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【Nature子刊】山东大学与哈医大肿瘤医院：新发现！可识别乳腺癌患者预后的新策略
我们对采用ypN0的Miller-Payne分级为4/5级TNBC患者的回顾性研究显示，与采用ypN0的Miller-Payne 4组相比，采用ypN0的Miller-Payne 4组的5年无病生存率(DFS, 63.8% vs. 83.0%， p = 0.003)和5年总生存率(OS, 71.0% vs. 85.5%， p = 0.007)均低于采用ypN0的Miller-Payne 5组...
【研究前沿】重庆大学附属三峡医院印明柱教授团队发表基于图深度学习的空间转录组空间域识别框架
【转化医学网报道】单细胞测序和空间转录组学是前沿的生命科学技术，有助于推动基因组学科技创新，提高我国在生命科学领域的科研水平和竞争力。基于人工智能的空间转录组学数据分析有利于探究组织的生理状态和疾病机制、识别细胞转录因子和基因调控网络、揭示细胞亚型的异质性和多样性、发现潜在的治疗靶点，为研究疾病诊断、预防和治疗提供重要的基础数据和科学依据。 ...
使用纳米孔测序对 BRCA1 和 BRCA2 基因进行表征和变异识别
纳米孔测序与混样扩增测定配合使用时，可进行BRCA变异检测；与自适应采样配合使用时，可同时测定突变和甲基化状态。 BRCA1和BRCA2在通过DNA修复维持基因组稳定性方面发挥重要作用 图1BRCA 突变a) 和癌症风险b) 突变破坏的机制c) 基因座 BRCA1和BRCA2基因中致病变异或启动子的高甲基化可导致若干种癌症的风险...
【Science 子刊】新发现生物标记物！有望识别“癌中之王”的早期风险
该发现于 3 月 17 日在线发表在《科学进展》（Science Advances) 杂志上，标志着朝着临床方法迈出重要的第一步，该方法用于对胰腺上癌变风险最高的病变进行分类，有可能在它们开始扩散之前将其去除。 https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ade4582 研究背景 01 ...
研究人员分析T细胞识别针对所有冠状病毒的靶标
在最近发布到 bioRxiv上的一项研究中，研究人员分析了 T 细胞对 α 和 β 普通感冒冠状病毒的反应性，为泛冠状病毒疫苗概念的开发提供信息。研究发现，早期的广泛和多抗原性T细胞反应可以解决SARS-CoV-2感染，并有助于降低病毒载量。 免疫显性T细胞区域 01 研究发现，虽然中和抗体（nAb）会随着时间的推移而减弱，但T细胞...
【Nature子刊】“点击”化学的又一应用：精准识别癌细胞蛋白，助力疾病追踪
10月25日，弗朗西斯·克里克研究所和伦敦帝国理工学院的研究者于《自然通讯》（Nature Communications）发表了题为“Cell-specific bioorthogonal tagging of glycoproteins”的文章。此研究展示了称为“生物正交细胞系特异性标记糖蛋白（BOCTAG）”的新策略。运用该策略，研究者可以识别特定类型细胞释放的蛋白质（即使这些细胞处于具...
【Science子刊】新方法！加州大学团队创建“CAR pooling”筛选识别最有效的癌症免疫治疗细胞
2022 年 11 月 9 日发表在《Science Translational Medicine》上的研究论文“Pooled screening of CAR T cells identifies diverse immune signaling domains for next-generation immunotherapies”，报道研究团队使用这种被称为“CAR Pooling”的...
【NUCLEIC ACIDS RES】编辑效率91%！苔藓RNA编辑因子识别900个人类转录组脱靶点
苔藓RNA编辑因子 在活细胞中，存在着许许多多的信息流（traffic），如同置身与一个大型施工现场。在陆地植物中，DNA形式的蓝图不仅储存于细胞核中，还存在于线粒体（细胞的发电厂）和叶绿体（光合作用单元）之中。这些蓝图指导着蛋白质的构建，进而支持生命体的代谢过程。然而，蓝图信息是如何在线粒体和叶绿体中传递的呢？——通过创建蓝图的转录本（RNA）来实现。转录本（RNA）随...
【JMD】突破！新PCR检测——不仅能诊断COVID-19，还能识别SARS-CoV-2变体！
新型冠状病毒（COVID-19）大流行开始后，Research Path LLC和罗格斯大学的研究人员迅速投入资源开发准确可靠的COVID-19检测方法。随着变异株的出现，他们开发了一种基于分子信标的PCR检测方法，该方法不仅能诊断COVID-19感染，而且还可以识别导致感染的特定变异。他们的研究发表于《The Journal of Molecular Diagnostics.》，题为：“M...
【Nature子刊】看眼睛就能识别心脏病？
科学家们开发出了一种人工智能(AI)系统，可以分析在眼镜店或眼科诊所常规就诊时拍摄的眼部扫描，并识别心脏病发作高风险的患者。 医生已经了解到，视网膜中微小血管的变化是更广泛血管疾病的指标，包括心脏的问题。 在由利兹大学领导的研究中，深度学习技术被用来训练AI系统自动读取视网膜扫描，并识别那些在接下来的一年中，有可能心脏病发作的人。 深度学习是一系列复杂的算...
