《转》访鹍远基因创始人高远 & 张江立:企业的灵魂在于持续创新
导读 | 肿瘤,一个目前科技还未能解决而急需解决的医学难题。随着2015精准医学的提出,肿瘤精准治疗首当其冲。众所周知,基因突变是正常细胞癌变的根本,突变位点决定了肿瘤的异质性。二代测序技术成为肿瘤细胞突变位点的主流检测手段。而DNA甲基化检测也越来越多地应用到肿瘤早期诊断中。为此,我们邀请到鹍远基因创始人高远教授和CEO张江立为我们带来关于二代测序的精彩对话。 |
导语:肿瘤,一个目前科技还未能解决而急需解决的医学难题。随着2015精准医学的提出,肿瘤精准治疗首当其冲。众所周知,基因突变是正常细胞癌变的根本,突变位点决定了肿瘤的异质性。二代测序技术成为肿瘤细胞突变位点的主流检测手段。而DNA甲基化检测也越来越多地应用到肿瘤早期诊断中。为此,我们邀请到鹍远基因创始人高远教授和CEO张江立为我们带来关于二代测序的精彩对话。
高远教授的精彩访谈
回国创业是最好的选择转化医学网: 高远教授您好!您是美国约翰霍普金斯大学的教授,并且创办了Med Data Quest, Inc. 公司,那么是什么原因使您有了回国创业的的打算。
高远:早在2009年的时候我就与Google的早期员工胡峰创办了Med Data Quest, Inc.公司,不过只是兼职,因为我那时候觉得从事科研,发表学术文章还是很有成就感的,所以另一方面还在兼任美国约翰霍普金斯大学生物工程系的副教授。不过后来这种思想发生了很大的转变,我发现比从事科研、发表学术文章更有意义、更令激动的是能后将科研成果转化为实际应用,并使人们的生活生活的更健康。从2013年3月搬到了美丽的圣地亚哥并开始全心全意的创业之路。国内这几年政府大力支持创业,支持科技创新技术,并鼓励海外学者回国创业,所以选择回国创业是最好的抉择。
和卢煜明教授合作奠定DNA无创产前检测技术
转化医学网:高远教授,您和香港中文大学卢煜明教授合作在PNAS上发表了NIPT技术突破性论文,您能给我们简单介绍一下您和NIPT有着怎样的机缘。
高远:早在97年的时候卢煜明教授就发现母体血液里有胎儿游离的DNA,并且做了大量的实验,希望可以通过检测母亲血液里游离的DNA来判断胎儿生长状态、健康状态,染色体数目是否正常;可当时对于微量的母体血液中cfDNA(几个纳克)检测,对大家都是个挑战。到了2007年,那时二代测序技术的发展刚刚起步,对于微量的母体血液中cfDNA(几个纳克)建库、检测也依然没有什么好的方法,因为那时候测序文库制备一般需要系百纳克到一个微克的DNA。后来Dennis Lo?教授通过周代星博士认识了当时在VIRGINIA COMMONEWEALTH UNIVERSITY做助理教授的我。我的实验室开发了制备文库的整个流程,我和Dennis Lo?教授的团队一起研究分析方案,并获得了成功,通过二代测序的技术开创了NIPT技术,奠定了今天的的DNA无创产前检测技术基础。当然,这项伟大的创举也不能忽略团队其他成员的协同帮助,例如香港中文大学的Rossa Chiu?教授,?Allen Chan等, 还有我的实验室的技术员谢斌。
成功就是在失败中探索,寻找成功苗头的微积分的过程
转化医学网:09年您与张鹍教授共同开发了第一个大规模DNA甲基化靶向测序技术。能给我们介绍下这段经过。
高远:以往的研究认为癌基因激活、抑制基因失活主要是基因突变、缺失导致的DNA序列改变。在目前肿瘤研究中,检测到许多肿瘤的重要基因并没有发生突变、缺失,基因表达异常主要是通过DNA甲基化实现的。癌基因的去甲基化和抑癌基因的甲基化状态,可导致癌基因激活、抑癌基因失活。癌基因的低甲基化和抑癌基因的高甲基化改变是肿瘤细胞的一个重要特征。
DNA甲基化(DNA methylation)是最早发现的修饰途径之一,大量的研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。一般的DNA甲基化靶向测序很困难,而基于芯片的技术只能检测出C端的一个甲基化,是一个单位点的检测,因而有很多的局限性。我们利用二代测序技术研发出的这个检测方法是多位点的检测,同时可以检测出多个位点的DNA甲基化。技术的成功其实就是一个不断在失败中探索、寻找成功苗头的微积分的过程。
DNA甲基化技术将在临床上发挥越来越重要的作用
转化医学网:DNA甲基化在临床上有哪些应用,您对未来DNA甲基化前景是如何预测的?
