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腾讯登录测序短序列拼接高速处理器：Edico公司新部署
| 导读 | Edico Genome位于圣地亚哥，是一家制造基因组数据处理专用集成电路的公司。该公司本周宣布推出其核心产品DRAGEN处理器。DRAGEN处理器是一个芯片，使用者可以将其置入服务器或测序仪器。它提供的计算软件可以将测序序列特异性映射到参考基因组，旨在将短序列拼接为完整基因组。 |
Edico Genome位于圣地亚哥，是一家制造基因组数据处理专用集成电路的公司。该公司本周宣布推出其核心产品DRAGEN处理器。DRAGEN处理器是一个芯片，使用者可以将其置入服务器或测序仪器。它提供的计算软件可以将测序序列特异性映射到参考基因组，旨在将短序列拼接为完整基因组。它要比使用通用型服务器速度快很多，它缩短了处理基因数据这一最耗时的步骤。
Edico今年九月首次销售，交易方是产前诊断公司Sequenom。当时，两家公司都没有透露DRAGEN芯片的使用效能。然而，Sequenom公司目前在位于圣地亚哥的美国人类遗传协会呈出了一个海报，展示了经DRAGEN处理器运行处理的来自超过一千名怀孕志愿者的血样检测结果。HiSeq 2000测序仪产生的两千万个短序列通过DRAGEN处理器和以Bowtie 2作为映射算法的一系列标准流程，得以映射到参考基因组，这个流程也就是Sequenom公司通过血样检测胎儿染色体病的工作流程。Sequenom报告称，DRAGEN处理器在9秒钟内即完成了整组序列的映射，大致比标准流程的速度快30倍，且对胎儿染色体异倍性的检测敏感性和特异性未见明显差异。
Edico公司还宣布，一台DRAGEN处理器现在已部署于圣地亚哥超级计算机中心，为全市的大学和非盈利实验室提供服务。（转化医学网360zhyx.com）
原文：New Data and Deployments from Edico Genome
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