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腾讯登录美国白宫推出多项新措施，推进癌症登月计划
| 导读 | 为了帮助推进副总统拜登的癌症登月计划，美国白宫近日发布了几项新计划，旨在为研究人员提供液体活检数据集、开发精准肿瘤学方法以及创新临床诊断新方法。 |
为了帮助推进副总统拜登的癌症登月计划，美国白宫近日发布了几项新计划，旨在为研究人员提供液体活检数据集、开发精准肿瘤学方法以及创新临床诊断新方法。通过一项称为Blood Profiling Atlas的计划，制药和诊断公司、大学及研究中心将收集并提供来自循环肿瘤细胞（CTC）、循环肿瘤DNA（ctDNA）和外泌体检测的原始数据集，来自13个临床研究的相关临床数据，以及样品制备和操作方法。多家公司将提供研究数据和专业技术知识。例如Eli Lily公司将分享外泌体分析所需的样品制备方法、下一代qPCR和下一代测序技术（NGS），以及通过基因表达分析得到的与疾病特征相关的数据。Personal Genome Diagnostics公司将提供PlasmaSelect平台进行ctDNA分析的数据和方法。Guardant Health公司将提供经过Guardant360液体活检检测分析的500份肺癌患者样本的预分析数据和基因组数据。此外，Thermo Fisher Scientific公司将提供利用其液体活检分析和NGS平台检测得到的ctDNA数据。Novartis公司将提供实验方案和数据，评估用于ctDNA分析的不同PCR方法和NGS方法。Foundation Medicine公司将分享FoundationACT ctDNA检测的分析验证数据。在第二个合作项目中，美国国家癌症研究所（NCI）将与亚马逊AWS云服务及微软合作，通过NCI的Genomic Data Commons和Cancer Genomics Cloud试点项目，构建一种可持续模型，在云平台维护癌症基因组数据，供癌症研究人员使用。
在另一个项目中，国防部（DoD）准备开展一项纵向研究，目的是获得对癌症生物学基础的新认识，并开发精准肿瘤学的新方法。DoD的研究人员将使用他们的癌症登记处和血清库的数据，来确定诊断前生物学标志物和各种癌症类型之间的新关联。同时DoD还将和环境保护署合作，将上述纵向研究的结果和环境质量指数（Environmental Quality Index）关联起来，进一步评估影响癌症发展的环境因素。基因组数据公司CosmosID也表示将参与到癌症登月计划中，为研究人员提供其自动化生物信息学平台MetaGenID的访问权。
该平台将被用于支持5项癌症微生物组研究，以了解不同的微生物群对特定癌症产生的影响。这5项研究的数据和结果将免费提供给研究人员。亚特兰大的全球医疗创新中心（GCMI）和T3实验室宣布，他们将与NCI合作开发创新的诊断设备。GCMI和T3将创建一种有助于诊断的路径，并期待能获取投资将其推广到临床中。
未来五年，他们希望这项合作将展示如何将新型癌症诊断工具从科研到临床转化的速度加倍。同时，纪念斯隆-凯特林（MSK）医院已经启动了IMPACTED计划。该项目将供科研使用的MSK IMPACT基因组测序用于在纽约市健康＋医疗中心接受治疗的癌症患者中，希望对那些在基因组分析研究中被忽视的肿瘤患者群体进行测序，识别差异性表达的驱动子，以解释少数群体的癌症差异。儿童脑肿瘤组织联盟、太平洋儿童神经肿瘤联盟和Seven Bridges公司参与的癌症登月计划相关项目是，发布一款数据分析平台Cavatica，用于推进不同儿童疾病（包括癌症，先天性疾病、癫痫和自闭症等罕见疾病）数据的快速整合。
Cavatica将直接为研究人员提供超过24个数据集，这些数据集可以和Genomic Data Commons以及其他NIH数据库协同操作。非盈利组织Open Commons Consortium也参与到了癌症登月计划中，该组织将创建一个生物医学数据共享试点平台，称作Contribute &Change (C2) Cancer Commons。同时，该联盟还开发了一个称作Cancer Commons Hub的试点平台，多种系统可以连接到这个平台中共享癌症数据。该联盟认为，C2 Cancer Commons和Cancer Commons Hub将会使目前研究人员可使用的分子、医学成像数据和临床注释数据翻倍。C2 Cancer Commons使用的开源软件与NCI的Genomic DataCommons相同，但是该平台还将利用C2成员提交的补充数据拓展数据库性能。到目前为止，费城儿童医院、西奈山伊坎医学院、印第安纳州临床和转化科学研究所、约翰霍普斯金大学、北岸大学健康系统、Northwell健康中心和芝加哥大学都参与到了该项目中。（转化医学网360zhyx.com）
在另一个项目中，国防部（DoD）准备开展一项纵向研究，目的是获得对癌症生物学基础的新认识，并开发精准肿瘤学的新方法。DoD的研究人员将使用他们的癌症登记处和血清库的数据，来确定诊断前生物学标志物和各种癌症类型之间的新关联。同时DoD还将和环境保护署合作，将上述纵向研究的结果和环境质量指数（Environmental Quality Index）关联起来，进一步评估影响癌症发展的环境因素。基因组数据公司CosmosID也表示将参与到癌症登月计划中，为研究人员提供其自动化生物信息学平台MetaGenID的访问权。
该平台将被用于支持5项癌症微生物组研究，以了解不同的微生物群对特定癌症产生的影响。这5项研究的数据和结果将免费提供给研究人员。亚特兰大的全球医疗创新中心（GCMI）和T3实验室宣布，他们将与NCI合作开发创新的诊断设备。GCMI和T3将创建一种有助于诊断的路径，并期待能获取投资将其推广到临床中。
未来五年，他们希望这项合作将展示如何将新型癌症诊断工具从科研到临床转化的速度加倍。同时，纪念斯隆-凯特林（MSK）医院已经启动了IMPACTED计划。该项目将供科研使用的MSK IMPACT基因组测序用于在纽约市健康＋医疗中心接受治疗的癌症患者中，希望对那些在基因组分析研究中被忽视的肿瘤患者群体进行测序，识别差异性表达的驱动子，以解释少数群体的癌症差异。儿童脑肿瘤组织联盟、太平洋儿童神经肿瘤联盟和Seven Bridges公司参与的癌症登月计划相关项目是，发布一款数据分析平台Cavatica，用于推进不同儿童疾病（包括癌症，先天性疾病、癫痫和自闭症等罕见疾病）数据的快速整合。
Cavatica将直接为研究人员提供超过24个数据集，这些数据集可以和Genomic Data Commons以及其他NIH数据库协同操作。非盈利组织Open Commons Consortium也参与到了癌症登月计划中，该组织将创建一个生物医学数据共享试点平台，称作Contribute &Change (C2) Cancer Commons。同时，该联盟还开发了一个称作Cancer Commons Hub的试点平台，多种系统可以连接到这个平台中共享癌症数据。该联盟认为，C2 Cancer Commons和Cancer Commons Hub将会使目前研究人员可使用的分子、医学成像数据和临床注释数据翻倍。C2 Cancer Commons使用的开源软件与NCI的Genomic DataCommons相同，但是该平台还将利用C2成员提交的补充数据拓展数据库性能。到目前为止，费城儿童医院、西奈山伊坎医学院、印第安纳州临床和转化科学研究所、约翰霍普斯金大学、北岸大学健康系统、Northwell健康中心和芝加哥大学都参与到了该项目中。（转化医学网360zhyx.com）
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