复旦大学发表全球第一个脑膜脓毒黄杆菌 全基因组完成图

  复旦大学基础医学院陈力课题组在国际上第一次获得了完整的脑膜脓毒黄杆菌全基因组序列，为该菌的基础及临床应用组学研究奠定基础。研究成果于2015年6月25日发表在最新一期Genome Announcements（基因组通报）杂志上。文章的主要作者有，孙桂芹，王蕾，策力木格和陈力等。
  脑膜脓毒黄杆菌，学名为脑膜炎败血伊丽莎白金菌（Elizabethkingia meningoseptica），是伊丽莎白·金博士于上世纪五十年代末从脑膜炎和败血症病人的体液中分离得到的病原菌。脑膜脓毒黄杆菌感染多发于免疫力低下的住院病人，感染后可导致脑膜炎、败血症和肺部疾病。该菌对多种临床常用抗生素耐药，感染致死率在百分之二十五以上。该菌感染呈区域性特点，在我国大陆和台湾地区的发病率显著高于欧美等其它国家和地区。该菌与从传播疟疾的按蚊上分离得到的按蚊黄杆菌高度同源。因此，开展脑膜脓毒黄杆菌的组学研究具有重要的生物学和临床意义。
  人类全基因组完成图，作为基因组分析的标准参考序列，是人类组学研究和遗传医学的核心。全基因组完成图的获得也是开展其它物种基础和临床组学研究的必要条件。复旦大学陈力课题组从一位非霍奇金淋巴瘤（Non-Hodgkin’s lymphoma）患者的痰液中分离得到了一株脑膜脓毒黄杆菌 FMS-007，并通过高通量全基因组从头测序（De novo Sequencing），于2012年9月获得了国际上第一个覆盖基因组每一个碱基的由3,938,967个碱基组成的全基因组完成图，该完整参考序列将作为脑膜脓毒黄杆菌的标准全基因组参考序列，有效推进脑膜脓毒黄杆菌基础和应用微生物组学及精准医学的研究。（转化医学网360zhyx.com）