Cell、NEJM发布癌症基因组图谱重要成果

癌症基因组图谱(TCGA)计划的科学家们，确定了两种最常见肾癌的分子特征，并分类了这一疾病的几种亚型。

乳头状肾细胞癌(PRCC)占每年肾癌病例的15-20%。长期以来它被分为1型和2型两类，然而直到现在科学家们还是基于从这一疾病一些罕见遗传形式获得的信息来了解PRCC的基础遗传学。对无肾癌家族史的病例的分子背景却知之甚少。当前，对于晚期PRCC没有有效的治疗方法。

新研究描述了1型和2型之间一些特异的分子差异，以及2型的3种亚型。研究结果发布在《英格兰医学杂志》（NEJM）杂志上。

Van Andel研究所助理教授Hui Shen在这项研究中负责完成关键的生物信息学工作，他说：“乳头状肾细胞癌向临床医生提出了一个特别的问题——一些患者疾病进展缓慢但广泛分布于肾脏中。在另一些情况下，个体病变具有高度侵袭性。这些研究结果不仅为医生提供了制定临床决策急需的信息，也为开发出靶向疗法来更好地治疗PRCC特定亚型奠定了基础。”

研究人员对来自161名患者的肿瘤进行了全面的基因组分析，发现1型和2型PRCC的分子与基因组均有差异，应该被视作是两种独立的疾病。他们还发现了2型PRCC的3种不同亚型，每一种以不同的分子改变为特征。

其中一种亚型的特点为，整个基因组数千基因超甲基化。DNA甲基化是一种DNA分子修饰，控制了基因的开启或关闭，当它出错时会导致肿瘤形成。这种2型PRCC的新亚型叫做CpG岛甲基化表型(CIMP)，在所有PRCC类型中具有最低的总生存率，与参与代谢的一个基因发生改变密切相关。这些改变导致了CIMP肿瘤细胞代谢发生变化，由此支持了它们的快速生长与存活。

Shen说：“CIMP样本与PRCC早期发病有关，是最致命的。能够利用分子标记进一步区分诸如CIMP等亚型，为科学家和临床医生们提供了一种强大的工具，更精确地诊断癌症类型及设计出一些靶向患者特异癌症的治疗策略。”

这项研究还描述了几种已知的癌症相关遗传信号通路，包括MET/VEGRF和NRF2/ARE所发生的改变。当前有一些MET/VEGR靶向药物正在PRCC临床试验中进行测试，近期还开发出了一些NRF2/ARE的靶向疗法。

同日，TCGA研究项目组还在《细胞》（Cell）发表了另一篇论文，描述了前列腺癌的基因组背景。

原发性前列腺癌具有显著的异质性。在这篇文章中，研究人员对333个原发性前列腺癌进行了全面的分子分析。结果揭示出通过特定的融合基因(ERG、ETV1/4和FLI1)或突变(SPOP、FOXA1和IDH1)，可将前列腺癌定义为7个亚型，74%的肿瘤可根据分子分类为其中的一种亚型。表观遗传图谱显示显著的异质性，包括一种IDH1突变亚型具有甲基化表型特征。雄激素受体(AR)活性差异很大，呈一种亚型特异性方式，SPOP和FOXA1突变肿瘤具有最高水平AR诱导转录物。25%的前列腺癌PI3K或MAPK信号通路有着可靶向的病变，在19%的前列腺癌中DNA修复基因失活。

这些分析结果揭示出了原发性前列腺癌之间的分子异质性，以及潜在可靶向的分子缺陷。
（转化医学网360zhyx.com）