研究发现通过追踪患者体内IncRNA位置的变化来评估癌症复发风险
导读 | 我们知道癌症的治疗存在着两大难题,一个是癌症的转移,一个是癌症的复发。在过去很多年间这两大治疗难题都是制约着癌症治愈的关键性因素所在。目前一些科研机构通过对肿瘤的转录组数据分析,发现其可以通过该分析对癌症复发风险进行评估,这也有望成为癌症复发评估的新方法。 |
我们知道癌症的治疗存在着两大难题,一个是癌症的转移,一个是癌症的复发。在过去很多年间这两大治疗难题都是制约着癌症治愈的关键性因素所在。目前一些科研机构通过对肿瘤的转录组数据分析,发现其可以通过该分析对癌症复发风险进行评估,这也有望成为癌症复发评估的新方法。
华盛顿大学团队人员通过转录组序列数据追踪到在肺癌患者体内IncRNA(long intergenic non-coding RNA:长基因间非编码RNA)位置的不断转变。通过对567例肺腺癌或肺鳞状细胞癌样本进行癌症基因组图谱和其它项目的分析,研究者鉴定了上千种之前未被描述的IncRNA。
这其中有100种IncRNA在肺癌患者中的表达模式与在正常人中的表达模式不一样。通过对其它类型癌症的上百个肿瘤的序列进行折叠分析,研究作者开始将IncRNA与肺癌患者中的特异的表达改变区分开来,这也表明在癌症患者中有大量的表达转移现象存在。
威尔康乃尔医学院的研究者们通过对十几个患有长期弥漫性大B细胞淋巴瘤的患者进行有目标的DNA测序来了解该疾病的复发机制以及免疫球蛋白重链在免疫相关的VDJ重排中所起的作用。
研究者对14例患者进行研究,对其刚诊断为该疾病及同一患者发生DLBCL复发时分别采样,进行深度测序来评估VDJ重排情况以及肿瘤的外显子序列。
研究者发现克隆进化导致了复发,这可能涉及早期肿瘤与复发肿瘤的基因类似,或者说复发的肿瘤是由早期肿瘤分化而来。
一个来自美国,英国和加拿大的团队发明了一种新的方法对乳癌进行分类,他们对1000例乳癌样本进行基因组和转录组数据分析,通过得到的拷贝数及基因表达情况进行分类。通过这种办法他们发现了10种亚型。研究者对另外的7544例乳癌患者进行转录组数据分析,可将其划分到具有复发风险的亚型或无复发风险的亚型,该分析可以为临床治疗提供一定的依据和线索。
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