【Nature子刊】利用空间转录组学技术，创建结肠基因图谱——获得肠道疾病新见解！

卡罗林斯卡医学院的研究人员利用一种名为空间转录组学的技术，分析了小鼠结肠中的基因表达，并创建了一个图谱，显示组织中单个基因的表达位置。当他们将之前已知的人类转录数据叠加到图谱上时，研究人员获得了对炎症性肠病(IBD)的新见解。相关研究发表在《Nature Communications》杂志上，题为“The spatial transcriptomic landscape of the healing mouse intestine following damage”。

该小组利用一种被称为空间转录组学(ST)的技术绘制了小鼠结肠中单个细胞的基因活性图谱。据研究人员称，这是第一次有人能够可视化整个健康和损伤后恢复时肠道的基因表达景观。

卡罗林斯卡医学院Solna医学系的博士，该研究的通讯作者Eduardo J. Villablanca说：“我们的空间转录组学驱动可视化使我们能够发现几个以前未知的方面，比如结肠被分成比人们想象的更多的区段。”

当将研究结果与已知的来自人体组织的转录数据结合后，科学家们注意到小鼠和人类的某些肠道细胞的位置是相同的，这使得该模型成为了解不同疾病，如IBD如何影响结肠的工具。

在早期的研究中，Eduardo J. Villablanca的研究小组表明，溃疡性结肠炎可以分为两个基因表达不同的亚组。参照新的图谱，他们能够表明，在损伤更严重的组织中发现了更难治疗形式疾病的基因。

Villablanca说：“同样，基因图谱可以用来观察结肠中人体细胞活跃的地方，这可以为开发新的治疗方法和药物做出重大贡献。”

以一种新颖的方式来应用技术

空间转录组学是由KTH皇家理工学院和卡罗林斯卡医学院的科学家在SciLifeLab开发的。它允许可视化组织中的基因表达。然而，为了可视化像结肠这样的长管状器官，这项研究背后的研究人员以一种新颖的方式应用了该技术。通过像瑞士卷一样卷起结肠，他们设法拟合并绘制了一个长器官的整个基因表达景观。

Villablanca解释说：“我们现在想用同样的方法为所有消化器官创建一个类似的图谱，从口腔到直肠。我们的目的是为所有这些组织的基因表达创建一个参考图谱。”

整个消化器官的基因图谱将在许多方面有用，例如用于探索肠道细菌和细胞基因表达之间的联系，并用于更好地理解不同的饮食如何影响其各种功能。（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://medicalxpress.com/news/2022-02-colonic-gene-insights-intestinal-diseases.html

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。