PNAS发表超级细菌基因组图谱
导读 | 最近,由墨尔本大学带领的一个国际科学家小组,解码了肺炎克雷伯菌(KP)基因组,这种细菌存在于发展中国家或发达国家的医院里。相关研究结果发表在六月二十三日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)。
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最近,由墨尔本大学带领的一个国际科学家小组,解码了肺炎克雷伯菌(KP)基因组,这种细菌存在于发展中国家或发达国家的医院里。相关研究结果发表在六月二十三日的《美国国家科学院院刊》(PNAS),涉及世界各地 37个研究机构和来自六个国家的300株细菌样本。
本研究对这种细菌性病原体进行了有史以来规模最大的基因解码,使科学家们获得有价值的数据,走在KP演化的前面,因为越来越担心出现较高传染性和抗生素耐药性的菌株。
最近在维多利亚出现的KP耐药性菌株,称为KPC,十多年来在美国和欧洲引起了重大问题。在美国南部、非洲和亚洲有过爆发,强毒菌株引起了当地人口的严重感染。
直到最近,科学界对这种细菌还没有多少信息。这是第一项大规模的研究,利用基因组技术来了解这种生物是什么,以及它能够做什么。
由于不同的细菌菌株可能交换遗传信息,所以研究人员担心,抗生素耐药性性基因可能就会很快出现在更多的传染性肺炎克雷伯菌菌株中,从而创建一种不可治愈的、高传染性的菌群。
这篇论文的共同作者、墨尔本大学Doherty研究所教授Dick Strugnell说,本研究为我们了解和跟踪细菌的演化,甚至预测其耐药性,提供了一个重要的出发点。
Strugnell教授表示:“KP常见于周围环境中,并可能获得耐药性基因,并在医院安顿下来,然后成为一个主要的健康问题。该细菌作为一个不同的种群存在,其中一些可以引起人类严重疾病。细菌已经进化出一种厚粘糖的‘外衣’,可防止它干燥。这种‘外衣’有助于细菌生物被膜的形成,用传统的清洗方法难以将其从医院去除。”
本文第一作者、墨尔本大学Bio21研究所Kathryn Holt博士称,在大多数情况下,KP会感染虚弱的疾病患者,但有真正的危险在于,细菌会进化成对健康者的重大威胁。她说:“几乎所有的肺炎克雷伯菌都能感染已生病住院的患者,但很少有数菌株毒力足以影响一个健康的人。到目前为止,我们一直非常幸运的是,大多数的抗生素耐药菌株对人体没有剧毒。不幸的是,肺炎克雷伯菌菌株非常善于交换抗生素耐药性编码基因,所以它们可能在未来演化成严重威胁人类健康的细菌。”
“细菌很善于通过获取新基因而发生演化。我们研究了300个不同的菌株,我们研究的每一个菌株是全新的,所以这告诉你它存在很高的多样性,我们真的无法掌控。”
Holt博士称,政府需要投资,来了解关于KP的更多信息,因为它很可能会变成致命的、抗生素耐药性的细菌,并对健康人造成威胁。“建立对这种特殊细菌的认识,是至关重要的。超级细菌问题不只是MRSA。我们需要担心的细菌类型有很多,KP是其中一个大问题。”
在维多利亚,可能产生不良影响的老一代药物,已被用来作为最后的防线,应对当前的KPC爆发。然而,在希腊和意大利的KPC细菌已经对这种药物发展出耐药性。
这项成果,为进一步研究这些细菌如何适应新的环境以及如何变得更加多样化,提供了基础。本研究结果对KP感染预防(而不是治疗)疫苗的设计,也是非常有用的。
(转化医学网360zhyx.com)
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