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腾讯登录斯坦福大学团队研究了非细胞DNA检测肺移植的方法
| 导读 | 在Stephen Quake的斯坦福大学的实验室，研究小组开发了基于下一代测序技术的方法，其可以通过分析肺移植患者循环系统中的非细胞DNA，来研究其排斥和感染的迹象。 |
他们的工作结果今日发表在了《Proceedings of the National Academy of the Sciences》上，研究人员在51例患者中比较了他们的方法和活检的方法，而活检是目前公认德检测黄金标准。他们发现，他们的方法能够对急性和慢性排斥反应实现信息化，并且其灵明度可以达到100%，特异性达到73%，而这是通过志愿者1%的游离DNA实现的。
虽然肺移植是终末期肺病患者的最后疗法，但是其临床接过差，平均只能生存5.3年。术后并发症包括过程期间德持续伤害和感染，以及两种排斥反应：急性细胞排斥反应，这一般在第一年35%的患者中发生；慢性排斥反应，而这是移植患者死亡的主要原因。目前，诊断排斥德唯一方法就是通过对移植物进行活检，但是这种方法具有侵入性并且诊断能力有限。而感染的诊断通常需要订购一套抗原特异的检测方法。
因此，斯坦福小组决定开发一个基于NGS德检测，其可以无创的检测排斥和感染。而这种测试主要依赖于循环德游离DNA测序。
斯坦福大学德研究员Iwijn de Vlaminck去年阿紫美国人类遗传学会议上描述了该方法，其在去年用相似的方法团队开发了检测心脏移植排斥反应的实验。
在进行移植之前，捐献者和接受者都接受一个通过SNP进行的基因组分型检测。进行后，在患者的循环非细胞DNA钟进行鸟枪全集因组测序。研究人员之后使用SNPs来检测来自捐赠者的非细胞DNA分子的比例。
为了检测捐赠者DNA在排斥反应钟德水平，研究人员首先检测了病人，表明病人没有排斥或者感染的证据。研究人员指出，移植后，患者通常会有大良的捐赠者德循环DNA，但是随着时间的流逝，其水平逐渐下降-这与他们在心脏移植患者中发现的结果相似。此外，捐赠者德cfDNA水平的不同，主要取决于病人接受一个或者两个肺的移植。
接下来，研究人员评估了诊断具有排斥反应的患者的捐赠者cfDNA水平。从一个具有排斥反应的患者中，研究人员发现，排斥反应中捐赠者的cfDNA水平比同时间的基线水平高14.7%。而具有严重排斥反应的患者中，捐赠者的cfDNA水平比基线高15.2%。
在全部51名患者的398个时间点获得的测序数据进行一个聚合研究，研究人员发现，他能够跟踪排斥反应的临床现象。此外，在某个没有排斥反应的临床症状的时间点，捐赠者的cfDNA水平是显著增高的。
而使用移植物活检分数的方法，研究了cdDNA检测的一致性，研究人员发现，在捐赠者cfDNA水平只有1%的时候，其检测线水平以下为0.9，敏感性100%，特异性位73%。
最后，研究人员想知道，他们能否发现病原体感染的迹象。巨细胞病毒感染对于器官移植的病人是一种常见的现象。研究人员发现，他们可以同CMV基因组中鉴定出相关序列。与临床上使用的针对病毒的检测相比，cfDNA的方法具有更好的检测下限。研究人员还发现了临床筛查没有找到的其他病毒的证据，包括社区获得性呼吸道感染腺病毒；多瘤病毒-这是一个在肾移植排斥反应中常见的病毒，但是在肺移植中并不是筛查病毒；人类疱疹病毒。
最后，作者写道，该检测有潜力在未来几年成为肺移植的一个重要检测工具，并且其已经考虑到较高的急性排斥反应发生率和难以诊断的感染性并发症；活检在众多排斥反应监测中的局限性；以及在肺移植后，移植物的非侵入性的检测；并且其还具有相对较低的成本。（转化医学网360zhyx.com）
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游客2015-10-29 11:41:38还有错别字
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