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腾讯登录大型GWAS发现23个新的白癜风易感位点，与黑色素瘤等多种疾病相关 ...
| 导读 | 通过全基因组关联研究（GWAS），一个国际团队发现了二十多个新的与白癜风相关的基因位点。 |
白癜风是一种自身免疫性疾病，由于黑素细胞被破坏，导致皮肤出现白色斑块。以前的研究已发现了27个白癜风易感基因位点，这项由科罗拉多大学医学院Richard Spritz领导的研究又进一步发现了23个易感位点。此外，他们发现，其中许多易感位点参与其他自身免疫性疾病，编码免疫和凋亡调节子以及黑素细胞调节子。
相关研究结果于10月10日发表在《Nature Genetics》上。白癜风风险基因的数量翻倍Spritz等人以他们以前的两项GWAS作为对照，进行了第三项GWAS研究。他们还对这三项GWAS进行了meta分析，并进行了另一项重复研究，共涉及4,680个病例和39,586个对照。通过这些，研究者确定了23个与白癜风相关的位点，其中2个位点在以前的研究中出现过。
研究者计算得出，所有48个基因位点导致白癜风的遗传性为17.4%。如果考虑其他独立相关性和主要组织相容性复合体（MHC），该估计值增加到22.5%。Spritz等人还筛选了白癜风相关基因位点来寻找功能关系。通过GO术语富集分析发现了与免疫反应和刺激反应调节等的相关性。使用蛋白质互作数据库STRING进行通路分析揭示了与免疫调节、凋亡和黑素细胞功能相关的多种蛋白质的潜在互作网路。在23个新的白癜风易感基因位点中，约12个编码参与免疫调节的蛋白质，6个调节细胞凋亡，ASIP位点调节黑素细胞，另一个IRF4是免疫细胞和黑素细胞中的重要转录因子。研究者进一步指出，一些白癜风相关基因编码的蛋白之间能够互作。
例如，BCL2L11和BAD结合以促进凋亡，ASIP结合MC1R以下调棕色-黑色真黑素的生成。从这一系列的GWAS中，研究者还发现白癜风和恶性黑色素瘤风险基因之间的反向关系。这表明白癜风易感性可能是由于对黑色素瘤的过度活跃的免疫监视造成的。白癜风也与其他自身免疫性疾病有关，例如自身免疫性甲状腺疾病、类风湿性关节炎和狼疮。Spritz等人通过检索美国国家人类基因组研究所-欧洲生物信息学研究所的GWAS目录和PubMed，发现了23个新的白癜风易感基因位点与其他自身免疫性疾病之间的联系：FASLG与乳糜泻和克罗恩病相关，PTPRC与溃疡性结肠炎相关，BCL2L111与原发性硬化性胆管炎相关。研究人员还发现了许多基因位点与表达数量性状基因座（eQTL）相对应，并且许多基因位点涉及免疫细胞和黑素细胞的基因表达调控。Spritz说，“基因组计划的目的之一是为我们提供进行复杂疾病分析的工具。复杂疾病一般发生的是基因调控的改变，而不是基因结构的改变。”
参考文献：Genome-wide association studies of autoimmune vitiligo identify 23 new risk loci and highlight key pathways and regulatory variants. Nature Genetics (2016)doi:10.1038/ng.3680（转化医学网360zhyx.com）
相关研究结果于10月10日发表在《Nature Genetics》上。白癜风风险基因的数量翻倍Spritz等人以他们以前的两项GWAS作为对照，进行了第三项GWAS研究。他们还对这三项GWAS进行了meta分析，并进行了另一项重复研究，共涉及4,680个病例和39,586个对照。通过这些，研究者确定了23个与白癜风相关的位点，其中2个位点在以前的研究中出现过。
研究者计算得出，所有48个基因位点导致白癜风的遗传性为17.4%。如果考虑其他独立相关性和主要组织相容性复合体（MHC），该估计值增加到22.5%。Spritz等人还筛选了白癜风相关基因位点来寻找功能关系。通过GO术语富集分析发现了与免疫反应和刺激反应调节等的相关性。使用蛋白质互作数据库STRING进行通路分析揭示了与免疫调节、凋亡和黑素细胞功能相关的多种蛋白质的潜在互作网路。在23个新的白癜风易感基因位点中，约12个编码参与免疫调节的蛋白质，6个调节细胞凋亡，ASIP位点调节黑素细胞，另一个IRF4是免疫细胞和黑素细胞中的重要转录因子。研究者进一步指出，一些白癜风相关基因编码的蛋白之间能够互作。
例如，BCL2L11和BAD结合以促进凋亡，ASIP结合MC1R以下调棕色-黑色真黑素的生成。从这一系列的GWAS中，研究者还发现白癜风和恶性黑色素瘤风险基因之间的反向关系。这表明白癜风易感性可能是由于对黑色素瘤的过度活跃的免疫监视造成的。白癜风也与其他自身免疫性疾病有关，例如自身免疫性甲状腺疾病、类风湿性关节炎和狼疮。Spritz等人通过检索美国国家人类基因组研究所-欧洲生物信息学研究所的GWAS目录和PubMed，发现了23个新的白癜风易感基因位点与其他自身免疫性疾病之间的联系：FASLG与乳糜泻和克罗恩病相关，PTPRC与溃疡性结肠炎相关，BCL2L111与原发性硬化性胆管炎相关。研究人员还发现了许多基因位点与表达数量性状基因座（eQTL）相对应，并且许多基因位点涉及免疫细胞和黑素细胞的基因表达调控。Spritz说，“基因组计划的目的之一是为我们提供进行复杂疾病分析的工具。复杂疾病一般发生的是基因调控的改变，而不是基因结构的改变。”
参考文献：Genome-wide association studies of autoimmune vitiligo identify 23 new risk loci and highlight key pathways and regulatory variants. Nature Genetics (2016)doi:10.1038/ng.3680（转化医学网360zhyx.com）
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