Science:首次实现对人类蛋白质图谱信息的大型分析
导读 | 发表在国际著名杂志Science上的一篇研究论文中,来自瑞典皇家理工学院的研究者首次对人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas)进行了大量的分析,其中包括和癌症相关的蛋白质信息,存在于血液中的蛋白质数量等,这就为后期拓展开发靶向药物的市场提供了一定的帮助。 |
发表在国际著名杂志Science上的一篇研究论文中,来自瑞典皇家理工学院的研究者首次对人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas)进行了大量的分析,其中包括和癌症相关的蛋白质信息,存在于血液中的蛋白质数量等,这就为后期拓展开发靶向药物的市场提供了一定的帮助。
人类蛋白质图谱是在2014年6月由Knut and Alice Wallenberg基金发起建立的一项多国家的研究计划,其可以帮助绘制出开放的蛋白质图谱;基于该蛋白质数据库图谱中1300万带注释的图片,就可以绘制出人类机体所有器官和组织中蛋白质的分布情况,同时也可以揭示出受限于特定组织中的多种蛋白质,比如大脑、心脏和肝脏等。这种开放型的数据库就可以帮助研究人员开发新型的诊断策略和药物,同时为深入研究人类生物学机制提供一定的思路。
文章中,研究者对人类机体中大约2万个编码蛋白质的基因进行了分析,并且依据基因组、转录组、蛋白质组以及抗体的特性对这些蛋白质进行了分类。研究者Mathias Uhlén说道,本文的研究分析显示,大约有一半的编码蛋白质的基因是以一种普遍的方式来表达的,而且在被分析的组织中都可以发现这些蛋白质的踪迹。而仅有15%的基因是在一种或者多种器官及组织中的表达量比较高,包括那些组织特异性的蛋白,比如胰岛素和肌钙蛋白。
研究表明大约有3000种蛋白质是从细胞中分泌的,而且另外还有5500种蛋白质位于细胞的膜系统中。Uhlén说道,本文研究对于制药工业非常重要,我们发现当前70%被批准的靶向药物要么是分泌型蛋白,要么是膜结合蛋白。更有意思的是大约30%的蛋白靶点都可以在所分析的组织和器官中找到,这或许就可以帮助解释某些药物的副作用的发生。最后研究者指出,对人类蛋白质图谱的绘制在未来研究中或许可以帮助科学家们开发治疗疾病的新型靶向药物。(转化医学网360zhyx.com)
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Tissue-based map of the human proteome
Science DOI: 10.1126/science.1260419
Mathias Uhlén1,2,3,*, Linn Fagerberg1, Björn M. Hallström1,2, Cecilia Lindskog4, Per Oksvold1, Adil Mardinoglu5, Åsa Sivertsson1, Caroline Kampf4, Evelina Sjöstedt1,4, Anna Asplund4, IngMarie Olsson4, Karolina Edlund6, Emma Lundberg1, Sanjay Navani7, Cristina Al-Khalili Szigyarto2, Jacob Odeberg1, Dijana Djureinovic4, Jenny Ottosson Takanen2, Sophia Hober2, Tove Alm1, Per-Henrik Edqvist4, Holger Berling2, Hanna Tegel2, Jan Mulder8, Johan Rockberg2, Peter Nilsson1, Jochen M. Schwenk1, Marica Hamsten2, Kalle von Feilitzen1, Mattias Forsberg1, Lukas Persson1, Fredric Johansson1, Martin Zwahlen1, Gunnar von Heijne9, Jens Nielsen3,5, Fredrik Pontén4
Sequencing the human genome gave new insights into human biology and disease. However, the ultimate goal is to understand the dynamic expression of each of the approximately 2000 protein-coding genes and the function of each protein. Uhlén et al. now present a map of protein expression across 32 human tissues. They not only measured expression at an RNA level, but also used antibody profiling to precisely localize the corresponding proteins. An interactive website allows exploration of expression patterns across the human body.
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