基因检测技术下的物种差异-分毫毕现
导读 | 来自美国、俄罗斯等地的研究人员通过比较非洲和欧洲金豺(golden jackals)的基因组、线粒体和微卫星序列数据,发现这两种看着很相似的动物其实属于不同的物种。他们于7月30日在《Current Biology》上发表了这一成果。 |
文章的共同第一作者,美国史密森尼生物保护研究所及俄罗斯圣彼得堡大学的Klaus-Peter Koepfli表示:“非洲和欧洲的豺不仅不同,它们甚至不能算是近亲,因为代表不同的物种。”
豺素来都臭名昭著,是种狡猾而诡诈的食腐动物,不过在古埃及人的眼中却不同。阿努比斯(Anubis)被埃及人认为是外形幻化成豺的死神,也是墓地的守护神。由于豺经常在墓地出现,因此古埃及人相信是阿努比斯在护佑死者。
非洲和欧洲的金豺最初被认为属于同一物种,因为它们在颜色、颅骨和牙齿的形状以及其他身体特征上十分相似。2011和2012年发表在《PLOS One》上的线粒体DNA研究质疑了这一分类,暗示至少一部分的非洲金豺可能要落入灰狼的亚种。
在这项研究中,Koepfli及其同事开始根据一些不同的遗传标记,绘制系统进化树。在一棵包含了100多种非洲金豺、欧洲金豺和灰狼的细胞色素c序列的进化树中,非洲金豺落入灰狼的谱系,就在灰狼与欧亚金豺的祖先分开之后。利用其他的线粒体或核DNA标记基因,研究人员也看到了相似的关系。
“尽管系统进化的细节因核或线粒体标记的使用而有所不同,但金豺的总体情况是明确的,”Koepfli解释道。“线粒体DNA和核DNA的系统发育有很大的不同,不过它们都一致表明,两个金豺谱系绝对不是对方的近亲。”
相反,数据表明欧亚-非洲金豺在100多万年前分开,随后非洲金豺和狼-狗-郊狼谱系分开。
研究人员利用灰狼、郊狼和金豺的性染色体序列,以及通过比较三种欧亚狼、以色列金豺和新测序的肯尼亚金豺的全基因组序列而发现的770万个SNP,获得了更多的关系。例如,在非洲金豺的物种中,研究小组发现肯尼亚的动物形成了一个遗传聚类,不同于阿尔及利亚、摩洛哥、毛里塔尼亚和塞内加尔的动物。
Koepfli指出,未来还需要更多的研究来评估每个物种的遗传可变性,以及它与动物的身体特征和生活方式的关系。考虑到这一点,研究人员正利用19世纪的博物馆样本和现代样本进行更详细的群体研究。
目前的研究主要集中在中东和东欧的欧亚金豺,而后续研究将包括泰国的金豺样本。他们还计划评估以色列的数百个样本,以便了解金豺和非洲金狼的杂交程度,如果有的话。(转化医学网360zhyx.com)
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