安诺优达NIPT研究成果亮相Nature子刊
导读 | 由安诺优达自主开发的一项有效降低NIPT(无创产前DNA检测)假阳性率的优化分析方法于2015年11月4日在Nature子刊Scientific Reports(IF=5.578)上在线发表。 |
由安诺优达自主开发的一项有效降低NIPT(无创产前DNA检测)假阳性率的优化分析方法于2015年11月4日在Nature子刊Scientific Reports(IF=5.578)上在线发表。
通过6615例大规模临床样本的验证,这项被称作FCAD Workflow的分析方法在降低假阳性率方面的表现得到了充分印证,显示出了非常重要的临床应用价值。
近几年来针对NIPT的准确性评估、适用人群范围探究等已有一系列文献发表。但对如何通过优化数据分析方法,从而进一步提升NIPT准确率方面的文献报道较少。
安诺优达联合北京大学第三医院、北京妇产医院、新疆医科大学附属第一医院、山西医科大学第一医院、北京友谊医院,进行了历时2年的大规模临床实践,率先验证了优化分析流程可成功排除母体CNV干扰,有效降低NIPT假阳性率,是NIPT临床应用的重要研究成果。
作为基因组技术临床转化应用的第一个成功典范,NIPT已经广泛地应用于临床,是一种近似于诊断的高精准度筛查方法。在检测胎儿常见染色体非整倍体疾病(21-三体综合征、18-三体综合征、13-三体综合征)方面的临床价值已经得到了广大临床医生、孕妇以及政府部门的高度认可,并产生了良好的社会价值。然而,受某些特殊因素的影响,NIPT仍然存在一定的假阳性结果。如何让检测结果更精准,是NIPT技术优化的重点和难点。
据现有研究,NIPT的假阳性结果,主要受母体基因组中存在拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)、胎盘嵌合、双胎中一胎停育及母体存在恶性肿瘤等因素影响。其中母源性CNV是造成假阳性的主要原因之一,它的存在会干扰胎儿染色体非整倍性的计算,导致假阳性结果的产生。这不但增加了临床风险和经济成本,还给部分孕妇带来巨大的心理压力。
在这篇报道中,安诺优达创新性的FCAD Workflow分析流程通过增加母体CNV过滤系统进行Z值校正,成功在6615例临床样本中,排除了2例T21、1例T18和1例T13的假阳性,有效地降低了错误率。
本文通讯作者、安诺优达总裁兼首席科技官陈重建博士表示:高通量测序技术是基因组学和IT技术的结合,对数据的校正和算法的优化将有助于提高检测结果的准确性。大规模NIPT临床实践之后,我们仍然需要对其持续优化与创新,以便为临床提供更优质的解决方案。
作为国内最早一批进入无创产前DNA检测领域的企业和国家卫计委首批高通量测序临床应用试点单位,安诺优达在分析流程优化和质量控制方面投入了巨大的资源,在生殖生育领域的其他检测项目的研发方面也精心布局,未来还将有更多优秀的临床转化成果陆续发表。
(转化医学网360zhyx.com)
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