科学家利用超级计算机揭秘引发癌症的遗传代码
导读 | 如今奥斯陆大学的癌症研究人员可以利用一种世界上最快的计算机来检测引发肠癌和前列腺癌的遗传代码,在癌细胞中从DNA转录至RNA的过程往往会携带有一些遗传错误,DNA转录过多就意味着会产生过多的RNA,从而产生过多的特殊类型的蛋白质。研究人员表示,他们可以通过对比引发癌症的疾病组织和健康组织的RNA来揭示其两者之间的差异性。 |
如今奥斯陆大学的癌症研究人员可以利用一种世界上最快的计算机来检测引发肠癌和前列腺癌的遗传代码,在癌细胞中从DNA转录至RNA的过程往往会携带有一些遗传错误,DNA转录过多就意味着会产生过多的RNA,从而产生过多的特殊类型的蛋白质。研究人员表示,他们可以通过对比引发癌症的疾病组织和健康组织的RNA来揭示其两者之间的差异性。
Rolf Skotheim教授表示,通过分析患者的就诊资料就可以帮我们追踪到针对每一位患者的不同疗法,而我们的研究重点则是鉴别引发肠癌和前列腺癌的基因,目前在挪威每年有4000例肠癌新发病例,10位患者中仅有6人可以生存超过5年,而每年前列腺癌则会影响5000名挪威患者,该病的存活率为十分之九。
为了鉴别出引发癌症的相关基因,研究者对比了健康细胞和肿瘤细胞的遗传物质,在癌细胞中问题往往发生在RNA转录的过程中,癌细胞中往往会出现过多的RNA这就意味着在此时的细胞中会产生过多的特殊类型的蛋白或者RNA的碱基对出现错误,而后者则是本文研究者的研究重点。
不同的细胞会以不同的方式在单一基因中结合核苷酸,癌细胞则可以产生一种在健康细胞中并不存在的结合方式,研究者的目的就是想去寻找基因中以及不同基因间的一些错误突变,融合基因往往在癌细胞中发生,而在前列腺癌患者中研究者仅在癌细胞中发现了融合性的基因,这些基因的融合就可以帮助研究者开发针对前列腺癌的检测手段。
在不同的癌症中会出现不同的RNA错误,因此后期研究者需要分析不同疾病中所涉及的RNA错误,随后研究者对比了550名前列腺癌患者机体的健康组织和疾病组织中的RNA相关信息,研究者说道,我们想寻找和前列腺癌相关的典型缺陷,这可以帮助我们更好地理解健康细胞向癌细胞是如何过渡的以及癌症的发生机制;一旦我们发现了癌症特异性的分子我们就可以以其作为生物标志物来进行相关疗法的开发;
在某些情况下生物标志物可以帮助我们来寻找癌症、确定癌症的严重性以及扩散风险,最后研究者表示,后期研究中我们将利用更多的新技术来结合当前强大的计算机工具帮助我们进行更为深入的研究,从而为开发治疗肠癌和前列腺癌的新型检测手段及靶向疗法提供新的研究方向,同时也为其它相关癌症的研究提供一定有价值的研究线索。(转化医学网360zhyx.com)
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Something goes wrong with the transcription from DNA to RNA in cancer cells. There is either too much transcription, which means that far too many RNA, and subsequently proteins of a specific type are formed, or the composition of base pairs in RNA is wrong. Researchers can gain a better understanding of the mechanisms that lead to cancer by comparing RNA in diseased and healthy tissue.
Cancer researchers must use one of the world's fastest computers to detect which versions of genes are only found in cancer cells. Every form of cancer, even every tumour, has its own distinct variants.
"This charting may help tailor the treatment to each patient," says Associate Professor Rolf Skotheim, who is affiliated with the Centre for Cancer Biomedicine and the Research Group for Biomedical Informatics at the University of Oslo, as well as the Department of Molecular Oncology at Radiumhospitalet, Oslo University Hospital.
His research group is working to identify the genes that cause bowel and prostate cancer, which are both common diseases. There are 4,000 new cases of bowel cancer in Norway every year. Only six out of ten patients survive the first five years. Prostate cancer affects 5,000 Norwegians every year. Nine out of ten survive.......
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