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illumina公司测序仪:NextSeq 500与MiSeq和HiSeq的性能比较

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导读
新年伊始,Illumina公司在第32届摩根大通保健大会上重磅推出两款测序仪:HiSeq X Ten和NextSeq 500。HiSeq X Ten定位为工厂规模的测序仪,通量超高,价格不菲;而NextSeq 500则旨在以MiSeq的大小提供HiSeq的性能。 NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简约为一体,是目前...


新年伊始,Illumina公司在第32届摩根大通保健大会上重磅推出两款测序仪:HiSeq X Ten和NextSeq 500。HiSeq X Ten定位为工厂规模的测序仪,通量超高,价格不菲;而NextSeq 500则旨在以MiSeq的大小提供HiSeq的性能。

NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简约为一体,是目前唯一一款可实现外显子组、转录组和全基因组测序的台式测序仪。它可在两种模式下开展测序实验:高产量(High Output)和中等产量(Medium Output),在单次运行中可获得20-120 Gb的数据,为您带来广泛的应用灵活性。

与MiSeq一样,NextSeq 500的整个流程也非常简单。制备好的文库可直接上样到系统。整合的簇生成实现了单分子的自动化克隆扩增。产生的DNA簇在NextSeq 500系统上测序,利用Illumina边合成边测序(SBS)技术及专利的可逆终止子原理。凭借成熟的SBS技术,NextSeq 500系统带来了行业领先的测序准确性,其中75%以上的测序碱基都高于Q30。

Illumina的测序仪家族不断扩大,让大家在选择时不禁犯难。为此,Illumina将NextSeq 500与MiSeq和HiSeq 2500测序平台进行了比较,让您清晰了解它们的性能。

Illumina对MiSeq的定位是聚焦通量(Focused power):快速简约,适合靶向和小型基因组测序;NextSeq 500是灵活通量(Flexible power):快速简约,适合每日基因组学;而HiSeq 2500是生产通量(Production power):强大高效,适合大规模基因组学。

全基因组测序

单次运行可开展多少大型基因组测序实验(人类基因组,30倍覆盖度)?

• MiSeq:不适用
• NextSeq 500:1
• HiSeq 2500:1-10

单次运行可开展多少小型基因组测序实验(5 Mb微生物基因组,如大肠杆菌,30倍或以上覆盖度)?

• MiSeq:1-96
• NextSeq 500:120-792
• HiSeq 2500:96-6660

外显子组测序

单次运行可开展多少外显子组测序实验(读长2 x 150 bp)?

• MiSeq:1
• NextSeq 500:3-9
• HiSeq 2500:96

参考《NextSeq 500 System Exome Solution Application Note》

RNA测序

单次运行可开展多少基因表达谱分析实验(每个样品10M reads)?

• MiSeq:1-2
• NextSeq 500:13-40
• HiSeq 2500:60-400

单次运行可开展多少转录组测序实验(每个样品50M reads)?

• MiSeq:不适用
• NextSeq 500:2-8
• HiSeq 2500:12-80

参考《NextSeq 500 System RNA-Seq Solution Application Note》(转化医学网360zhyx.com)

来源:生物通

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