新浪登录
腾讯登录【新品】癌症检测/HPV筛查新工具——可冻干尿液直扩基因分型检测
| 导读 | 迈迪安推出了全新的Lyo-ReadyTM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液 |
基因分型检测
基因分型检测（Genotyping）可用于遗传疾病诊断，识别疾病风险因素，并指导治疗决策。单点突变，例如单核苷酸多态性（SNPs），是人类基因组中最常见的遗传变异类型，在个体遗传多样性方面发挥着重要作用。
虽然并非所有的单点突变都会产生功能性后果，但有些突变会显著影响基因功能或蛋白质结构，这反过来会增加/降低个体患癌症等疾病的风险。
在体外诊断中，SNPs检测常用于传染病检测、癌症标志物检测、 对治疗药物耐药的鉴定，无创产前检测及药物基因组学的研究等。
常用于SNPs检测的样本包括有血液、唾液、尿液、粪便和FFPE样本。相对比血液或唾液等其他生物样本，尿液通常含有较低浓度的DNA，因此使用尿液样本的基因分型检测可能相对具挑战性。而且尿液中含有PCR抑制物（如尿素、核酸酶等），以及对检测灵敏度的要求，都有可能会影响基因分型检测的成功率。
但是随着基因分型技术的进步，从尿液样本中提取DNA并对其检测分析已可以用于各种诊断应用，包括：
• 传染病检测: 例如性传染病，包括HPV分型检测，和尿道感染等
• 癌症标志物检测： 用于诸如膀胱癌等癌症早期检测
• 无创产前检测 (NIPT): 从孕妇尿液中的无细胞胎儿DNA筛查胎儿遗传性异常
• 药物基因组学: 识别影响个体对某些药物反应的基因变异
• 流行病学研究: 用于群体遗传学研究，以深入了解各种特征或疾病的遗传基础
Lyo-readyTM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液
迈迪安推出了全新的Lyo-ReadyTM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液，其先进的配方能够从尿液样本中超灵敏地扩增SNPs和其他位点突变，并且对样本中可能破坏DNA和抑制PCR反应的尿素和核酸酶具有超强耐受性。
此外，该试剂既能用于液体体系也能通过冻干用于开发常温稳定的检测，是用于POC设备的理想选择。
Lyo-ReadyTM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液结合了先进的化学缓冲液配方、PCR增强剂和优化的抗体热启动聚合酶，可以直接在尿液样本（或运输保存液）存在PCR抑制物的情况下，实现快速、精确并且可重复的SNP检测，获得卓越的等位基因鉴别和集群分布。
01 产品亮点 Highlights
• 超灵敏：可直接从FFPE粗处理样本中检测低至1拷贝靶标
• 抗抑性：对尿液样本中的抑制物（如尿素、核酸酶）和运输保存液中的抑制物（如阴道拭子的UTM）具有超强耐受性
• 特异性：紧密的荧光簇，可清晰地区分等位基因，非常适合困难的SNP
• 可冻干：可用于液体体系或冻干使用，是高通量或POC检测的理想选择
02 性能数据 Performance
以下测试主要针对其在HPV及癌症相关基因突变检测中的性能进行对比检测，此外还检测了其灵敏度及冻干稳定性。所有检测均针对尿液或UTM样本的直接扩增（无核酸提取步骤），反应条件如下：
对HPV -16型的突变检测
HPV有多种类型，其中HPV 16型和18型属于高危型病毒之一，与宫颈癌、膀胱癌的发生密切相关 ，是十几种高危型里面致癌能力最强的类型。
研究发现，HPV 16型病毒 的E6-T350G突变可能与宫颈癌和口咽癌细胞的增殖有关1。
分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液 (MDX158), B/ KAPA Probe Force qPCR Mix (Roche), C) TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix (ThermoFisher) 和 D) Type-it Fast SNP Probe PCR Kits (Qiagen) 对40% UTM样本中的人乳头瘤病毒（HPV）16型 E6-T350G突变进行检测。等位基因G（蓝色）和 等位基因T（红色）的纯合样本，等位基因G/T的杂合样本（绿色），与NTC（黑色）进行比对，图中x表示未确定。
结果显示，与对比试剂相比，Lyo-ReadyTM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对UTM样本的直接检测具有更紧密的集群分布，对临床相关的突变位点具有更准确的分辨。
对10%人体尿液中胰腺癌相关的KRAS-G12D突变检测
约35%的胰腺癌患者体内出现KRAS-G12D的突变。通过小鼠实验研究，目前已经确定了一种有效的实验药物，该药物可以直接靶向作用于具有这种突变的胰腺肿瘤2。
分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液, B/ Kapa Probe Force, C/ TaqPath™ 和D/ Type-it Fast Kits对10%人体尿液样本中胰腺癌癌症细胞系SU.86.86的胰腺癌相关的KRAS-G12D 突变DNA（SNP编码：rs121913529) 进行检测。等位基因A（蓝色）和 等位基因G（红色）的纯合样本，等位基因A/G的杂合样本（绿色），与NTC（黑色）进行比对，图中x表示未确定。
结果显示，与对比试剂相比，Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对人体尿液样本中癌症相关的SNPs具有更准确的鉴别。
