鉴别出特殊基因突变或和儿童癌症药物引发的心脏副作用直接相关
导读 | 发表于国际杂志Nature Genetics上的一篇研究报道中,来自英属哥伦比亚大学的研究人员通过研究发现一种特殊的基因突变或许和癌症药物蒽环霉素治疗引发儿童出现心脏问题的发病风险直接相关。 |
发表于国际杂志Nature Genetics上的一篇研究报道中,来自英属哥伦比亚大学的研究人员通过研究发现一种特殊的基因突变或许和癌症药物蒽环霉素治疗引发儿童出现心脏问题的发病风险直接相关。
文章中,研究者进行了一项多级的全基因组关联性研究,其中就包括对来自十几个加拿大研究中心的超过450名蒽环霉素治疗的儿童癌症患者,其中一些患者已经表现出了毒素相关的症状;研究者分析发现,类维生素A受体γ基因RARG上名为rs2229774的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)或可增加服用该药物患者5倍的毒性风险。
而这种SNP或许也可为研究者提供了一种新型工具来帮助预测个体的遗传风险并且改善疾病的风险分类;当前研究中,研究人员利用Illumina公司的HumanOmniExpress实验对来自13个中心的利用蒽环霉素治疗的280名加拿大个体的基因型进行了分析,其中有32名患者在治疗5年内出现了毒性症状,而另外248名患者并无任何症状。当研究者将参与个体的65万个SNP的谱系同对照进行对比后他们发现了18种基因突变在蒽环霉素诱导产生毒性的患者机体中非常常见。
随后研究者重点研究了RARG SNP rs2229774和毒性之间的关联,研究数据表明,风险性的类维生素A受体等位基因在大约五分之一的南亚个体及十分之一的非洲裔美国人机体中发生,从另外一方面而言,仅有6%的欧洲个体及5%的西班牙人会携带这种等位基因,而东亚人种并不会携带这种等位基因。
本文研究揭示了儿童癌症药物诱发的心脏副作用和机体的特殊突变直接相关,后期研究中研究者表示,SNP rs2229774突变或许可以降低RARG受体亚单位蛋白的活性,从而改变同其它蛋白的作用。(转化医学网360zhyx.com)
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A coding variant in RARG confers susceptibility to anthracycline-induced cardiotoxicity in childhood cancer.
Nat Genetics doi: 10.1038/ng.3374
Aminkeng F, Bhavsar AP, Visscher H, Rassekh SR, Li Y, Lee JW, Brunham LR, Caron HN, van Dalen EC, Kremer LC, van der Pal HJ, Amstutz U, Rieder MJ, Bernstein D, Carleton BC, Hayden MR, Ross CJ; Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety Consortium.
Anthracyclines are used in over 50% of childhood cancer treatment protocols, but their clinical usefulness is limited by anthracycline-induced cardiotoxicity (ACT) manifesting as asymptomatic cardiac dysfunction and congestive heart failure in up to 57% and 16% of patients, respectively. Candidate gene studies have reported genetic associations with ACT, but these studies have in general lacked robust patient numbers, independent replication or functional validation. Thus, the individual variability in ACT susceptibility remains largely unexplained. We performed a genome-wide association study in 280 patients of European ancestry treated for childhood cancer, with independent replication in similarly treated cohorts of 96 European and 80 non-European patients. We identified a nonsynonymous variant (rs2229774, p.Ser427Leu) in RARG highly associated with ACT (P = 5.9 × 10-8, odds ratio (95% confidence interval) = 4.7 (2.7-8.3)). This variant alters RARG function, leading to derepression of the key ACT genetic determinant Top2b, and provides new insight into the pathophysiology of this severe adverse drug reaction.
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