2017年统计基因组学培训会

中国科学院院士和来自哈佛大学医学院、美国Broad研究所、Jackson Lab复旦大学、中国科学院等国内外高校、研究所的教授亲自授课！

本次培训为高端生物信息系列培训，内容是关于基因组学及NGS数据分析的综合性培训！包括基因组、转录组、表观基因组和癌症基因组里面常见和最新的分析方法！

全程中文讲解，理论讲授和上机操作搭配进行！

这是一次与国际最顶尖专家零距离交流与学习的难得机会！

联合主办单位：博奥生物集团有限公司 北京市计算中心

资助单位：Stanley Center for Psychiatric Research at Broad Institute of MIT and Harvard

培训地点：北京海淀区丰贤中路7号3号楼，北京市计算中心

培训时间：2017/3/27-2017/3/31

授课老师介绍

培训会日程计划表（初稿）

报名费用

报名优惠政策：

1、2017年2月28日前（含2月28日）报名缴费优惠500元。

2、3人以上团体报名每人可减少300元；

3、4+1团报，每人可享受85折。

4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式：

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称：北京市计算中心

账     号：0200151819100023937

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

（备注：在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名”）

请联系：

于老师   010-59341771，15600660904，邮箱：yurt@bcc.ac.cn

员老师   010-59341773，18701529461, 邮箱：yuanll@bcc.ac.cn

培训地点乘车路线：

公交：公交站点 —— “丰贤中路站”下车到达园区“北京科学技术研究院现代制造技术产业园（简称‘北科产业’），工作日门口一般会停放好几辆大巴（园区班车）。

公交路线：365 路、570 路到 丰贤中路站，438 路到 丰贤路口南站（下车后需沿丰贤中路步行 700 米）

地铁： 建议大家乘坐地铁，从4号线西苑站换乘16号线到永丰站下车，B口出，沿永盛北路直行，拐至丰贤中路上，步行约12 min。

陈润生教授为中国科学院院士，中科院生物物理所，中国科学院核酸生物学重点实验室学术委员会主任，创新课题组组长。研究方向：理论生物学、生物信息学、非编码RNA。现为国际人类基因组组织（HUGO）会员；国际数据库组织（CODATA）生物大分子专业组委员；国际纯粹及应用物理学会（IUPAP）生物信息学专业委员会委员；国际学术期刊《Journal of Theoretical Biology》编委。

陈润生院士是我国最早从事理论生物学、生物信息学以及非编码RNA研究的科研人员之一。二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究，曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组序列的组装和基因标识，曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。构建了收录非编码RNA及其基因的数据库NONCODE，以及收录非编码RNA与其它生物大分子相互作用的数据库NPInter，这两个数据库也已成为了国际在非编码RNA领域非常有影响力的数据库。共发表SCI学术论文200余篇，自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告二十余次。由于其在基因组信息学领域的早期工作，1996年9月29日至10月3日在日本筑波召开的第十五届国际科学技术数据委员会（CODATA）大会上应邀作“Kotani Memorial Lecture”，同时获得“小谷正雄”奖（“Kotani Prize”，生物领域）。2008年获何梁何利基金科学与技术进步奖；2012年获谈家桢生命科学成就奖；2013年获得国家科学技术进步奖二等奖（第一完成人）。

