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腾讯登录百岁老人基因组测序比赛揭开序幕
| 导读 | 一场旨在推动基因组测序技术发展的竞赛马上就要开始，选手们已经在起跑线上各就各位。美国加州的X Prize基金为这场比赛提供1000万美金的奖金，用来奖励获胜的团队，条件是在30天内完成对100位100岁及以上老人的基因组测序，且每个基因组的费用不超过1000美元。7月23号，加州Life Technologies公司的Ion Torrent宣布参加比赛，该公司相信他们的半导体测序技术能够在这场比赛... |
一场旨在推动基因组测序技术发展的竞赛马上就要开始，选手们已经在起跑线上各就各位。美国加州的X Prize基金为这场比赛提供1000万美金的奖金，用来奖励获胜的团队，条件是在30天内完成对100位100岁及以上老人的基因组测序，且每个基因组的费用不超过1000美元。7月23号，加州Life Technologies公司的Ion Torrent宣布参加比赛，该公司相信他们的半导体测序技术能够在这场比赛中搏一搏。
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这场比赛将在2013年的9月正式开始，目的是为了推动技术的进步，提高测序准确度并降低测序成本，目前人类基因组测序的价格是在3000到5000美元之间。X Prize基金的董事长Peter Diamandis表示，这场比赛将有助于建立“医学级别”的基因组测序标准，以满足用于诊断或治疗所需的高准确度测序的需求。
由于一些基因组测序服务公司以及仪器制造上不断的宣称自己所获得的技术进步，这场比赛也将是对一些测序公司所宣称的技术的检验。“我把这场比赛叫做基因组测序领域的实话实说。”负责这场比赛的基因组专家Craig Venter表示。
比赛的报名截止日在明年的5月，举办方希望竞争能够更加激烈一些。这次比赛的前身曾经在2006年吸引了一些报名者，不过没有人能够获得胜利。
这一次，X prize基金放宽了时间限制，将比赛时间定为30天——这比2006年的比赛要宽松的多，测序对象定为百岁老人，因为这些老人可能携带一些长寿基因。比赛的获胜团队需要最先对100个基因组完成98%的测序，每100万碱基对中的错误要少于1，并且确定每个变异所在的染色体。如果没有胜出者，比赛将颁发优胜奖。“如果有团队能够满足所有的条件那就太令人惊讶了，” Bio-IT World的主编Kevin Davies表示。
Ion Torrent对他们的技术很有信心，他们的半导体测序技术能够对一条DNA链上每增加一个碱基所带来的微弱pH值变化做出测定。而大多数的测序技术是依赖于碱基连接时发射出的光，这就在光学设备上提高了内在的成本。
Davies认为英国的Oxford Nanopore公司是个实力不容小觑的参赛者。在今年底的早些时候，该公司宣称很快就能实现在15分钟内完成一个人类基因组的测序。Oxford Nanopore公司的技术要点在于对通过纳米级小孔的DNA链上的每个碱基进行感应。目前，中国的测序公司BGI和美国专门做人类基因组测序的Complete Genomics还为确定是否会参赛。
Complete Genomics公司的CEO Clifford Reid担心很难对新测出来的基因组的数据准确度进行评判。他表示：“参加比赛的公司本身是比赛的裁判。”他希望举办方能够找到一个让所有参赛者都满意的解决方案。这家公司本月早些时候在Nature杂志发表文章介绍了他们<span style="text-decoration: underline;">长片段读取（LFR）技术</span>，能够将基因组测序精度提高到99.99999%。
优秀的技术会获得奖励，不过Venter表示关键的挑战并不是测序技术本身，而是弄明白那些序列所包含的生物学及医学含义。
来自：生物探索
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这场比赛将在2013年的9月正式开始，目的是为了推动技术的进步，提高测序准确度并降低测序成本，目前人类基因组测序的价格是在3000到5000美元之间。X Prize基金的董事长Peter Diamandis表示，这场比赛将有助于建立“医学级别”的基因组测序标准，以满足用于诊断或治疗所需的高准确度测序的需求。
由于一些基因组测序服务公司以及仪器制造上不断的宣称自己所获得的技术进步，这场比赛也将是对一些测序公司所宣称的技术的检验。“我把这场比赛叫做基因组测序领域的实话实说。”负责这场比赛的基因组专家Craig Venter表示。
比赛的报名截止日在明年的5月，举办方希望竞争能够更加激烈一些。这次比赛的前身曾经在2006年吸引了一些报名者，不过没有人能够获得胜利。
这一次，X prize基金放宽了时间限制，将比赛时间定为30天——这比2006年的比赛要宽松的多，测序对象定为百岁老人，因为这些老人可能携带一些长寿基因。比赛的获胜团队需要最先对100个基因组完成98%的测序，每100万碱基对中的错误要少于1，并且确定每个变异所在的染色体。如果没有胜出者，比赛将颁发优胜奖。“如果有团队能够满足所有的条件那就太令人惊讶了，” Bio-IT World的主编Kevin Davies表示。
Ion Torrent对他们的技术很有信心，他们的半导体测序技术能够对一条DNA链上每增加一个碱基所带来的微弱pH值变化做出测定。而大多数的测序技术是依赖于碱基连接时发射出的光，这就在光学设备上提高了内在的成本。
Davies认为英国的Oxford Nanopore公司是个实力不容小觑的参赛者。在今年底的早些时候，该公司宣称很快就能实现在15分钟内完成一个人类基因组的测序。Oxford Nanopore公司的技术要点在于对通过纳米级小孔的DNA链上的每个碱基进行感应。目前，中国的测序公司BGI和美国专门做人类基因组测序的Complete Genomics还为确定是否会参赛。
Complete Genomics公司的CEO Clifford Reid担心很难对新测出来的基因组的数据准确度进行评判。他表示：“参加比赛的公司本身是比赛的裁判。”他希望举办方能够找到一个让所有参赛者都满意的解决方案。这家公司本月早些时候在Nature杂志发表文章介绍了他们<span style="text-decoration: underline;">长片段读取（LFR）技术</span>，能够将基因组测序精度提高到99.99999%。
优秀的技术会获得奖励，不过Venter表示关键的挑战并不是测序技术本身，而是弄明白那些序列所包含的生物学及医学含义。
来自：生物探索
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