《转》访Joris A. Veltman：基因检测推动转化医学的发展之路

  导语：Joris A. Veltman教授，荷兰奈梅亨大学医学中心转化基因组学教授。Veltman教授是人类遗传学基因组研究部门的负责人，同时也是医学基因测序项目的联系人。研究方向为应用基因组学技术揭示人类疾病成因的种种可能性。为此他成立了一个集基因技术、分子生物学、计算机科学和临床遗传学于一体的多学科交叉研究小组。同时，他作为特约嘉宾将出席在贵州举办的2015第六届分子诊断技术大会。转化医学网有幸邀请到Veltman教授为我们讲解基因检测在转化医学领域中所发生的故事。
  转化医学网：Veltman教授，这些年来，我们经常听到转化医学这个概念，您能不能介绍下您对转化医学的理解，以及目前转化医学的发展如何？
  Veltman：我认为转化医学是基础研究和临床引用之间的桥梁。转化医学是非常重要的，其可以将基础研究应用到临床上，造福患者。在我的工作中，参与了基因组技术的转化，像基因组芯片，外显子测序等，这些都是从研究工具转变成了诊断工具。我认为，转化医学已经得到了很大的发展，现在很多科学家已经认识到转化医学的重要性。
  转化医学网：千禧年的时候，您在临床遗传学中，开创了基于芯片检测的亚微观染色体拷贝数变化的技术，能给大家讲讲这项技术么？
  Veltman：在大型基因组片段中，基于拷贝数分析的芯片已经研发成功，因此我们可以用此芯片将从病人和对照组中得到的DNA进行免疫荧光杂交，从而确定能够造成像智力残疾等疾病的大型拷贝数变化。大约2005年，这种方法已经被应用于商业化寡核苷酸或者用于CNV的SNP芯片技术所取代，因为新的方法能够有更高的分辨率和更广泛的使用空间。基于芯片的CNV筛查现在是一个常规的用于诊断智力残疾或者其他先天性异常疾病的诊断工具。
  转化医学网：CNV筛查技术与现在十分流行的NIPT检查相比，有何优劣？
  Veltman：NIPT是用于产前检测三体疾病的，而基于芯片CNV筛查既可以检查先天疾病，也可以检查后天的。NIPT是一种下一代测序检测方法。其他的下一代测序检测方法，像外显子和基因组测序正在取代基于芯片的CNV筛查，这些方法既可以用于研究，也可以用于诊断，这主要是因为他们可以同时检测所有类型的基因组变异，包括基因拷贝数变异和SNVs。
  转化医学网：我们也听说，您在精神发育迟滞方面取得了很多成就，能不能给我们介绍一下？
  Veltman：正如前面所说的，我们已经利用了像基于芯片的CNV筛查，外显子和现在的基因组测序等方法来研究基因造成的智力残疾（ID，现在更普遍的叫法是精神发育迟滞）。我们的研究已经表明，新发生的突变和基因开倍数变异住造成严重的ID的主要原因（Vissers et al. Nature Genetics 2010; de Ligt et al. NEJM 2012; Gilissen et al. Nature 2014）。现在，我们将继续进行这项工作，以坚定所有ID基因和鉴定造成ID的非编码基因。
  转化医学网：现在很多公司和科研机构，都在大举进入NGS领域，你认为NGS的作用是否像现在宣传的那样？
  Veltman：NGS对于医疗研究绝对是具有革命性意义的，并且其也越来越多的用于疾病的诊断和监测。无论是在研究中还是诊断中，NGS都是使基因检测变得容易和让病人可以承担的起医疗费用的必需品。
  转化医学网：你认为NGS对基础医疗的最大促进作用是什么？
  Veltman：廉价的全基因组测序对基础医疗是至关重要的。
  转化医学网：基因检测技术已经使人们对疾病的了解越来越深。作为该领域的专家，您认为大数据在基因检测中发挥了什么样的作用？
  Veltman：大数据的作用，对于解释我们基因组中大量的突变是至关重要的。最好的例子，就是使用从对照组中获得的突变频率信息，来解释个别患者的突变。没有这些信息，我们将不能够确定致病性变异。
  转化医学网：我们注意到，您的研究团队具有基因技术，分子生物学，计算机科学以及临床遗传学等多学科背景，您愿意谈谈跨学科合作是如何更好地促进基因疾病的诊断和治疗的吗？而现在那一部分是最需要整合的？
  Veltman：遗传学研究永远是跨学科的，因为我们需要具有临床专业知识的临床医生，具有遗传方法和遗传变异专业知识的遗传学家，需要能够处理大数据的生物信息学家以及具有致病性功能研究验证专业知识的分子生物学家的支持。这些部分知识的整合，能够促使我们充分的了解疾病的遗传因素。
  转化医学网：随着相关技术的发展，您认为，在未来，基因疾病能够实现诊断和早期干预吗？
  Veltman：很快我们就能够拥有比现在更好的检测单基因疾病的技术，提供的信息将有巨大的价值，我们可以利用其防止并发病。然而真正的挑战是在复杂性基因疾病的真正理解上，例如在常见疾病中基因的相互作用。此外，我们是否能够可靠的进行干预也是存在疑问的，因为在像外显率减少的情况，会是很多疾病疾病的干预变得更加复杂。
  结语：人类医学领域有如今如此大的突破和挑战，无一不是建立在人类自身需求的基础上。因为需要，我们有了精准医疗的概念，因为精准医疗需要，我们推行了基因检测，因为基因检测的需要，我们发明了更加便捷、省钱的基因检测技术。但是无论如何发展，其目的始终都是为了更好的服务于人类健康事业。转化医学网在生物医学发展历史长河中将不断燃烧自己，服务大家，服务健康。今后，转化医学网将为大家带来更好更优质的信息而不断努力！
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