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腾讯登录SeqCap RNA探针组非编码RNA，融合基因都能捕获啦！
| 导读 | 转录组测序(RNA-Seq)是了解一个物种或特定细胞在某一功能状态下所有基因表达的直接做法，但是mRNA-Seq往往需要进行rRNA去除或者polyA尾富集实验步骤；目前最热门的lncRNA-Seq则往往需要超过10Gb以上的测序量；全转录组中还有大量未知功能的RNA值得探索和研究。 |
转录组测序(RNA-Seq)是了解一个物种或特定细胞在某一功能状态下所有基因表达的直接做法，但是mRNA-Seq往往需要进行rRNA去除或者polyA尾富集实验步骤；目前最热门的lncRNA-Seq则往往需要超过10Gb以上的测序量；全转录组中还有大量未知功能的RNA值得探索和研究。NimbleGen于2015年推出RNA系列捕获产品，通过对探针的设计可以准确捕获所需区域RNA序列，配合control序列仅需RNA-Seq 1/20的测序量即可实现对转录本的准确定量；其优化的实验步骤无需rRNA去除或polyA尾富集等操作，进一步减少实验成本，为您的转录组研究提供新的有利工具。
常规的RNA-seq所遇到的最大挑战来自于细胞内那些数量较少但表达量非常高的转录本。如下图如示，细胞内仅占1%数量的基因由于表达量高，占用了近70%的测序数据，导致那些数量超过一半的低表达丰度的基因难以被直接测得，或是测序量极少而难以加以分析。
NimbleGen SeqCap RNA捕获系统正可以解决常规RNA-seq所面临的问题。通过对转录本序列的富集，不仅可以保持对转录本的常规定量，更可以观察基因融合、低丰度转录本的发生和序列变异情况，帮您更好地研究细胞内所有转录组序列及其生物学功能。
SeqCap RNA捕获的优势:
1、发现更多可信的转录本:
转录组序列富集可以定向提高测序深度，帮您鉴定稀有转录本
上图中，对肾的总RNA（图A）和肝的总RNA（图B）用标准的RNA-Seq（黑色）和 SeqCap lncRNA（红色）捕获后测序两种方法来检测lncRNA（长非编码RNA）转录本，x轴为reads数量， y轴为发现的isoform个数
2、体验高效率:
优化实验流程，在相同测序量下可允许同时检测更多样本
可捕获更广范围的RNA，支持低至10ng的总RNA建库起始量
cDNA文库构建可保留转录本方向信息，辅助后续分析
无需rRNA去除步骤或polyA尾富集，降低实验成本
支持复杂样本的混合捕获，提高工作效率，进一步减少成本
对GC含量高或低的转录本保持稳定的检测能力
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RNA捕获产品名称 |
探针设计说明 |
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SeqCap lncRNA Enrichment Kit 包含超过3万种人类lncRNA捕获探针, 区域大小为17Mb |
07277270001 4反应包装 07277288001 48反应包装 07277296001 384反应包装 |
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SeqCap RNA Choice Enrichment Kit 支持人基因组中小于7Mb区域RNA靶向定制探针设计 可通过NimbleDesign (https://design.nimblegen.com/)在线设计 |
07277300001 12反应包装 07279078001 48反应包装 07279086001 384反应包装 |
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SeqCap RNA Choice XL Enrichment Kit 支持人基因组7-100Mb区域RNA靶向定制探针设计 可通过NimbleDesign (https://design.nimblegen.com/)在线设计 |
07279183001 12反应包装 07279191001 48反应包装 07279205001 384反应包装 |
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SeqCap RNA Developer Enrichment Kit 支持任意物种0-200Mb区域RNA靶向定制探针设计 可通过人工线下设计 |
07279213001 12反应包装 07279221001 48反应包装 07279230001 384反应包装 |
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KAPA Standard RNA-seq Library Preparation Kit 罗氏NimbleGen与KAPA合作共同推出cDNA测序建库试剂盒，支持24与96反应包装 |
07277261001 24反应包装 07277253001 96反应包装 |
（转化医学网360zhyx.com）
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