会议邀约丨安捷伦NGS Panel创新设计方法最新解密---灵活定制、性能可靠、适配不同应用场景
导读 | 2025年3月10日14:00-15:00,《安捷伦NGSPanel创新设计方法最新解密》 |
无论科学研究亦或是临床诊断,但凡与二代高通量测序相关的科学项目,“NGS Panel”作为一个工作流程中的高频词汇,代表了研究者所关注的基因组上的目标区域和实际测序需求,实际上指的是捕获目标物种基因组上不同目标区域的一组探针,按照产品定位、应用场景等的不同,在panel大小、覆盖度、均一性等方面有着不同的考量。

如何快速简单的设计出一款性能优异的NGS panel,是痛点也是难点。
以人类的基因组为例,其包含23对染色体,约31.6亿个DNA碱基对,约20000到25000个基因,每个基因又分为外显子,内含子,UTR等功能单元,还要考虑CG/AT含量、碱基串联重复等等对探针设计的影响;除了生物学层面的考虑,在探针生产、探针选择与铺设、探针合成、交付准确度与速度方面,也极具挑战;开发定制一款优秀的 NGS panel仍然是一项需要投入大量时间精力和费用的过程。
安捷伦 SureDesign 在线设计平台可为用户提供便捷的定制化服务。
SureDesign是一款基于网页的应用程序,安捷伦客户无需额外付费即可使用。在 SureDesign 中,用户可以选择预定义内容或构建自己的内容,浏览并购买安捷伦的目录 Panel 和自定义设计,也可以与其他研究人员进行合作。安捷伦多年的制造专业知识,可确保用户进行更灵敏,更灵活的探针设计,得到性能稳定可靠的探针。
病原领域的 ACD Panel
安捷伦能够提供非常丰富的病原检测产品,利用不同的SureSelect NGS 基因panel,靶向致病菌和病毒的基因组,直接从各种临床研究样品(包括血液、血清、血浆、粪便和鼻咽抽吸物)中捕获遗传物质。
这些基因panel可作为研究病原体基因组序列的工具,无需预先培养或 PCR 富集病原体。在抗生素耐药性、疾病治疗和疫苗接种等研究工作中使用。
以呼吸道病毒/细菌的NGS监测为例,安捷伦SureSelect NGS 基因panel可以覆盖的病原包括了流感病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、人偏肺病毒、腺病毒、肺炎支原体、军团杆菌等等,并且可实现基因panel的客户自定义,满足更多更个性化的检测需求。

模式生物领域的 ACD Panel
模式生物全外显子组设计,模式生物外显子组测序是一种强大的研究工具,可用于研究基因改变对疾病、治疗和环境变化的影响,研究人员需要外显子组设计,以便为模式生物开展具有成本效益的基因组学研究。
下面中的三种模式生物 All Exon 设计,其成本仅为大型定制试剂盒的一小部分。这些 All Exon 设计是与在各自模式生物遗传学方面具有深厚专业知识的研究人员合作创建的。

小鼠和大鼠甲基化设计(与约翰·霍普金斯大学合作设计)
肿瘤领域的 ACD Panel
在肿瘤领域,安捷伦和国际顶级研究者进行合作,开发了诸多NGS panel,包括针对实体肿瘤、血液肿瘤的不同应用,针对TMB、HRR等不同标志物,针对不同捕获方法和适配手动/自动化的panel,极其丰富的panel可供选择。
以与英国顶尖格拉斯哥大学的合作为例,包括针对实体瘤和血液肿瘤的三款不同panel,可兼容不同的样本类型,分别定位与标志物发现,临床诊断等研究目标。

欲了解更多panel技术细节与产品信息,请参考安捷伦官网,
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