NATURE:比较基因自然突变型和Kras驱动突变型肺癌
导读 | 近日,美国加州大学旧金山分校的海伦·迪勒家庭综合癌症中心的 Allan Balmain等人在NATURE上发表文章,对于基因变异和化学致癌物造成的肿瘤进行了基因水平上的比较。
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人类肿瘤的新一代测序已经精确的理解了在癌症开始和发展过程中基因突变的过程,但是主要的问题依然是相关的因子,这些因子能够诱导启动子突变,而这个过程在肿瘤的发生过程中是具有十分强烈的选择作用的。在这里,我们从非小细胞肺癌的三种小鼠模型中,对腺瘤的全部外显子进行了测序,而这些肺癌,都是由暴露在致癌物质(甲基-亚硝基脲(MNU,)和氨基甲酸乙酯)或者Kras(KrasLA2)对基因的活化诱导导致的。虽然MNU诱导的肿瘤携带有与Kras在KrasLA2(G12D)上完全相同的起始突变,MNU肿瘤平均有192个非同义单体核苷酸变异,而KrasLA2模型中,肿瘤只有6个非同义单核苷酸突变。
相比之下,KrasLA2肿瘤表现出了一个显著的非正倍性的,拷贝数改变具有较高的水平,这是与致癌物诱导的肿瘤相比较而言的,这表明,致癌物诱导的和基因工程模型改造形成的肿瘤的发展是通过不同的渠道实现的。野生型已经表明,在非小细胞肺癌中,Kras在小鼠模型中是作为抑制子存在的。我们证明了,脲烷诱导野生型小鼠中的肿瘤中大多数(94%)携带有Kras Q61R突变,然而Kras杂合子动物中大多数(92%)也携带有Kras Q61L突变,这表明,对于在启动过程中基因突变的选择,Kras种系中,其状态起了很大的作用。在致癌物诱导的肿瘤中,外显子组范围内的突变组在致癌物起始阶段具有压倒性的作用,而腺癌在CpG位点处获得了额外的C>T的突变。
这些数据提供了一个基础,即对人类肿瘤基因组测序的理解,其中已经确定了在两种肿瘤中,基于单核苷酸百衲衣和拷贝数改变的相对频率的分析提供了基础,并强调了理解复杂的突变谱致癌物模型,在人类癌症研究中的重要性。(转化医学网360zhyx.com)
NatureYear published:(2014)DOI:doi:10.1038/nature13898
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