新浪登录
腾讯登录Meta分析发现了五个恶性皮肤黑色素瘤易感基因位点
| 导读 | 研究人员近日确定了五个恶性黑色素瘤易感基因位点，并且与这些易感基因相关的病例数已经达到了20。 |
利兹大学的Mark Iles 领导的一个国际团队对CMM基因组进行了两级的meta相关分析研究，共检测了大约16000例病例和24000例对照。研究人员近日将其结果发表在了《Nature Genetics》上，他们复制了之前已知的13个易感基因位点，复制了两个疑似易感基因位点，发现了五个新的易感位点，包括参与荷尔蒙的新陈代谢以及端粒维护的基因。
“我们使用了大量的力气来收集大量CCM案例和对照组，鉴定了五个新的易感位点，这五个位点没有一个是与传统的CMM风险因素具有显著相关性的，因此可能是疾病的新途径，”Ives和他的同事们在文章中这样写道。在他们研究的第一阶段，研究者们从所有6个公布的及5个未公布的CMM GWAS获得了12874例患者和23203例对照者，在第二阶段，他们从三个数据库中的3116例CMM患者和3206例对照者中检测了疾病相关的SNPs。他们补充道，相比较于先前黑色素瘤风险的研究，样本大小增加到了4倍以上。
在第一阶段，研究人员发现，13个之前报道的CMM易感基因位点在全基因组中都具有显著地意义，并且有两个其他的与黑色素瘤相关的位点之前并没有获得。此外，他们指出，三个与具有全基因组显著性的CMM相关的位点和SNPs，在另外11个区域中没有显著意义，但是与端粒基因具有相关性，其在黑色素瘤中被认为发挥了一定的作用。
在研究的第二阶段，在3116例CMM和3206例对照者中携带了18个SNPs。第二阶段的meta分析发现了具有全基因组显著的两个新区域，同时别人了与黑色素瘤相关的五个SNPs。
相关信号定位在2p22.2，这是在第一阶段和全部meta分析中获得的结果，这包括了RMDN2的3’UTR和整个CYP1B1基因。他们补充道，这些SNPs位于角化细胞和黑色素细胞的潜在增强子活性区域附近。
CYP1B1基因编码一种通过ARNT调节的内源激素和外源性化学物质，研究人员补充道，ARNT本身就定位在黑色素瘤相关位点。他们认为，ARNT能够影响CYP1B1的黑色素瘤风险。
CYP1B1基因突变也与其他癌症相关，特别是与荷尔蒙相关的，比如乳腺癌和卵巢癌。
研究人员感兴趣的另一个SNP位点是-rs7776158，其位于6p22.3-其是一个黑色素细胞增强子，可以和IRF4结合，在IRF4处的一个SNP是与痣数，皮肤黑色素沉着，黑色素瘤及晒黑反应相关，这些都与黑色素瘤具有相关性。
与此同时，另一个定位在10q23.33的信号和端粒长度密切相关。他们补充道，那里的信号同时跨越了OBFC1基因和SH3PXD2A基因的启动子。研究人员表示，因为OBFC1是端粒维持复合物的一个部分，所以其是一个更有希望的候选。他们说，还有另外三个位点在端粒相关的区域里的。
“这进一步提供了端粒途径在细胞生长和衰老方面的证据，其对黑色素瘤细胞的发展也是具有重要影响的，”Ives和他的同事说。
研究人员补充道，13个之前已经知道的位点，能够解释17%的CMM家族相关性风险。加上通过他们新近发现证明的7个基因位点，能够他们能够19.2%的家庭相对风险。
他们指出，可能还有更多的位点会导致该疾病发生。（转化医学网360zhyx.com）
以上为转化医学网原创翻译整理，如需转载，请联系 info@360zhyx.com 。
还没有人评论，赶快抢个沙发