【Nature子刊】识别“不可见”的微生物 ——HiFi测序技术来完成
微生物无处不在——在我们的肠道中，在我们的皮肤上，渗透到我们周围的环境中。研究这些微生物群落对疾病和良好健康提供了巨大的见解，但在样本中识别所有不同的物种可能是一个挑战。 现在，一个国际研究团队的一项研究表明，高精度、长读长的基因组测序技术(HiFi)可以为这种之前被隐藏的生物学带来曙光。 加州大学圣地亚哥分校计算机科学与工程系、美国农业部、生物技术公司Pacific...
【Nature子刊】通过微生物组组成更准确地识别结直肠癌
为了更高效地研究结直肠癌，来自塔尔图大学的微生物组科学家已经能够表征用于结直肠癌筛查的样本管中的微生物组组成，用于检测粪便潜血。该文章近期发表在《Scientific Reports》期刊上，名为 “Using fecal immunochemical tubes for the analysis of the gut microbiome has the potential to impr...
【柳叶刀子刊】准确率88%！刷脸就能快速识别128种遗传疾病？这不是“天方夜谭”，新儿童遗传综合征评估模型做到了
美国华盛顿国立儿童医院的研究人员开发了一种新的生物特征分析工具，可以通过观察儿童的面部特征来筛查128种基因疾病。虽然该工具尚未被批准用于患者护理，但它已获得MGeneRx的许可，以寻求监管部门的批准和商业化，将其用作诊断和筛查工具。 研究人员本月早些时候在《The Lancet Digital Health》发表了题为“Development and evalua...
【进展】癌症基因反复突变怎么办？这一招有利于识别高度相似的基因！
研究人员已经开始获得以前隐藏的体细胞突变在癌症样本基因组中的非独特区域，包括编码区域和调节元素。 在人类演化过程中，基因组的某些部分经历了重新复制和重新排列，导致不同的部分彼此相似。但是，许多当前的基因测序工具需要依赖于短读测序技术，因此把这些类似的部分区分开来，从中识别基因发生了突变可能比较棘手。据弗朗西斯·克里克研究所（the Francis Crick Institute）马克西姆·塔拉比...
【科研转化】贾伟平教授团队研发人工智能系统DeepDR 精准识别糖尿病视网膜病变
近日，上海交通大学附属第六人民医院内分泌代谢科、上海市糖尿病研究所、上海市糖尿病临床医学中心贾伟平教授课题的最新研究成果在线发表于Nature子刊Nature Communications。该研究基于全球最大的眼底图像数据库，创新性研制迁移强化的多任务学习框架，构建了糖尿病视网膜病变辅助智能诊断系统——DeepDR，实现了对糖尿病视网膜病变从轻度到增殖期病变的全病程自动诊断，并能对眼底图像的...
【Nature子刊】质的飞跃！加州大学旧金山分校识别出对阿尔茨海默氏症最脆弱的神经元！
阿尔茨海默氏病是一种破坏性疾病，该疾病的主要原因是大脑中神经元和某些脑细胞的丢失，也称为变性。这种退化导致记忆和其他认知功能出现障碍。 最近，加州大学旧金山分校的一项新研究表明，表达一种特定蛋白质的神经元更容易变性。他们发现，在阿尔茨海默氏病早期阶段，这类神经元的数量下降了近50％。 该研究于...
【Nature】重磅！CRISPR筛选识别182种免疫逃逸癌基因
人的健康主要靠免疫系统来维护的，如果免疫系统没有识别到异物并进行“消灭”，那么人就会生病，例如癌症。 今天介绍的是国外研究筛选工具可查找出帮助癌细胞逃避免疫系统“追杀”的基因。这样研究的意义在于：虽然免疫系统不能发现狡猾的癌细胞，但我们借助于基因筛查来发现对治疗有帮助的基因。 &em...
【JAMA子刊】人工智能系统识别乳腺癌，准确度媲美放射科医生
早期乳腺癌往往不具备典型的症状和体征，不易引起重视，但乳腺癌的早期发现、早期诊断，是提高疗效的关键。近日，瑞典有研究人员比较了三种人工智能（AI）算法识别乳腺癌的能力。事实证明，其中一种算法与普通放射科医生一样准确，该研究可能为将来乳腺癌的筛查提供指导。 该研究于8月27日发表在《美国医学会杂志》肿瘤学分册（JAMA Oncolog...
【Science】免疫疗法+微生物疗法加强免疫系统识别和攻击癌细胞
几种肠道细菌与检查点阻断免疫疗法的功效增强相关，但微生物组增强抗肿瘤免疫力的潜在机制尚不清楚。科学家们提出疑问：哪种肠道细菌可以帮助人体免疫系统抵抗癌性肿瘤，以及如何做到这一点；另外，为什么在某些情况下有效的免疫疗法是一种能增强人体免疫反应的癌症疗法，而在另一些情况下却无效。 加拿大卡尔加里大学卡明医学院（CSM）的斯奈德慢性病研究...
【Nature子刊】NB Seq最新进展：全外显子组测序可帮助识别新生儿先天性代谢缺陷
2015年，加利福尼亚大学旧金山分校的Robert Nussbaum教授团队推出了一个名为“Newbie Seq”（NB Seq）的项目，旨在探索新生儿代谢性疾病。通过将测序数据和质谱结果相结合，希望能够降低代谢性疾病检测的假阳性率。NB Seq已经成为美国国家卫生研究院(NIH)的基因组测序项目和新生儿疾病筛查研究项目。 近日，该...