NIPT全球开展概况
导读 | 基于高通量测序技术的无创DNA产前检测(NIPT)自2011年在全球范围内开展以来,受到临床的高度认可,并带领高通量测序市场持续升温。NIPT技术不仅开启了以全基因组测序为基础的诊疗时代,同时为产前遗传病防治领域带来前所未有的发展机遇。 |
基于高通量测序技术的无创DNA产前检测(NIPT)自2011年在全球范围内开展以来,受到临床的高度认可,并带领高通量测序市场持续升温。NIPT技术不仅开启了以全基因组测序为基础的诊疗时代,同时为产前遗传病防治领域带来前所未有的发展机遇。随着NIPT技术的逐渐落地实施,我们有必要对国内外开展NIPT的情况重新做一个梳理,以作为未来发展之参考。
国外NIPT发展情况:在欧美地区,最早从事NIPT业务的有Sequenom, Verinata Health (2013年被Illumina收购), Ariosa Diagnostics(2014年被罗氏收购)、Natera和LifeCodexx。其中前四家公司均位于美国,LifeCodexx则位于欧洲。 这几家公司上市时间基本山集中于2011年至2012年,均以Illumina HiSeq系列的基因测序仪为检测平台。但在检测技术上各自有别,譬如Sequenom, Verinata,LifeCodexx以高通量全基因组测序为主要技术路线,而Ariosa 和Natera则主要基于捕获的靶向区域信息对染色体倍性进行分析。尽管技术路线不尽相同,但准确性均得到了可靠的验证,或者说,从技术层面上,NIPT的有效性已经得到广泛的验证。随着NIPT市场的不断扩大,吸引了越来越多分子诊断公司的加入,譬如英国的Premaitha Health,就已经将其NIPT业务已经在欧洲、中东、非洲等地开展,并进一步觊觎亚洲市场。
欧美地区在临床诊疗项目的监管方面与国内大有不同,CAP(美国病理协会)和CLIA(临床实验室改进修正案)的绿色通道让在美国从事NIPT的四家公司在临床应用上得以迅速铺展,LifeCodexx则凭借IVDD(体外诊断指令)认证获得合法开展检测的权利。或许真正让这些外国公司头疼的还是专利之争。Sequenom与Ariosa的知识产权纷争持续三年之久、Illumina与Ariosa的专利案以美国国家专利局撤销Illumina所持的13项专利而告终,最近,Illumina又因知识产权问题与Premaitha Health对薄公堂。当然,也有不是所有的争议都一定有胜负之分,去年年底Illumina就与Sequenom达成知识产权联营的协议。
而在临床应用与指导方面,欧美地区的各大协会显然反应是非常迅速的。NIPT在全球刚一兴起,美国的相关专业协会就纷纷给出指导意见,如国际产前诊断协会(ISPD)、美国妇产科学会(ACOG)与美国母胎医学会(SMFM)、美国国家遗传咨询师协会(NSGC)、美国医学遗传学及基因组学学会(ACMG)和国际妇产科超声协会(ISUOG)等等,分别针对适用人群、遗传咨询、临床标准、及与超声结果联合使用等方面发布指南,为NIPT在临床的有效应用提供指导。此外,包括加拿大、日本、意大利在内的多个国家也相继发表了针对无创检测的指导意见。NIPT以极低的假阳性率和假阴性率,获得世界范围内行业协会的一致肯定。截止2014年年底,全球接受NIPT检测的人数已经超过70万。
我国NIPT市场状况
2010年,北京贝瑞和康和深圳华大基因最早在我国开始了NIPT的实践工作。随后,越来越多的公司加入进来。技术路线基本都是采用全基因组测序的方法。目前,获得政府CFDA市场准入的只有贝瑞和康、华大基因、达安基因和博奥基因四家。其中,除了贝瑞和康使用的Illumina的检测平台,其余三家的检测技术均建立在Life Proton的测序平台之上。这或许与贝瑞和康与Illumina 签署的“合作协议”有关。
在专利方面,贝瑞和康2014年宣布与NIPT技术创始人--香港中文大学的Dennis Lo达成合作,在香港创立Xcelom公司。而贝瑞和康同时获得Dennis Lo在NIPT方面的全部知识产权。除此之外,国内少有关于专利异议的新闻。而在监管方面,NIPT行业则刚刚经历了极不平凡的一年。我国缺乏类似美国的CLIA实验室管理体系,因此如何在合理合法的范围内开展NIPT成了整个行业需要面对的问题。2014年2月,卫计委叫停了以NIPT项目为代表的临床基因检测。经过一年多的调整摸索、专家讨论、试点申报和室间质评。终于在2015年年初出台了NIPT试点单位名单以及试点期间的临床规范,将整个行业引向一个更规范的发展轨道。同时,在去年年底发布的室间质评数据结果显示:所有参加质评的实验室检测结果均达到标准。这无疑为我国NIPT事业的发展增添极大信心。
2012年国际产前检测领域最权威的第十六届ISPD会议在美国迈阿密举行,会议上来自中国的华大基因向全世界行业专家汇报了自开展检测以来的大规模临床实践数据;2013年葡萄牙里斯本第十七届ISPD会议,来自中国的企业贝瑞和康被邀请作为主会的第一位发言人,大会主席介绍时称:“全球第一例商业样本来自这家公司”;2014年底十八届ISPD大会上,贝瑞和康公布了无创单基因疾病检测的新方法--cSMART技术,轰动整个行业。事实证明,中国的NIPT技术是走在世界前列的。但由于种种原因,我们国家至今还没有任何一个专业协会出台一个成型的NIPT临床应用指南,这一点或许是NIPT需要解决的当务之急。
无创DNA产前检测的临床可靠性已经毋庸置疑,科学家更为关注的是NIPT下一步的发展,是无创微缺失微重复?亦或是无创单基因病检测?不久前,全球领先的NIPT服务商Sequnom公布了全新产品MaterniT21,这款产品在检测胎儿染色体非整倍体的同时,还可以检测孕妇患癌情况。事实上,这并不是领域内的新闻,去年香港中文大学的卢煜明教授就发表了基于高通量测序技术发现红斑蓝疮患者血液DNA异常的文章。而几乎在同时,贝瑞和康发表的cSMART技术也宣称,该技术除了可以检测胎儿单基因病以外,更重要的是可以准确的应用于癌症患者的基因变异检测,为个体化诊疗提供依据。
因此,NIPT技术未来的发展或将超出我们目前所能想象的范畴。如果说,临床医学将迎来以精准医疗为基础的全新时代,那么NIPT一定是这个时代的先锋。(转化医学网360zhyx.com)
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