对20%人体尿液样本中宫颈癌相关的p53突变检测
根据Meta分析显示，p53 rs1042522 C>G 突变可增加宫颈癌风险3。
分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液, B/ Kapa Probe Force, C/ TaqPath™ 和D/ Type-it Fast Kits对20%人体尿液样本中宫颈癌相关的p53突变（SNP编码：rs1042522) 进行检测。等位基因G（蓝色）和 等位基因C（红色）的纯合样本，等位基因C/G的杂合样本（绿色），与NTC（黑色）进行比对，图中x表示未确定。
结果显示，与对比试剂相比，Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对20%尿液样本中的p53突变具有更准确的等位基因分辨。
对30%人体尿液样本中膀胱癌相关的PAI1突变检测
膀胱癌是最常见的癌症之一，具有较高的复发率。最近的研究表明SNP rs7242使纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI1）的抗凋亡作用升高，导致更高的膀胱癌复发风险4。
分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液, B/ Kapa Probe Force, C/ TaqPath™ 和D/ Type-it Fast Kits对30%人体尿液样本中膀胱癌相关的PAI1突变（SNP编码：rs7242) 进行检测。等位基因G（蓝色）和 等位基因T（红色）的纯合样本，等位基因G/T的杂合样本（绿色），与NTC（黑色）进行比对，图中x表示未确定。
结果显示，与对比试剂相比，Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对30%尿液样本中的PAI1突变具有更准确的等位基因分辨。
超高灵敏度和可重复性
使用Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对10%人体尿液样本中10倍连续稀释的合成DNA进行qPCR检测（分别为10000、1000、100、10和1个拷贝）。结果显示，Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液在有PCR抑制物存在时，对低拷贝和高拷贝DNA模板的检测依然具有超高的灵敏度和可重现性。
冻干后可常温保存12个月以上
Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液冻干后在37°C下保存1个月后（红色）进行稳定性检测，将其复溶后与新鲜配置的液体体系（蓝色）进行对比,对10%人体尿液进行直接检测。冻干后的试剂与新鲜液体体系具有A) 相同性能 ，以及B)相同的等位基因分辨能力 （等位基因AA（红色）和等位基因CC（蓝色）为纯合样本，等位基因A/C为杂合样本（绿色），与NTC（黑色）进行比对，图中x表示未确定） 。结果显示，Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液冻干后常温下储存稳定性超过18个月以上。
03 产品信息 Information
扫描订购样品
参考文献
1. Kottaridi, C., et al. The T350G Variation of Human Papillomavirus 16 E6 Gene Prevails in Oropharyngeal Cancer from a Small Cohort of Greek Patients. Viruses 2022 14:1724. doi: 10.3390/v14081724
2. Kemp, S.B., et al. Efficacy of a Small-Molecule Inhibitor of KrasG12D in Immunocompetent Models of Pancreatic Cancer. Cancer Discov.2023 13(2):298-311. doi: 10.1158/2159-8290.CD-22-1066.
3. Yu M., et al. Associations of MDM2 rs2279744 and TP53 rs1042522 polymorphisms with cervical cancer risk: A meta-analysis and systematic review.Front Oncol, 2022 12, 973077. doi: 10.3389/fonc.2022.973077.
4. Murakami K., et al. Association of SNPs in the PAI1 Gene with Disease Recurrence and Clinical Outcome in Bladder Cancer. Int J Mol Sci.2023 24(5):4943. doi: 10.3390/ijms24054943
RANSON B M. HIV diagnostics：current recommendations and opportunities for improvement[J]. Infect Dis Clin North Am，2019，33（3）：611-628.
迈迪安的所有产品都可以提供商业大规模生产，符合ISO13485标准，并大量用于全球各种获得认证的商用检测中。
END
（转化医学网360zhyx.com）
还没有人评论，赶快抢个沙发