮食引起了许多基因组适应性改变，这些改变可能有助于降低糖尿病和肥胖症的风险。 该研究由意大利博洛尼亚大学的科学家领导，并发表在《Evolutionary Applications》杂志上，题为“Genomic adaptations ...
【Cell子刊】诱导多能干细胞+基因组编辑确定心血管疾病新疗法
心脑血管疾病的预防包括一级预防和二级预防，一级预防是指发病前的预防，即无病防病发生；二级预防是为了降低再次发生的危险及减轻致残率，即患病后防止再发病。最近有项研究通过遗传学与基因组学的方向研究心血管疾病的治疗。 该项研究于9月9日发表于《Cell Reports》,题目为：“ iPS...
【Nature子刊】基因组测序加快食管癌早筛
中国是食管癌高发国家，发病率与死亡率均占世界的一半以上，每年新发病例25.9万例，死亡21.1万例，超过90%的中国食管癌为鳞癌，严重地威胁人们的健康和生命。而在近日，国外一项新的研究发现：基因组学和统计学相结合可以来准确预测患者罹患食管癌的风险高低。 这项新的研究由剑桥大学研究人员和欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）进行，并于9月7日发表在《Na...
【邀请函】第十五届国际基因组学大会即将在武汉召开！诚邀您来！
第十五届国际基因组学大会（ICG-15）将于2020年10月25日-31日在中国武汉举行。正如在4月8日第一轮会议预告中所述，武汉市“解封”三个月以来，大部分社会活动均已恢复，决战新冠疫情已经取得了阶段性胜利。在此，热诚邀请全球生命科学界与生物产业界的老师、朋友及同仁莅临会议。 ICG-15以“组学和人类健康”为主题，将从生命科学尤...
【PLOS子刊】AI融合基因组学研究预测阿尔茨海默病的早期分子标记
近年来，深度学习技术不断推动着人工智能（AI）技术革命。受下一代测序（NGS）技术进步的启发，基于组学的研究数据已经变得易于访问和标准化。近日，韩国脑科学研究所的一项研究使用先进的对抗性生成网络（GANs）的深度学习技术分析了阿尔茨海默氏病（AD）小鼠模型的大脑皮质组织数据。结果发现，β淀粉样蛋白在疾病的早期含量增加并改变胆固醇的生物合成。 &...
【行业动态】世界三大药企之一诺华与基因组医学公司Sangamo宣布基因治疗合作高达7.95亿美元
通过该协议，Sangamo将获得7500万美元的前期许可费，并将有资格获得高达7.2亿美元的其他开发和商业里程碑付款，其中包括高达4.2亿美元的开发里程碑和高达3亿美元的商业里程碑。 诺华公司将拥有Sangamo基因组调控技术的专有权，该技术将针对与神经发育障碍相关（包括智力障碍和自闭症谱系障碍）...
【Cell子刊】里程碑式全基因组研究发现，现代鸡起源于东南亚
近日，中科院昆明动物研究所的王明山领导的研究人员，对鸟类的全基因组进行了首次广泛研究。同时，联合中国农科院北京畜牧兽医研究所畜禽遗传资源联合实验室的首席科学家韩建林，开始了一项为期20年的项目，对亚洲和非洲120多个村庄附近的土著鸡和野生原鸡进行采样。 王等人对836种鸟类的全基因组进行了测序及比较，得出结论：在约公元前7500年左...
【Nature子刊】酗酒基因已确定！43.5万人的全基因组荟萃分析揭晓答案！
耶鲁大学医学院的研究人员于5月25日在《自然神经科学》杂志上报告说，对超过43.5万人的全基因组荟萃分析，发现了29种与酗酒有关的基因变异。 这项研究研究对四个独立生物库或数据集（包括MVP phase1、MVP phase2、PGC和UKB）中包含的欧洲血统人群，进行了全基因组荟萃分析。研究人员在符合酗酒标准的人群中...
CTM期刊 |综合分析尿道上皮癌细胞系基因组信息可以发现一些隐藏的研究偏差和警示
基因突变和其它一些分子生物学操作一起可以影响细胞的表型。例如，膀胱癌细胞系RT4有TACC3-FGFR3融合基因，没有TP53基因突变，而另一种膀胱癌细胞系T24有TP53基因突变，没有FGFR3突变。为了搞清楚是否这些基因型的不同可以影响研究得出的结论，作者对1589篇尿道上皮癌相关的文章进行了分析，这些文章有的用了RT4细胞系，有的文章没有。 2020年4月30日，C...
【精华回顾】胡婷教授分享比较基因组杂交微阵列芯片在产前诊断中的应用
胡婷教授 四川大学华西第二医院副教授，副主任医师 背景介绍 产前诊断技术的发展 从细胞遗传学到分子（细胞）遗传学 常见染色体三体（T21/18/13）—— FISH、QF-PCR、MLPA ...
【Cell子刊】表观基因组可作一种治疗策略来预防视力丧失
研究阐明了与杆状感光细胞、视网膜光敏细胞衰老有关的分子变化和生物学途径。未来的研究可以进一步研究如何预防或延缓衰老过程中的视力丧失，并有望降低相关神经退行性风险。 每个生物体都有一个基因组，一个控制人体所有细胞和组织功能的基因库。这些基因的表达（当存储在DNA中的信息转换成用于制造蛋白质或其他分子的指令时）由有机体的表观基因组进行调...
【Nature】国内前列腺癌大规模基因组分析，和老外存在明显差异
近日，海军军医大学孙颖浩院士领衔，于《Nature》在线发表了文章，对208份中国原发性前列腺癌患者的肿瘤组织样品进行研究，解除了一直以来的牵制，结果发现：41％的肿瘤包含FOXA1突变，18％含有ZNF292和CHD1缺失。 作者分析了来自中国的208例经历前列腺癌根治术的原发性前列腺癌患者肿瘤组织，其中177份前列腺癌组织之前未经...
《Nature》子刊：癌细胞的“达尔文进化论”！依靠基因组倍增来不断生长！
导语：癌症的发展可以被认为类似于无性进化，全基因组加倍（WGD）在癌症中普遍存在，涉及整个染色体补体的加倍，然而，关于WGD在癌症进化中的选择压力尚未得到充分研究。 近日，伦敦大学（University College London）TRACERx团队的联合负责人尼基·麦克拉纳汉（Nicky McGranahan）博士领导的研究团队就全基因组...
《cell》：肠道微生物大规模宏基因组研究突破，助力治疗心血管疾病！
导语：肠道菌群是一个动态且高度多样化的微生物生态系统，会影响宿主生理的许多方面，虽然许多研究侧重于单个微生物分类群对机体健康的影响，但它们的整体代谢潜力尚未得到充分的探索。 近日，《Cell Reports》发表一篇文章中，用整合的宏基因组目录对小鼠的肠道微生物进行了全面地研究，通过互补方法重建大量MAG（超基因组组装基因组）以及将16S r...
【研究】利用高通量表型推断基因型进行基因组选择
导读：研究者建立并检验了一种利用高通量表型推断个体基因型的方法，由此推断出的基因型可用于基因组的选择，有利于使基因组选择发生在温室环境中，从而减少育种计划的周期时间。 近日，预印本网站上biorxiv.org上发表重要结果，可利用高通量表型推断基因型，从而进行基因组选择。 在许多育种项目中，对所有的...