高远:DNA甲基化越来越收到人们的重视,临床上通过对血液里DNA甲基化的检测,可以快速的诊断出疾病的发生、发展,对疾病综合治疗方案的制定具有指导意义。DNA甲基化在临床上的应用有这几方面:一是肿瘤的早期检测;二是指导用药和疗效监测;三是术后恢复的跟踪;四是运用于药物研发。
生物信息学之于二代测序的意义
转化医学网:您是位生物信息学者,那么生物信息学技术在二代测序检测中有哪些作用。
高远:生物信息学,其实是从统计学、计算机科学发展来的,因此对于大家(医学、生物学领域)也许有点陌生。举个例子,我们要读一本书,我们需要一个字一字去读,然后理解其中的意思,得到我们要的知识、信息;同样我们的基因就像一本书,测序也是一个碱基一个碱基来读,尤其是二代测序技术,是要把DNA这本书,撕碎了读。我们通过测序得到的直接信息就是一大堆AGCT的序列,如何理解其中的信息,这就是生物信息学技术要做的事情。解读这些AGCT信息,其实比测序本身难度更大,更有现实意义。尤其对于临床医生来说,通过测序,通过生物信息学的分析,找到变异基因,了解基因的突变,拷贝数变异,甲基化异常状况,等等,从而帮助疾病诊断和指导治疗,这些工作都高度依赖于生物信息学提供的帮助。
作为一名生物信息学者,更加意识到在医学和测序中大数据分析的价值。所以当我2013年从约翰霍普金斯大学停薪留职出来创业时,我首先是全职于我在2009年创立的医学与生物信息学公司MDQ。美国最大的医疗集团凯撒集团是我们的重要客户,国内的药明康德也是我们的重要客户。现在在鹍远的技术发展和产品研发过程中,MDQ的生物信息学团队提供了巨大的帮助,两家公司的协同效应得到充分的显现。
CEO张江立的精彩访谈
核心创业团队
转化医学网:张总您好,给我们介绍一下鹍远基因的核心创业团队。
张江立:鹍远基因(Singlera Genomics Inc.)由高远教授(约翰霍普金斯大学),张鹍教授(加州大学圣地亚哥分校)联合其他创始人CEO张江立、COO刘强、CTO刘蕊博士共同组建。“鹍远”有两层含义,一层是联合创始人高远教授与张鹍教授名字的结合,另一层则是寓意”鲲鹏展翅,志存高远“。
计划外的创业,初次见面就被打动
转化医学网:张总,您是行业资深专家。曾经在ThermoFisher Scientific任中国区医疗业务副总裁,并且在2012年获得年度全球CEO奖,就职业发展来说是非常成功的。那是什么原因促使您创业,背后有什么样的故事。
张江立:在赛默飞,不论是职业的发展还是待遇来说都是很成功的,创业对于我是个意外而非计划。当高远教授和张鹍教授打算创业的时候,他们需要一个懂得中国国情以及商业运作的CEO来帮助他们把技术转化成市场上可以应用的产品,于是张鹍教授就将他的大学同学,也就是我介绍给了高远教授。
在第一次见面的时候,高教授对创业的热情,对市场的激情以及对产业发展的高瞻远瞩,深深地吸引了我。高教授希望将基础科研成果转化为实际应用去帮助患者、帮助医生,为大众的健康做出贡献的强烈愿望感动了我。第一次见面我们虽然谈的时间不长,但是给彼此都留下了深刻的印象,这也奠定了我后来决定加入创业团队的基础。
四大产品版块
转化医学网:我们了解到鹍远基因致力于新一代基因测序技术的研发和应用。能和我们谈一下鹍远基因未来的产品规划吗?
张江立:鹍远基因根据市场的需求以及未来的发展制定了四个产品板块:肿瘤诊断、妇幼保健、生殖健康以及感染诊断。除了自主开发,在不同的产品领域里,我们还有一些特定合作伙伴,帮助我们共同开发。
行业顶级科学家带来的持续创新能力
转化医学网:目前国内从事基因测序的公司很多,鹍远基因的优势在什么地方?
张江立: 鹍远基因最核心的优势是持续的技术创新能力。我们不仅有两个此行业顶级的科学家,还有中美两地的联合实验室,另外还有数十位高水准的生物技术和生物信息学专家在中美两地为我们工作。目前国内并不是每个医院都有能力建立自己的病理实验室,我们一方面致力于帮助有能力有条件的医院建立他们自己的二代测序实验室,我们会提供一整套的解决方案,包括设备,试剂、软件、技术支持以及后续的持续培训等;另一方面我们也将建立我们自己的实验室,并且与我们的战略合作实验室如湖南湘雅和广州华银等一起,为没有条件建立二代测序实验室的医院提供第三方服务。
附:高远教授简介
美国约翰霍普金斯大学生物工程系副教授;美国Med Date Quest, Inc.创始人和总裁;北京大学生物系学士,美国孟菲斯大学计算机博士,哈佛大学George Church教授博士后;08年与香港中文大学卢煜明(Dennis Lo)教授合作在PNAS上发表著名的NIPT技术突破的论文,并因此奠定了DNA无创产前检测的基础,这项技术被《时代周刊》评为2008年度十大医疗突破;09年与张鹍教授共同开发了第一个大规模的DNA甲基化靶向测序技术并成为Nature Biotechnology封面文章;12年与George Church教授、Sriram Kosuri合作,利用合成生物学大规模DNA合成技术,发明了一种完全不需要利用细胞的DNA信息归档系统,并发表在Science上。
附:CEO张江立简介
复旦大学生物化学学士和工商管理硕士;曾在ThermoFisher Scientific任中国区医疗业务副总裁,并且在2012年获得年度全球CEO奖;曾作为联合创始人,创立中国生命科学领域的领导网站,并任首任COO;之前服务于基因有限公司,并将多项国际领先技术引进中国,包括Dako免疫组化,Abbott的FISH,Qiagen的核酸检测,Affymatrix的基因芯片等。
(转化医学网360zhyx.com)
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游客2015-12-19 08:01:14怎么找不到鲲远基因的网站和联系方式13397178715
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