伯豪客户发表干燥综合征相关的lncRNA表达模式研究成果

原发性干燥综合征（pSS）是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病，最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点，但是，lncRNA是否与pSS的发病有关，目前还没有相关报道，来自上海第九人民医院的研究人员，通过唾液腺中lncRNA的表达模式研究，阐述了lncRNA在干燥综合征中的作用。

为了筛选和pSS疾病相关的lncRNA，研究人员用4个病人的唾液腺样本和正常配对样本进行lncRNA表达谱芯片筛选（SBC human lncRNA V5 array，伯豪提供），共筛选到1243个差异lncRNA和1457个差异mRNA。其中，有890个lncRNA和1141个mRNA表达上调，353个lncRNA和316个mRNA表达下调。因此，在pSS病人中，在转录组层面，确实有大量的lncRNA和mRNA表达异常。

为验证芯片结果可靠性，研究人员对其中的9个lncRNA，在额外的30个pSS病人和16个正常人的唾液腺样本进行了qRT-PCR验证。结果显示，除了n341833外，其他lncRNA差异都与芯片结果吻合。该结果很好地证明了从芯片筛选到的差异lncRNA的可靠性。

2. 差异lncRNA与临床指标关联分析

通过对上诉验证出来的差异lncRNA与临床指标关联分析，研究人员发现如微球蛋白，红细胞沉降率，RF，IgA, IgM等指标与相应的lncRNA表达存在关联。该结果表明，对于这些差异lncRNA，他们的表达可以作为潜在的临床诊断指标。

3. 差异mRNA功能预测

为理解pSS病人中差异表达mRNA的生物学功能，研究人员进行了GO和pathway富集分析。结果显示，上调的mRNA与质膜，突触免疫，MHC class II蛋白复合体相关，主要参与免疫反馈，炎症反馈等生物学功能，涉及到的通路包括graft-versus-host disease, cytokine-cytokine receptor interactions，cell adhesion molecules等。该结果很好地说明了在pSS病人唾液腺中相关免疫炎症相关的基因表达变化。

4. lncRNA与mRNA关联分析

为了进一步理解pSS中的差异表达lncRNA的生物学功能，研究人员把差异lncRNA和mRNA进行共表达分析，共筛选到28个与8个lncRNA相关的mRNA。这些基因包括与chemokine signaling pathways, the nuclear factor-kappa B (NF-Κb) signaling pathway, TNF signaling pathway等相关的ICAM1，TLR9，TRAF1，CCL20和CD19等基因。该结果表明，在pSS病人中，这些lncRNA可能是通过影响这些免疫相关的生物学通路发挥作用。

研究结论

Shi H, Cao N, Pu Y, Xie L, Zheng L, Yu C. Long non-coding RNA expression profile in minor salivary gland of primary Sjögren's syndrome. Arthritis Res Ther.2016.

（转化医学网360zhyx.com）