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腾讯登录Quest和IBM推出肿瘤基因组测序服务；微软云平台使测序分析速度快7倍
| 导读 | Quest Diagnostics公司和IBM Watson Health近日宣布推出一项服务，为美国医生提供肿瘤基因组测序和分析以及癌症治疗建议。 |
Quest Diagnostics公司和IBM Watson Health近日宣布推出一项服务，为美国医生提供肿瘤基因组测序和分析以及癌症治疗建议。这项服务代表着IBM先进的基因组学智能计算平台Watson for Genomics已经不仅能服务于患者和肿瘤学家，而且能广泛地服务于提供大部分癌症治疗的社区肿瘤医生。作为合作的一部分，纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）的精准肿瘤学知识库OncoKB将为Watson补充科学数据。Broad研究所将提供基因组测序服务，作为Quest公司测序服务的补充。通过这项服务，临床医生可以将肿瘤组织寄送到Quest进行测序，然后测序数据将转给Watson进行分析。Watson每个月会吸收约1万篇关于大约100个新临床试验的科学论文和信息，该智能计算机会利用科研文献、药物数据和临床试验信息组成的庞大数据库进行检索，然后评估可能靶向肿瘤突变的治疗方法。
Quest公司的病理学家审查Watson的报告后，将其发送给临床肿瘤医生。Quest公司表示，该计划的关键是应用范围广。该公司在美国约一半的医生办公室和医院有客户，业务范围包括提供70%癌症治疗的社区肿瘤医生。Quest公司的首席医疗官Jay Wohlgemuth说，“这项服务结合了Quest最先进的肿瘤分析技术、IBM Watson智能计算平台的全国访问权限和MSK的癌症治疗专业知识。这是一个非常强大的组合，我们相信这项服务将会超越传统的基因组服务，成为制定肿瘤靶向治疗方案的更好方法。”纪念斯隆-凯特林癌症中心（MSKCC）临床研究副主任Paul Sabbatini表示，通过这项服务，肿瘤医生将能够从MSKCC获得关于特定癌症基因改变的影响和治疗效果的专业信息。基因组测序工具在微软云平台Azure上的运行速度变快7倍基因组分析在遗传疾病诊断方面的重要性与日俱增，而微软云平台似乎也将促进未来几年的基因组学革命。
在微软网站最新的一篇博客中，微软解释了他们的Azure云平台是如何使两种不同的基因组测序方法的运行速度比以前快七倍的，该提升将为医疗专业人士节省宝贵的时间。研究人员和医生目前进行基因组序列分析使用的是BWA（Burrows-Wheeler Aligner）和GATK（Genome Analysis Toolkit）软件。微软公司表示，这两种依赖于复杂计算的方法在Azure云平台上可以更加高效的运行。该博客中写道，云计算非常适合这类计算工作，因为这类工作需要耗费大量的计算资源，及大量的数据存储空间，而且发出的请求也是不规律的。对大多数医院、科研实验室和生物科学机构而言，基础计算设备的投资太昂贵，而且如今数据都呈指数增长，他们自己管理这些数据也是不切实际的。微软云计算平台的这一新应用可以节省大量成本，对医院、诊所和研究所非常有吸引力，这些机构目前面临的基因组测序需求量以指数增长。微软公司基因组学小组的首席软件架构师Ravi Pandya说，“目前有成千上万个基因组需要进行测序，因此效率非常重要。”目前微软公司正在和Broad研究所合作，对其GATK的未来版本进行改进。微软公司基因组学小组最终将与医院和其他医疗机构合作，找出更多Azure云平台在医疗中的使用空间。（转化医学网360zhyx.com）
Quest公司的病理学家审查Watson的报告后，将其发送给临床肿瘤医生。Quest公司表示，该计划的关键是应用范围广。该公司在美国约一半的医生办公室和医院有客户，业务范围包括提供70%癌症治疗的社区肿瘤医生。Quest公司的首席医疗官Jay Wohlgemuth说，“这项服务结合了Quest最先进的肿瘤分析技术、IBM Watson智能计算平台的全国访问权限和MSK的癌症治疗专业知识。这是一个非常强大的组合，我们相信这项服务将会超越传统的基因组服务，成为制定肿瘤靶向治疗方案的更好方法。”纪念斯隆-凯特林癌症中心（MSKCC）临床研究副主任Paul Sabbatini表示，通过这项服务，肿瘤医生将能够从MSKCC获得关于特定癌症基因改变的影响和治疗效果的专业信息。基因组测序工具在微软云平台Azure上的运行速度变快7倍基因组分析在遗传疾病诊断方面的重要性与日俱增，而微软云平台似乎也将促进未来几年的基因组学革命。
在微软网站最新的一篇博客中，微软解释了他们的Azure云平台是如何使两种不同的基因组测序方法的运行速度比以前快七倍的，该提升将为医疗专业人士节省宝贵的时间。研究人员和医生目前进行基因组序列分析使用的是BWA（Burrows-Wheeler Aligner）和GATK（Genome Analysis Toolkit）软件。微软公司表示，这两种依赖于复杂计算的方法在Azure云平台上可以更加高效的运行。该博客中写道，云计算非常适合这类计算工作，因为这类工作需要耗费大量的计算资源，及大量的数据存储空间，而且发出的请求也是不规律的。对大多数医院、科研实验室和生物科学机构而言，基础计算设备的投资太昂贵，而且如今数据都呈指数增长，他们自己管理这些数据也是不切实际的。微软云计算平台的这一新应用可以节省大量成本，对医院、诊所和研究所非常有吸引力，这些机构目前面临的基因组测序需求量以指数增长。微软公司基因组学小组的首席软件架构师Ravi Pandya说，“目前有成千上万个基因组需要进行测序，因此效率非常重要。”目前微软公司正在和Broad研究所合作，对其GATK的未来版本进行改进。微软公司基因组学小组最终将与医院和其他医疗机构合作，找出更多Azure云平台在医疗中的使用空间。（转化医学网360zhyx.com）
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