杨焕明院士和他的团队为“人类基因组计划”、“人类单体型图计划”、 “千人基因组计划”等国际合作的基因组计划以及第一个亚洲人基因组、人类泛基因组学、古人类基因组、肠道Meta基因组、癌症基因组、外显子组和甲基化组的研究做出了重大贡献。
  2006年入选EMBO（欧洲分子生物学组织）外籍成员，2007年当选中国科学院院士，2008年当选发展中国家科学院院士，2009年当选印度国家科学院外籍院士，2012年当选德国科学院院士 ，2014年当选美国科学院外籍院士 。现为EMBO（欧洲分子生物学组织）外籍成员，EAGLES（欧洲全球生命科学促进会）副主席，IGBC（联合国教科文组织国际政府间伦理委员会）中国代表。曾任中国科学院北京基因组研究所所长。中国科学院北京基因组研究所研究员。现任中国遗传学会副理事长，全国学科首席科学传播专家（第一批）。

1991年获英国佩士来大学博士学位，1992年在英国爱丁堡大学完成博士后研究，1995年在英国MRC爱丁堡人类遗传学研究所完成高年资研究者工作，1996年起中国科学院研究员，先后担任上海生命科学中心（上海脑研究所）、上海生理研究所、上海生命科学研究院营养科学研究所室主任，2000年起上海交通大学教授，Bio-X中心主任，2007年曾兼任复旦大学生物医学研究院院长。
  2005年当选为中国科学院院士。2010年当选第三世界科学院院士。

1999年获教育部长江学者(讲座教授)，2002年被科技部聘为973项目首席科学家，
2006年获国家杰出青年基金，2011年入选国家“千人计划”（追溯）。1994年获德克萨斯大学生物医学/遗传学博士学 位。曾任美国德克萨斯大学公共卫生学院副教授（终身教职，1999年）、美国辛辛那提大学医学院教授（终身教职，2001年）。2007年6月起任复旦大 学副校长兼研究生院院长。2011年5月起任复旦大学党委委员、常委，副校长。

主持国家杰出青年基金、国家自然基金等各级科研课题17项, 总经费600万元。发表研究论文46篇，其中国际期刊11篇。参编专著2部。获国家科学技术进步三等奖一项，军队科学技术进步二等奖一项，广东省丁颖科技奖一项。 医学遗传学教研室主任 广东省“产前诊断和遗传病诊断技术中心”副主任, 博士生导师, 国家杰出青年基金获得者 ,中国遗传学会理事。中华医学会广东省分会遗传学会主任委员。

1981-1989年在华中科技大学同济医学院学习，获得儿科学学士及儿科血液与遗传学硕士学位；1990-1993年在美国亚历桑那州西南生物医学研究所及亚历桑那州立大学凤凰城医学遗传学联合培养计划学习，获得美国医学遗传学委员会医学遗传学医学博士专家证(ABMG)；1994年获得美国纽约州临床细胞遗传学实验室主任资格；1998年至今为美国医学遗传学医师学会会员（ACMG）。1993-1998年历任美国Genzyme 公司分子细胞遗传学实验室副主任、主任；1998-2008年历任美国犹它大学医学院儿科学副教授、教授，病理学兼职教授，分子细胞遗传学实验室主任；2007-2011年任中国医疗技术公司及其子公司北京金菩嘉医疗科技有限公司首席技术官;现任中国康圣环球医学特检集团首席医疗官并兼任北京海思特临床检验所有限公司总经理。其它任职还包括：2000-2007年任美国犹他州华人联合会主席；2001年聘为同济医科大学附属协和医院客座教授；2005-2006年任北美华人遗传学家协会主席； 2007年聘为北京大学人民医院客座教授。
  至今已申请50多项国际及国内专利，用于生物医学相关领域的研究及应用。至今已发表90多篇SCI研究文章、综述性文章或书中章节。多次应邀在各种国际性会议上作大会发言。作为科研课题主要负责人或合作者在美国参入了包括美国NIH及NCI资助的十几个项目。作为课题首席科学顾问，参入了《荧光原位杂交技术在产前遗传性疾病及部分肿瘤检测的多中心临床应用研究》（2007年度卫生部科研基金项目，150多家三级医院参加）和《中华医学会分子生物学临床应用研究专项资金》（2010年度中华医学会研究专项资金项目，100多家三级医院参加）。主持研发的“荧光原位杂交系列探针”获得2009年北京市自主创新产品证书及奖牌，“生物传感芯片阅读仪W2600型”、“生物传感芯片阅读仪A600B型”和“人乳头状瘤病毒分型检测试剂盒（表面等离子谐振法）”也分别获得了2010年北京市自主创新产品证书及奖牌。2009年12月获得北京经济技术开发区海外高层次人才的认定。2012年获得第四届北京市留学人员创新创业特别贡献奖。