3篇Science文章：大规模人类基因表达差异图谱

在美国国立卫生研究院基因型-组织表达（GTEx）项目的资金资助下，研究人员构建出了一个万众期待的新数据资源，它可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。借助于这一新资源，科学家们可以同时探究许多不同人类组织和细胞的潜在基因组学，并有望为研究和了解人类生物学开辟新途径。

GTEx的研究人员将他们为期两年研究的初步结果发布在5月7日《科学》(Science)和其他期刊的多篇研究论文中。这些研究工作使人们重新认识了在不同的组织中基因组变异是如何控制基因的开启和关闭方式与时间，表达和沉默基因的数量，以及如何使得人们容易罹患癌症、心脏病和糖尿病一类的疾病的。

在一篇主要的Science文章中，研究人员分析了来自175名个体和43个不同组织类型的1,600多个组织样本的基因活性读值。研究人员通过测量RNA来评估了基因的活性。他们致力分析了9种最容易获得的组织类型的样本，包括脂肪、心脏、肺、骨骼肌、皮肤、甲状腺、血液、胫动脉和神经。

每个细胞的基因组蓝图都是相同的，但随着时间的推移开启及关闭的一组基因以及这些基因的表达水平却造成了肾细胞和肝细胞的差异。GTEx研究人员借助于一种叫做表达数量性状基因座(eQTL)分析的方法，测量了变异对基因表达活性的影响。eQTL是指特定基因组位置上的一个变异与特异组织中基因活性水平的关联。GTEx的其中一个目标就是要鉴别出所有基因的eQTLs，并评估它们是否对多个组织造成了影响。

研究人员发现了一组在不同组织类型之间具有普遍活性的变异。事实上，大约一半蛋白质编码基因的eQTLs在所有9种组织中活化。他们在研究的每种组织中鉴别出了大约900-2,200个eQTL基因――与附近基因组变异有关联的基因，所有的组织则有6,486个eQTL基因。

论文的公共通讯作者、哈佛-麻省理工Broad研究所GTEx实验室数据分析与协调中心负责人Kristin Ardlie说：“我们不知道在不同的组织中这种调控有多么特异。分析结果表明，大量变异的效应跨越多个组织，同时有几组变异显示组织特异性效应。”

（转化医学网360zhyx.com）