（2）    石乐明

国家特聘专家（千人计划第三批入选者），复旦大学生命科学学院教授、药物基因组学研究中心主任、复旦-张江临床基因组学联合研究中心主任；从事药物基因组学、精准医学、医学大数据、生物信息学及化学信息学等方面的研究。1985年湖南大学化学化工系分析化学本科毕业，理学学士；1988年中国科学技术大学近代化学系计算化学研究生毕业，理学硕士；1991年中国科学院过程工程研究所计算化学博士研究生毕业，工学博士，后留所任助理研究员（1991年）和副研究员（1993年）。1994年赴美国，先后在凯斯西储大学（研究助理）、美国国立健康研究院肿瘤研究所（访问学者）、美国食品和药品管理局（FDA）、美国家用（惠氏）及巴斯夫等机构和公司任（资深）研究科学家职务。2001年作为原创人之一加入深圳微芯生物科技有限责任公司，任信息学部主任，负责计算机辅助药物分子设计并创建了基于化学基因组学的创新药物研发和筛选平台。2003年作为资深研究员重新加入美国FDA，为阿肯色医科大学兼职研究教授，发起并领导关于基因芯片和新一代测序质量控制标准的MAQC/SEQC大型国际合作研究计划，其研究成果由Nature出版集团于2006年、2010年和2014年发行3个专辑，并建立了专门的网站予以重点推荐，美国FDA依此制订了相应的药物基因组学指南。发表学术论文200多篇（其中11篇发表于Nature Biotechnology），SCI引用7,000多次，单篇最高引用1,100多次，应邀参与10多本英文专著有关章节的撰写，在国际学术会议上做大会报告或特邀报告100余次。获4项创新药物化合物美国专利授权，两个化合物已进入中国III期临床试验，一个进入美国和日本临床试验；参与研发的一个原创1.1类新药西达本胺（爱谱沙？）于2014年被中国FDA批准上市，用于治疗复发及难治性外周T细胞淋巴瘤，1.1类原创抗糖尿病新药西格列他钠的3期临床试验即将完成，将于2017年申报上市。

（3）Shuhua Xu徐书华

现任中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员、研究组长、博士生导师，中国科学院“特聘研究员”，兼任上海科技大学特聘教授；2012年起担任德国马普学会与中科院共同支持的马普青年科学家小组组长。2013年入选国家“万人计划”第一批“青年拔尖人才”；2015年获国家杰出青年基金；2016年入选上海市优秀学术带头人；兼任上海市遗传学会常务理事、上海市人类学会理事、中国遗传学会青年委员会委员、《Molecular Genetics and Genomics》（德国）编委、《Human Genomics》（英国）编委、《Hereditas》（英国）编委、《Scientific Reports》（英国）编委、《BMC Genetics》（英国）编委（Section Editor）。长期致力于群体基因组学研究，专注于遗传和微观进化问题；发展和运用群体基因组学方法和计算生物学手段在人群的遗传结构、环境适应和微观进化机制研究方面取得了系统性的成果。国家自然基金委重点项目、中科院先导专项（B类）项目负责人。在Science，PNAS，AJHG等发表SCI论文70多篇；曾获全国百篇优秀博士论文、中科院青年科学家奖、上海市青年科技启明星（A类）、教育部自然科学奖（一等）、国家自然科学奖（二等）等。

（4）Hwai-I Yang 杨怀一

2006年于国立台湾大学公共卫生学院流行病学研究所博士毕业，2006 - 2011年在中央研究院基因组研究中心做博士后，2011-2013年为中国医药大学临床医学研究生院副教授和中国医药大学医院分子与基因流行病学中心副研究员，2012年至今为中央研究院基因组研究中心副研究员，2014年至今为国立阳明大学大学临床医学研究生院副教授。

杨怀一教授的研究方向有：

（1）肝炎流行病学：使用纵向随访研究描述慢性乙型和丙型自然病史中里程碑转变和疾病进展的发生率和决定因素。

（2）转化流行病学：开发和验证风险预测工具，其中纳入了多个非侵入性临床参数，用于预测慢性乙型和丙型肝炎的标志物转换和不良后遗症。

（3）病毒性肝炎的免疫流行病学：使用高通量分子和基因组技术，包括全基因组关联研究，下一代测序，多重蛋白质测定和聚糖阵列，研究宿主免疫因素对病毒性肝炎的重要作用。

（4）主要癌症的免疫预防：探索有用的基因组，蛋白质组和糖基预诊断生物学特征，用于预测主要癌症，以开发癌症早期诊断和癌症预防性疫苗的新策略。

（5）Yi-Hsiang Hsu许益祥

许益祥教授，毕业哈佛医学院基因医学组，现任哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心衰老疾病中心主任，同时担任麻省理工-哈佛大学Broad研究所和哈佛医学院定量基因组学助理教授，哈佛公共卫生学院分子和综合生理科学副教授。

