Nat Comun:DNA研究或可揭示遗传突变引发人类疾病的机制
导读 | 近日,刊登于国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中,来自爱丁堡大学的研究人员通过研究开发了一种新技术,其可以鉴别基因被控制的方式,从而来帮助科学家们寻找诱发人类疾病的遗传错误。 |
近日,刊登于国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中,来自爱丁堡大学的研究人员通过研究开发了一种新技术,其可以鉴别基因被控制的方式,从而来帮助科学家们寻找诱发人类疾病的遗传错误。
这种技术主要针对DNA的部分区域,即增强子区域,该区域可以调节基因的活性并且指导对机体具有重要功能的蛋白质的合成;然而蛋白质产生的错误则会导致人类一系列疾病的发生。该技术可以帮助科学家们在增强子区域寻找引发疾病的突变来源,截止到目前为止,科学家们很难解释这些遗传错误发生的原因,而且增强子和其所控制的基因间的关联至今也并不清楚。
文章中研究者在单一的人类染色体上鉴别出了所有的增强子以及其所激活的基因,随后他们利用该技术检测斑马鱼,发现增强子可以利用一种类似的方式来控制基因的表达,而这种调节作用或许在所有动物机体中也发生。
单一的基因或许受到许多增强子的控制,这就使得基因的激活被更加精细地调节着,而这种基因活性的精细化调节对于机体发育以及维持正常的大脑功能非常重要;最后研究者David FitzPatrick表示,本文研究对于鉴别控制基因表达的增强子迈出了重要的一步,而这也可以帮助我们来解释不能进行蛋白质编码的基因组中遗传改变发生的原因。(转化医学网360zhyx.com)
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Long-range evolutionary constraints reveal cis-regulatory interactions on the human X chromosome
Nat Commun doi:10.1038/ncomms7904
Magali Naville, Minaka Ishibashi, Marco Ferg, Hemant Bengani, Silke Rinkwitz, Monika Krecsmarik, Thomas A. Hawkins, Stephen W. Wilson, Elizabeth Manning, Chandra S. R. Chilamakuri, David I. Wilson, Alexandra Louis, F. Lucy Raymond, Sepand Rastegar, Uwe Strähle, Boris Lenhard, Laure Bally-Cuif, Veronica van Heyningen, David R. FitzPatrick, Thomas S. Becker et al.
Enhancers can regulate the transcription of genes over long genomic distances. This is thought to lead to selection against genomic rearrangements within such regions that may disrupt this functional linkage. Here we test this concept experimentally using the human X chromosome. We describe a scoring method to identify evolutionary maintenance of linkage between conserved noncoding elements and neighbouring genes. Chromatin marks associated with enhancer function are strongly correlated with this linkage score. We test >1,000 putative enhancers by transgenesis assays in zebrafish to ascertain the identity of the target gene. The majority of active enhancers drive a transgenic expression in a pattern consistent with the known expression of a linked gene. These results show that evolutionary maintenance of linkage is a reliable predictor of an enhancer’s function, and provide new information to discover the genetic basis of diseases caused by the mis-regulation of gene expression.
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