Nat Commun：揭示引发食管癌的基因组突变

  近日，来自澳大利亚昆士兰大学的研究人员通过研究发现，意外的染色体突变或许会诱发食道癌的发生，相关研究发表于国际杂志Nature Communications上。研究者Nic Waddell表示，本文中我们对来自三所布里斯班医院的22名患食管腺癌(OAC)的进行了全基因组测序研究分析，结果显示，在32%的病人机体中都存在损伤DNA的突变事件，这就会引发基因组的高突变及重排，而且在其它的101名病人机体中我们也得到了类似的结果。
  研究者表示，所有病人机体肿瘤细胞的DNA都有损伤的“足迹”，而本文研究为揭示食道癌的发生机体提供了一定的思路；OAC是所有实体瘤中预后最差的一种疾病，仅有14%的患者生存期达到了5年。
  当人类机体细胞的染色体被打碎（破坏），被打碎的染色体就会以某种特殊方式重排，从而就使得特殊的基因处于开启或者关闭的状态；而这样的事件就容易引发癌症，引发细胞中一系列链式反应。尽管移除患者机体的肿瘤组织是最理想的选择，但往往在早期被诊断进行手术治疗的患者数量低于50%；如果未来研究可以鉴别出诱发癌症突变事件的机制，那么科学家们就可以采取一定的措施来抑制高风险患者机体肿瘤的发生了。
  研究者指出，OAC发生的高风险因子是一种名为巴雷特食管的潜在恶性病变，携带巴雷特食管的病人往往可以通过常规的恶性肿瘤监测发现，但是抽烟、肥胖等因子是引发巴雷特食管的风险因子，每9个男性OAC患者中就有8位患者机体存在巴雷特食管。过去20年诊断出的食管癌患者的数量已经翻倍了，而且其发病率在未来20年还将会再翻倍。（转化医学网360zhyx.com）
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Genomic catastrophes frequently arise in esophageal adenocarcinoma and drive tumorigenesis
Nature Communications doi:10.1038/ncomms6224
Katia Nones, Nicola Waddell, Nicci Wayte, Ann-Marie Patch, Peter Bailey, Felicity Newell, Oliver Holmes, J. Lynn Fink, Michael C. J. Quinn, Yue Hang Tang, Guy Lampe, Kelly Quek, Kelly A. Loffler, Suzanne Manning, Senel Idrisoglu, David Miller, Qinying Xu, Nick Waddell, Peter J. Wilson, Timothy J. C. Bruxner et al.
Oesophageal adenocarcinoma (EAC) incidence is rapidly increasing in Western countries. A better understanding of EAC underpins efforts to improve early detection and treatment outcomes. While large EAC exome sequencing efforts to date have found recurrent loss-of-function mutations, oncogenic driving events have been underrepresented. Here we use a combination of whole-genome sequencing (WGS) and single-nucleotide polymorphism-array profiling to show that genomic catastrophes are frequent in EAC, with almost a third (32%, n=40/123) undergoing chromothriptic events. WGS of 22 EAC cases show that catastrophes may lead to oncogene amplification through chromothripsis-derived double-minute chromosome formation (MYC and MDM2) or breakage-fusion-bridge (KRAS, MDM2 and RFC3). Telomere shortening is more prominent in EACs bearing localized complex rearrangements. Mutational signature analysis also confirms that extreme genomic instability in EAC can be driven by somatic BRCA2 mutations. These findings suggest that genomic catastrophes have a significant role in the malignant transformation of EAC.