许益祥教授为统计遗传学家/计算生物学家，研究方向有：（１）衰老相关常见疾病的遗传贡献（如骨质疏松症，sarcopenic肥胖、代谢综合征、2型糖尿病和高血压），基于群体的NGS，如全基因组测序，外显子组测序和全基因组关联方法，用于识别与复杂特征相关的常见和罕见变异。（2）使用由ENCODE和美国NIH路线表观基因组学项目产生的组织和细胞特异性基因调控状态来预测GWAS位点的非编码致病变体和靶基因； （3）多表型关联分析的统计方法开发； （4）使用系统遗传学和生物功能方法整合组学数据（基因组学，转录组学，表观基因组学，蛋白质组学和代谢组学） 和（5）使用代谢组学鉴定骨质疏松的生物标志物。

（6）Hailiang Huang黄海亮

2012年毕业于约翰霍普金斯大学医学院生物医学工程系，师从Joel Bader博士，主要研究方向是计算生物学，系统生物学以及人类遗传学。毕业后，黄博士加入麻省总医院Mark Daly博士的研究团队，从事人类基因组学研究。黄博士通过测序和分型分析人类基因组，结合生物网络和系统生物学的手段，找出和疾病相关的遗传信息，并研究疾病发生的机理。黄博士的研究成果发表在Nature, Cell, Genome Research, PLoS Genetics等多家期刊，并拥有美国专利一项。其中关于全基因组关联研究方法的文章（GWiS）被广泛用于寻找与心血管疾病、精神分裂症、自闭症、老年痴呆等遗传疾病有关的基因。

（7）WenPing Lee李婉萍

国立台湾大学电子工程博士学位，获得学校杰出研究奖，曾在波士顿学院任高级研究员和博士后，并在卡内基梅隆大学做访问学者，目前就职于Jackson Lab for Genomic Medicine。李婉萍博士也是千人基因组项目中的一员，拥有生物信息学，电气工程，计算机科学和商业的多学科背景，并开发了若干生物信息学工具，比如短序列比对软件MOSAIK，突变预测软件TANGRAM，以及SIMD Smith-Waterman算法实现。李婉萍目前的研究工作是开发基于图表的参考基因组，以用于代表大量的完整基因组。

（8）Lori Chibnik

生物统计学家，在哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和哈佛大学医学院任助理教授。Chibnik博士在国际卫生领域获得公共卫生硕士学位，并在波士顿大学研究疾病风险预测模型方法，获得生物统计学博士学位。Chibnik博士在其职业生涯中，已经开发并评估了多个疾病的预测模型，如HIV，产前筛查和自身免疫性疾病的预测模型，并将其应用于各种疾病。

Chibnik博士目前的研究兴趣是阿尔茨海默病和老年痴呆的遗传学和基因组学，侧重于纵向队列。除研究工作外，Chibnik博士设计的培训班和创新的教学技巧也在国际上具有知名度，已经为不同的国家和机构开发了多个生物统计学课程，其最近一个培训班系列是为非洲地区科学家的而开发的。目前，Chibnik博士在哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和Stanley Center for Psychiatric Research at Broad Institute 主持全球神经精神疾病遗传学培训计划。

（9）张智

高级工程师，2011年毕业于北京协和医学院清华大学医学部，获工学博士学位。现任博奥生物集团有限公司转化生物信息研究院副院长。从事生物医学大数据研发6年，目前主要的研究领域为生物医学大数据分布式计算、管理和建模。在相关研究领域作了系统的研究，获得软件著作权21项，发表科研论文6篇。主持开发多个基于Hadoop分布式计算架构的生物医学大数据处理系统；主持设计和开发PB级生物组学数据管理系统；主持设计和开发包括组学、体检、临床电子病历、环境、日常体征等类型数据的健康大数据平台，通过对大数据挖掘分析，建立健康预测模型，并提供相关的干预建议和指导，以交互式的方式持续改善用户的健康状况；作为骨干成员参与国家863重大项目“生物大数据开发与利用关键技术研究”的《基于区域医疗与健康大数据处理分析与应用研究》子课题，针对20余万人次的健康体检数据，构建了分布式数据仓库，并利用机器学习技术建立了若干疾病的预测模型。

（转化医学网360zhyx.com）