通过NIPT发现了新的霍奇金淋巴瘤血液检测方法

  最近《Lancet Haematology》出版了一个概念性研究结果，这个实验中，研究人员证明，他们能够从被诊断为早期或者晚期的患者中的血液中的无细胞DNA中，发现霍奇金淋巴瘤细胞的基因组失衡。

  非侵入性测定法，主要依赖于下一代鸟枪测序的ccfDNA，其可以用于鉴定对治疗反应不明显的患者，并提供以后总有价值的，可以使用的监控治疗效果的手段。
  该研究的想法来源于在鲁汶大学医学院进行的一次NIPT实验，在该实验中进行了全基因组拷贝数异常的检测，在进一步的实验中，从同一个女性患者的第二份血液样品中，该结果得到了证实。最终，其被诊断患有早期的霍奇金淋巴瘤。
  为了确定该妇女的不正常基因组谱是否与癌症相关，研究人员对其肿瘤进行了活检，该组织包括了恶性细胞，即所谓的霍奇金/里德-斯特恩伯格（HRS）细胞，这是通过荧光原位杂交证实的，之后发现，他们的DNA与血液中的异常DNA具有一些相同的地方。
  这一发现表明，血液中的ccfDNA中的一部分是由HRS细胞衍生的，这是一个令人惊讶的发现。
  根据研究的主要作者，鲁汶大学的人类遗传学系的教授Peter Vandenberghe的观点，活检的霍奇金淋巴瘤只有一小部分，如淋巴结重大部分是HRS细胞，而这个区域是由非恶性细胞包围的。
  “当你想要分析这些HRS细胞时，外围的细胞将会成为主要的技术障碍和困难，”他说。“他们与其他细胞混合在一起，如果你想分析一下HRS细胞基因组的变化情况，你需要先净化它们，但是这是费时的，而且具有技术挑战性，最关键是很难。”
  因为有些HRS细胞具有相同的基因组特征，这可以在血液检测中被发现，这是可以实现，但是并不是十分困难的，这种方法有望成为一种替代HRS细胞分析的技术。
  为了证实他们的发现，研究人员对另外9例患者进行了ccfDNA测序，这些人中，大多数都是近期在医院使用Illumina HiSeq 2500的快速运行模式诊断患有霍奇金淋巴瘤的。在这些人中，7个人是早期病例，2个是晚期病例。
  在8名患者中，他们发现了异常的DNA图谱。唯一的阴性结果来源于一名早期患者，这可能是因为该病还没有广泛的分布于该患者体内。
  他们通过FISH对患者的HRS细胞进行活检，证明了他们的结果，他们观察到一系列的基因区域，这些区域中反复的出现DNA谱的异常。他们发现，“在ccfDNA的基因组失衡和在所有FISH实验相对应的染色体区域的拷贝数改变之间，存在着显著的整体一致性。”
  此外，研究人员在患者开始化疗和放疗后，连续几个星期采集血样并进行了分析，发现在大多数情况下，他们的ccfDNA图谱恢复到正常情况都非常快。
  根据Vandenberghe的观点，对于霍奇金淋巴瘤系那个关的基因组异常的血液检测，是有希望应用于临床领域的，特别是在预测治疗反应和治疗后对疾病的检测方面。
  霍奇金淋巴瘤占所有淋巴瘤的30%，并且是青少年和年轻成年人中最常见的淋巴瘤类型。该疾病的患者进行化疗后大约有90%的治愈率，但是也有10~15%的一线治疗会失败。“如果我们能在疾病的前期将可能失败的患者鉴定出来，这将是十分有益的，这样我们就能够不让他们暴露在不是十分有效的化疗中。” Vandenberghe这样说。
  在一线治疗中部分患者观察到了类似的情况，这将会导致之后的毒副作用，包括导致其他类型的癌症。“如果你想减少治疗，让我们了解到，什么样的病人能够在较少的治疗条件下痊愈是十分重要的，” Vandenberghe说。“但是这在现在是不可能的。”
  在治疗后，ccfDNA谱迅速恢复正常的事实表明，其可以用于检测治疗反应，而这现在主要是通过PET/CT成像进行的。“成像是一种非常丰富的技术，但他也有一定的风险-会让患者暴露在辐射中，” Vandenberghe说。“因此，这种新颖的血液采样方法具有很大的潜力。”
  然而，像PET/CT扫描一样，基于学测的测序分析，依赖于基因组不同区域的测序数据，而且也不能检测到点突变，因此是不能检测疾病残留的微笑痕迹的，因为它是不够敏感的。
  而其他更敏感的技术，如数字PCR，可以检测到数量稀少的血液中HRS细胞衍生自由DNA，因此更合适寻找疾病残留的微小痕迹。
  展望未来，Vandenberghe和他的团队计划继续他们的血液测试，其将对至少100例霍奇金淋巴瘤患者进行检测，这将成为临床实验的一部分。收集患者血液样品的目的在于检测和中期以及治疗结束时候进行评估，这将通过与他们疾病相关的基因组图谱进行比较得出。“我们希望能够建立这种新的技术，这种技术是敏感的，能够在早期，甚至更早的阶段检测疾病，并且确定那些图谱对于治疗是有积极应答的，那些图谱对于治疗反应是不太明显的。我们也希望看到在治疗后异常图谱消失是有多快，以及将其与PET/CT的结果进行一定的比较。”
  此外，研究人员计划探索除了鸟枪法之外的测序技术来分析ccfDNA，包括PCR，数字PCR，一把靶向测序，这些将有助于他们去寻找复发性的霍奇金淋巴瘤的突变和测量该疾病的最小残留水平。
  “该技术最大的好处是血液样品的获得是十分方便的，这比回到淋巴结进行活检更简单，也比从这些活检组织中分离出HRS细胞简单，” Vandenberghe说。“我们可以在很多情况下进行，因为该技术在并不需要太多的技术或者实验室条件，反而一些旧的方法只能在具有实验室背景的情况下才能进行，并且老的方法不能在14天，甚至1周内得出结果，而新的方法可以。”（转化医学网360zhyx.com）