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腾讯登录【战新冠】发现新型变异病毒快速增长，海外感染比例远超中国！
| 导读 | 截至4月20日，“战新冠”平台一共收集到来自65个不同国家和地区的5506条新冠病毒的全基因组序列，与2月21日报告的结果相比，数据量增加近47倍。 |
战新冠@志诺维思
fight-sars2@genowis.com
2020年4月21日
摘 要
“战新冠”（fight-sars2.genowis.com）致力于监测新冠病毒的变异及演化动态，希望通过世界各地的新冠病毒序列分析出疫情期间，病毒所发生的变异及其群体变化。截至4月20日，“战新冠”平台一共收集到来自65个不同国家和地区的5506条新冠病毒的全基因组序列，与2月21日报告的结果相比，数据量增加近47倍。我们发现在所有的变异当中，有一支变异（S:D614G）毒株从二月下旬开始快速传播，并成为了所有序列中占比最大的株群（59.6%），该变异的毒株主要分布于欧洲、美国和澳大利亚等地区，在中国（共21条）含该变异毒株群比例为7.6%(21/276)，美国（885条）该变异毒株比例高达61.2%，除中国以外其他国家和地区含有该变异的毒株比例高达62.8%。这是一个值得大家警惕的消息，虽然国内的新冠肺炎疫情防控已经取得了初步有效的控制，但是严格防控海外输入病例的策略接下来仍是“战疫”主题。
考虑到S:D614G变异发生在新冠病毒的S蛋白（刺突蛋白，Spike glycoprotein）上，而该蛋白与人体ACE2蛋白结合又正是新型冠状病毒感染人体细胞的关键[1]，我们完全有理由猜测S:D614G变异可能增强了S蛋白与ACE2蛋白的结合能力，更容易地将病毒包膜与细胞膜融为一体，从而将病毒内的遗传物质注入细胞，达到感染细胞的目的。4月19日李兰娟院士团队发表在医学预印本平台medRxiv的研究发现与S:D614G变异毒株（主要发现于欧美）的同簇分离株ZJU-1在感染Vero-E6细胞24小时后，病毒载量是ORF8:L84S变异毒株（主要发现于武汉）分离株ZJU-2和ZJU-8的19倍[2]，表现出了更强的毒性与传播能力。这一发现在一定程度上印证了我们的猜想，但还需要更直接的证据去加以验证，这也有可能是近一个月欧美感染确诊人数急剧上升的原因之一。
图（a）历史最大变异群体的占比：该曲线图展示了所有株群中，群体最大的毒株群占所有毒株的比例随时间变化的趋势。最大群体的占比从其成为最大群体的当天开始统计，历史最大群体的占比统计将持续被统计；（b）变异株群S:D614G的群体在全球范围内的分布。
声明与致谢
本文为作者原创内容，任何单位或个人转载请回复本微信公众号获得授权，转载时务必标明来源链接及公众号名称，否则追究法律责任，如有问题可发信至fight-sars2@genowis.com。本文所展示分析结果及图表均来自“战新冠”病毒基因变异动态监测平台（fight-sars2.genowis.com），该平台依托于志诺维思基因组大数据分析系统“智能基因云”(igenomecloud.com) 和世界领先病毒分析技术Nextstrain（nextstrain.org）实现。文中提及的新冠病毒基因组数据来自于国家基因组数据中心、国家基因库以及GISAID平台授权共享使用，我们衷心感谢各位研究者的贡献。
查看全文请点击Sars-Cov-2_2020-4-20或关注志诺维思“基因智慧”公众号
参考文献
[1] Renhong Yan, Yuanyuan Zhang, Yingying Guo, Lu Xia, Qiang Zhou. Structural basis for the recognition of the 2019-nCoV by human ACE2. bioRxiv 2020.02.19.956946; doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.19.956946.
[2] Hangping Y, Xiangyun L, Qiong C, et al. Patient-derived mutations impact pathogenicity of SARS-CoV-2. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.14.20060160v1.full.pdf.
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