【研究】临床基因检测助力智障诊断

日前，费萨尔国王专科医院及其研究中心的研究者团队称，临床基因组学可以提高对智力障碍者的检出率。在对300余智障人士进行传统临床诊断方法的同时，该团队前瞻性的使用基因组学方法对其进行诊断。

研究人员Fowzan Alkuraya和他的同事本周在《分子精神病学》杂志上发表文章称，基因组方法可以对60%的病例给出结果，而传统方法只能对其中的16%进行判断。与此同时，基因组学的方法还可以揭示一些不常见的疾病变异情况和确诊一些之前报道的病例。

Alkuraya 说“与传统的病情检查方法相比，对个体进行基因组检测可以提高检出率。在文章中提供的数据显示，基因组测序应该在诊断的前期开展，它可以与染色体核型分析同时进行，或者在核型分析结果为阴性后进行”。

研究针对337名智障儿童，将其分为两组，一组是家族性病例，一组为非家族性病例。传统流程下，对于家族性病例，先对其进行一些相关基因以及fragile X（孤独症相关基因）基因进行分析，如果不能给出诊断的话，再进行全外显子测序。同样的，针对非家族性的病例，先对其进行核型分析和fragile X基因检测，如果不能进行诊断，再进行其它已知基因的排查。然后再是全外显子测序。在这里，对其中的129名患者直接进行了全外显子测序。

检测结果可以对其中58%的病例给出诊断结果。在揭示治病性或可能致病性的CNVs以及SNVs的比例上，核型分析占27%，多基因分析占34%，全外显子测序占39%。

对于这129个病例来说，是没有进行多基因分析而直接进行全基因组测序的，这其中可以对其中的60%给出结果判断。对比来说，传统的临床方法只能对其中16%的病例给出诊断，但剩余的70%接下来都被证实为患者。

报道中报道了这些患者中致病的或疑似致病的突变，其中有发现8个新的CNVs,46个已知CNVs，68个新SNVs以及77个已知SNVs。大多数与疾病相关的的SNVs都是隐性遗传，并且在其他人种中对应的外显子中并未发现。但也有些基因的突变并不仅存在一个家族。比如NEMF和DNHD1基因的突变在两个家族中都有出现。

有一些基因突变已被证明与疾病相关，然而也有些基因与疾病史并没有直接联系，但是其会影响临床的诊断。文章中提到一个女孩的SLC39A14基因出现截断突变，并且患上了神经性疾病。该基因编码ZIP14（锌指结构），它的作用是运输微量元素。当对女孩血液中的微量元素进行检测时发现锰的含量特别高，因此对其进行了螯合治疗。目前对于该女孩的情况还在继续跟踪中。

文章的作者还指出他们的研究建议将基因组学作为对个体进行诊断的第一方法。

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