遗传分析发现使用了50年的脑癌细胞系身份有误
导读 | 瑞典Uppsala大学的研究人员利用短串联重复序列(STR)基因分型和基于芯片的基因表达谱技术,比较了ATCC的U87MG细胞系和Uppsala大学的U87MG细胞系,以及约五十年前用来开发该细胞系时使用的肿瘤样本。这项研究结果近日在线发表在《Science Translational Medicine》上。 |
瑞典Uppsala大学的研究人员利用短串联重复序列(STR)基因分型和基于芯片的基因表达谱技术,比较了ATCC的U87MG细胞系和Uppsala大学的U87MG细胞系,以及约五十年前用来开发该细胞系时使用的肿瘤样本。它表明,ATCC的U87MG细胞系不是神经胶质瘤,而更接近于之前分析过的胶质母细胞瘤样本。这项研究结果近日在线发表在《Science Translational Medicine》上。
文章通讯作者、Uppsala大学免疫学、遗传学和病理学研究者BengtWestermark表示,“Uppsala大学的细胞系与原始肿瘤的基因相同,但是ATCC的U87MG细胞系的来源不明。我们不知道在这五十年间的哪个时间点发生了细胞系的混淆,ATCC的U87MG细胞系极有可能来自另一例人类神经胶质瘤。”ATCC的U87MG细胞系可能是人类胶质母细胞瘤
细胞系的误认和污染日益成为医学研究中的问题,这促使Nature、美国癌症研究学会(AACR)和其他出版者引入指南,要求研究人员利用DNA分析技术认证已发表研究中使用的细胞系。
Westermark和他的同事们对原始U87MG细胞系很熟悉,它是60年代在Uppsala大学建立的,他们担心ATCC的U87MG细胞系的真伪。由于Uppsala大学仍保存有生成该细胞系的原始神经胶质瘤肿瘤样本,研究小组能够直接将来自Uppsala大学和ATCC的U87MG神经胶质瘤细胞系与原始肿瘤的基因和转录模式进行比较。
研究人员使用Promega公司的PowerPlex 16 HS系统,通过16个短串联重复标记物对来自ATCC和Uppsala大学的U87MG细胞系进行基因分型研究,他们发现这两个U87MG细胞系有12个短串联重复标记物存在差异。研究人员进一步将研究范围扩大到Uppsala大学的另外19个人类神经胶质瘤细胞系,发现了两个基因上完全相同的细胞系,这种情况似乎是由污染引起的。虽然U87MG细胞系与其他神经胶质瘤细胞系相似,但来自ATCC的版本仍然存在不同,研究小组通过线粒体DNA检测和基于芯片的表达谱分析证明了这种差异。后者的分析结果表明,ATCC的U87MG细胞系似乎是人类胶质母细胞瘤。
根据这些发现,研究人员建议使用STR基因分型验证过的神经胶质瘤细胞系,例如Human Glioma Cell Culture资源。Westermark等作者写道,“我们建议在大脑肿瘤生物学研究中使用这些或类似的神经胶质瘤细胞系。研究人员应该在研究培养的胶质母细胞瘤细胞时,使用这类细胞系作为参考,使用验证过的细胞系替换U87MG和其他经典细胞系。”
参考文献:Origin of the U87MG glioma cell line: Good news and bad news. Science Translational Medicine, DOI:10.1126/scitranslmed.aaf6853(转化医学网360zhyx.com)
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