美国国立卫生院或资助研究癌症基因组学云项目的测试

  近日，来自美国国立卫生研究院宣布了一些资助项目的计划，这些计划将会有效利用国立癌症研究所的癌症基因组云领航（Cancer Genomics Cloud Pilots）项目来帮助评估和开发一些数据管理基础措施。
  从传统意义上来讲，基因组数据分析包括将下载的数据存储于多个位置，尝试协调这些数据，随后在当地的硬件上对数据进行计算分析，NIH专家这样说道。然而，来源于涉及新一代测序技术的大型项目的生物医学数据的增加使得这种模型变得并不在适用。
  为了有效解决这个问题，2014年国立癌症研究所就开始了一个项目来构建一个基因组数据存储库的网络，这样一来该网路就可以被许多癌症研究团体安全使用并且更容易获取更多的研究数据了。与此同时国家癌症研究所也向博德研究所（Broad Institute）、系统生物学研究所及Seven Bridges Genomics授予了合同，来发展基础设施，同时也提供了全套的工具帮助对分子数据进行获取、开发以及分析。
  虽然他们都是通过商业化的云服务得以实现的，但所谓的癌症基因组云领航项目仍让具有不同的系统设计、数据显示以及资源分析等等。研究者计划在2016年之前发布这种云领航的项目，NIH表示，目前我们正在寻求多家云领航资源库的建议来帮助我们评估该项目的实用性，同时也引导国立癌症研究所未来的计划来构建基因组数据的计算基础设施。
  一些成功地方案必须包括较多的云项目来作为研究目标的一部分，而据NIH消息，方案或许会包括，在一种或多种云项目环境中开启新型的分析工具来进行新型的研究；将本地产生的遗传数据上载至云领航环境中并且联合癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)数据库中的数据进行分析，并且利用用户提供的工具或云项目来对癌症基因组图谱的数据进行处理和分析。
  当前需要对云项目进行明显的改变来满足研究目的，而这样的计划或许暂时不会被接受，另外NIH表示，他们预计接受这些应用程序或许将会获得4万美元的直接成本，而这些花费不得超过母公司的直接成本，预计这项应用程序将会在10月18日提交。（转化医学网360zhyx.com）
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NIH to Fund Research Testing Cancer Genomics Cloud Pilots

NEW YORK (GenomeWeb) – The National Institutes of Health has announced a funding opportunity for research projects that will take advantage of the National Cancer Institute's Cancer Genomics Cloud Pilots in order to help evaluate and further develop the data-management infrastructures.

Traditionally, genomic data analysis involves downloading data stored at multiple locations, attempting to harmonize those data, and then computing them on local hardware, NIH said. However, the increase in biomedical data stemming from large-scale programs involving next-generation sequencing technology has made this model untenable.

To address this issue, in 2014 NCI kicked off an initiative to build a network of genomic data repositories that can be securely and easily accessed by the broader cancer research community.

As part of that effort, NCI awarded contracts to the Broad Institute, the Institute for Systems Biology, and Seven Bridges Genomics to develop infrastructures and sets of tools for accessing, exploring, and analyzing molecular data. Although they are all implemented through a commercial cloud provider, these so-called Cancer Genomics Cloud Pilots have distinct system designs, data presentations, and analysis resources, according to NCI.....