甲基化研究方法的革新-罗氏NimbleGen SeqCap Epi产品在中国上市
导读 | 罗氏NimbleGen公司 最新上市的SeqCap Epi基因组DNA甲基化序列富集产品,结合二代测序,可以进行在单碱基分辨率的样品甲基化分析。 |
罗氏NimbleGen公司 最新上市的SeqCap Epi基因组DNA甲基化序列富集产品,结合二代测序,可以进行在单碱基分辨率的样品甲基化分析。该产品系列包括:固定内容的、人类全基因组水平的可甲基化位点的DNA片段富集方案;以及,适合于各种不同应用的由客户自选区域的目标序列富集产品。该产品系列可以为表观遗传研究人员提供全新的研究工具,相比现有其他技术,可以在更大DNA序列广度,更高测序深度和更大样本量水平下进行DNA甲基化研究。
图:NimbleGen SeqCap Epi甲基化片段富集实验流程,先“亚硝酸盐处理”后“捕获测序”、正负双链同时捕获,提升测序数据有用性及结果正确性。实验仅需1微克 DNA样本,全基因组水平分析仅需1/4 HiSeq 200测序lane测序量。
DNA甲基化已被证明能在多种生物过程中起到重要作用,包括基因表达、剂量补偿(dosage compensation)、基因组稳态等等。在最近几年,其在癌症和许多其他疾病相关领域中,已越来越受到关注。而目前的研究工具,在进行全基因组或基因组区段研究时,或是效率有限、价格昂贵,或是存在实验偏好。NimbleGen依托其探针设计和生产技术的优势,通过与一些表观遗传学研究专家的合作,开发了SeqCap Epi甲基化片段富集产品,旨在大幅研究提高效率和准确性,帮助科研人员进行广泛的发现性应用,以及定向性的DNA甲基化研究。
阿尔伯特爱因斯坦医学院表观遗传学中心主任John Greally博士,是NimbleGen产品开发过程中的重要合作者之一,他介绍说:“NimbleGen的技术可以帮助克服一些在DNA甲基化分析中的难点。 利用SeqCap Epi定制设计,使我们能够更有针对性地、对我们正在研究的细胞系中的甲基化相关区域进行研究,充分利用来自ENCODE及Roadmap Project中的基因表达调控网络信息。这使我们能够充分利用测序数据,超越了多年来这个领域一直使用的、缺乏灵活性的全基因组水平分析方式。 ”
表观遗传修饰在农业应用方面,也影响植物和动物性状发展。明尼苏达大学微生物和植物基因组学研究所所长Nathan Springer博士是NimbleGen另一位重要合作者,说到 :“在人类基因研究以外的定向亚硫酸氢盐测序中,NimbleGen公司的技术具有独特的优势,它可显著提高农业基因组学研究的效率和降低实验成本。 ”
罗氏NimbleGen 公司总裁Rebecca Selzer博士说: “我们非常高兴能够通过与表观遗传学研究领域领先的科学家合作,推出这个新的产品系列,为表观遗传学研究提供新工具。这将是另一个成功,即利用NimbleGen的技术帮助科研人员开发更好的研究方法、获得更有意义的发现。 ”
更多产品信息,请浏览官方网页
http://www.nimblegen.com/products/seqcap/epi-system/index.html
技术服务热线:800 820 0577
(转化医学网360zhyx.com)
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