Nature：GWAS寻找对花生过敏的答案

  近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究论文中，来自约翰霍普金斯大学的研究人员通过对美国儿童进行全基因组关联性研究(GWAS)分析，鉴别出了其对花生过敏的特殊基因簇；Xiaobin Wang教授说道，我们一直猜测存在某些基因使得个体对花生过敏，而如今我们通过进行GWAS鉴别出了和花生过敏相关的遗传关联。
  在过去20年里食物引发的过敏率一直处于上升的阶段，如今食物过敏在美国影响着大约2%至10%的儿童健康，食物过敏已经成为了影响公共健康的主要风险因子，有时候甚至会引发致命性的机体损伤最终引发个体致死；而花生过敏就是其中一种主要的致命性食物过敏，其通常会使得个体终生持久过敏。
  当前除了在意外事故采用的紧急救助疗法之外并没有FDA批准用于预防或治疗花生过敏的疗法，而唯一的预防策略是避免食物（花生）诱发机体的反应，而诸如花生、鸡蛋及牛奶等食物（过敏原）在美国儿童的日常生活中会经常遇到，因此避免接触这些食品几乎不太现实。这项研究中研究人员对来自2759名参与者的DNA样本进行分析，其中包括1351名儿童及1444名儿童的父母，其中大部分的儿童都对食物过敏；研究者在人类基因组中扫描到了大约100万个遗传标志物，这就为寻找增加过敏反应风险的遗传基因提供了很好的线索。
  结果研究者在6号染色体上发现了一段包括HLA-DB和HLA-DR基因的遗传区域，该区域和花生过敏直接相关，研究者表示，HLA-DB和HLA-DQ基因区域或许主要和花生过敏风险相关。然而并不是携带上述基因突变的每个人都会发生花生过敏，研究人员想知道为什么，随后他们继续研究发现表观遗传学改变或许也发挥着重要作用，表观遗传改变，即甲基化集团吸附到DNA上，在不改变DNA代码的前提下改变基因的表达，DNA的甲基化水平可以调节个体对花生过敏的易感性。
  DNA甲基化并不像基因本身，其水平会改变机体对环境暴露的风险，而且这种改变可以潜在地逆转，通过鉴别出哪些环境因子改变DNA的甲基化从而使得机体对花生过敏，或许可以帮助研究人员开发有效预防和治疗花生过敏的新型疗法；最后研究者表示，希望有一天可以通过一种有效的方法来有效控制和预防对食物的过敏。（转化医学网360zhyx.com）
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Genome-wide association study identifies peanut allergy-specific loci and evidence of epigenetic mediation in US children
Nature Communications      doi:10.1038/ncomms7304
Xiumei Hong, Ke Hao, Christine Ladd-Acosta, Kasper D. Hansen, Hui-Ju Tsai, Xin Liu, Xin Xu, Timothy A. Thornton, Deanna Caruso, Corinne A. Keet, Yifei Sun, Guoying Wang, Wei Luo, Rajesh Kumar, Ramsay Fuleihan, Anne Marie Singh, Jennifer S. Kim, Rachel E. Story, Ruchi S. Gupta, Peisong Gao et al.
Food allergy (FA) affects 2%–10% of US children and is a growing clinical and public health problem. Here we conduct the first genome-wide association study of well-defined FA, including specific subtypes (peanut, milk and egg) in 2,759 US participants (1,315 children and 1,444 parents) from the Chicago Food Allergy Study, and identify peanut allergy (PA)-specific loci in the HLA-DR and -DQ gene region at 6p21.32, tagged by rs7192 (P=5.5 × 10−8) and rs9275596 (P=6.8 × 10−10), in 2,197 participants of European ancestry. We replicate these associations in an independent sample of European ancestry. These associations are further supported by meta-analyses across the discovery and replication samples. Both single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with differential DNA methylation levels at multiple CpG sites (P<5 × 10−8), and differential DNA methylation of the HLA-DQB1 and HLA-DRB1 genes partially mediate the identified SNP–PA associations. This study suggests that the HLA-DR and -DQ gene region probably poses significant genetic risk for PA.