IBM的Watson系统开始用于癌症基因组学分析
导读 | 华盛顿大学基因组研究所与IBM合作使用其被称为计算机巨头的Watson人工智能系统,他们将患者的基因数据与癌基因数据库及关于癌症基因组学发表的每一篇科学论文进行比较。一个专家小组需要花费几个小时甚至几天才能完成的任务,Watson系统可以在几分钟内完成。 |
Lukas Wartman博士在对抗癌症的基因战争上从零开始。圣路易斯华盛顿大学癌症基因组学的副主任开发了他自己的急性淋巴细胞性白血病。
制定治疗方案时,他的同事看着他的DNA和RNA(将DNA转变成蛋白质的化学信使),试图给他第二次机会。这是一个需要几个月时间的艰巨的过程,并需要一些研究人员的专用脑力,但他们做的很好。现在,Wartman博士正在试图努力使DNA测序适用于更多的癌症患者。华盛顿大学基因组研究所是美国14所大型癌症中心与IBM合作使用被称为计算机巨头的Watson人工智能系统的中心之一,他们将患者的基因数据与癌基因数据库及关于癌症基因组学发表的每一篇科学论文进行比较。一个专家小组需要花费几个小时甚至几天才能完成的任务,Wartman系统可以在几分钟内完成。
Wartman指出:“我不知道另一个允许尽可能多权力的平台,现在我也没看到一个在发展。”
14所中心的努力是将Watson系统应用到医疗保健行业的一个盛大紧逼的部分。一个月前他们宣布分别与Medtronic和Johnson & Johnson公司合作,苹果公司在同一时间推出了一个新的包括2000人的医药Watson业务部。然后,上周他们宣布与苹果和日本邮政合作,一个旨在提高老年人生活的保险公司。今天的发布指出,Watson系统进入一个拥挤的包括Foundation Medicine、NantHealth和Flatiron Health公司在内的DNA测序和分析市场。
而由亿万富翁Patrick Soon-Shiong建立的企业NantHealth,提出建设一个产品来测序患者的DNA和蛋白质,以及进行数据分析和与患者的医疗记录相配合。IBM将更加专注于为这些已经测序了癌症患者基因的机构提供分析。Harvey说这些机构中有很多都要支付订阅费用,虽然每笔交易的结构取决于他们何时签署协议。
参与中心包括:芝加哥Ann & Robert H Lurie儿童医院、BC癌症机构、希望之城、Cleveland诊所、杜克癌症研究所、内布拉斯加州奥马哈的Fred & Pamela巴菲特癌症中心、圣路易斯华盛顿大学的McDonnell基因组研究所、纽约基因组中心、Sanford Health、勘萨斯大学肿瘤中心、北卡罗来那大学综合癌症中心、南加利福尼亚大学应用分子医学中心、华盛顿大学医学中心、耶鲁癌症中心。
我们希望Watson系统能够取代决定给予哪些基于遗传信息的药物的方式:即一个称之为“肿瘤委员会”的医生委员会,他们发现突变后试着打电话。
北卡罗来那大学综合癌症中心的主任Norman Sharpless认为:“分子肿瘤委员会报告结果的方式即不能扩展也不完美,“它很容易出错,它不起作用时我们将做的更多。这时将需要Watson系统或像Watson之类的工具。”
Sharpless最初告诉使用Watson系统的同事“那只是挑战使用计算机,它将不能解决癌症问题,”仍然希望获得更多的证据来支持他的怀疑。他说,第一步要观察正在UNC接受分析的患者(所有人都同意进行临床试验)并观察肿瘤委员会和Watson会多久同意。当然,不会告诉任何人谁是正确的-Watson系统在挑选基于基因的药物方面比人更好或更糟。
IBM公司副总裁Harvey说,其它机构已经要求进行这样的研究,基于各种机构签署了知情同意书的基础上,数据将被匿名化。在一天结束时,他还说这些数据属于患者。
但仍然有一个很大问题,通过少DNA测序来挑选药物能帮助患者多少。非常戏剧性的是,患者得救了,但数量往往很少。Watson系统仍需要进一步证实。风险是这项技术在未进行适当的研究的情况下将被采用。令人印象深刻的是IBM公司已经宣布了与很多机构的交易,Wartman博士的意见,但Watson仍然是医疗保健方面一项未经证实的技术。
Wartman博士自身的情况很明显,甚至当治疗有效时,它也不是一个完美的解决方案。他接受了第二次骨髓移植,发展了他的新骨髓和身体相互攻击的移植物抗宿主病。他说:“这些问题的大部分现在是可控的,我是全职工作,但我绝对不是100%。”
(转化医学网360zhyx.com)
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