综合测序诊断：挽救患者于“儿科癌靶向药泥潭”的命运之梯

  根据哥伦比亚大学医学中心研究人员的一项最新研究，在高风险儿科癌症患者进行的全面的测序肿瘤谱分析之后很少有患病儿童能够匹配到合适的药物。
  该研究对应的论文发表于最新上线的Genome Medicine。哥伦比亚大学儿科系和赫伯特·欧文综合癌症中心的Andrew Kung及其同事报道了101名儿科癌症患者肿瘤外显子组，转录组以及一些列儿科肿瘤相关基因的测序结果与治疗情况。虽然他们检测到了38位病人基因组中存在潜在的药物靶点，但是这批病人中只有6位在最终匹配到了合适的药物。对于剩下三分之二的病人来说，临床测序仅仅为他们带来了更为合适的临床护理。
  据悉，哥伦比亚大学自2014年便开始了这项涉及101位临床儿科肿瘤患者的研究。这批儿童的预后5年存活率均不及50%。他们所患的癌症除了异常的临床表型之外还涉及一些尚没有治疗标准的罕见癌症，疑似癌症倾向的复发性疾病。
  研究人员共对这批患者的85个原发性肿瘤样本和35个复发性肿瘤样本进行了检测。对其中63位患者的肿瘤组织和正常组织进行了全基因组测序和转录组测序。
  相关的测序结果显示这些患者的特异肿瘤中可能包含具备特殊药物靶点的体细胞突变或可通过其他方式进行相关干预的其他体细胞突变。此外，研究人员还发现了这批患者肿瘤基因组中存在的几种耐药性突变。
  据悉，参与这项研究的每位患者进行临床测序检测的总费用大约为6000美元，其中部分由病人保险支付。即便如此，第三方付款人也花费了六个月至一年的时间才做出了最终的报销决定。
  总体而言，101为儿科肿瘤患者中的38位患者基因组内至少存在一个可能的药靶突变，但这其中只有6位患者得到了最终的匹配治疗。作者指出，对儿科患者进行靶向治疗尤其困难，因为较新的药物通常缺乏儿童功效的相关报告或安全可靠的实验数据。保险公司也不会将这些尚未得到严格验证的药物纳入自己的保单范围。此外，他们写道，大量的靶向药临床试验也更倾向于选择成人患者作为新靶向药的试药者。
  总地来说，根据临床肿瘤测序结果制定和修改的临床治疗方案最终让高达75％的患者获得了更为显著的临床疗效。研究人员指出，结合外显子测序，基因组测序等综合检测的测试组合具有优于靶向癌症组检测的诸多优点，除了药物靶点之外，更为综合的临床测序检测还可以鉴定基因易位，节段性染色体变化和癌症相关基因表达变化，进而帮助临床肿瘤医生制定更为适宜的治疗策略。
  “随着基因组医学研究项目数量的增加和相关知识的不断增长，采用一个更具包容性的临床疗效评价标准，使临床靶向药的选择过程不再局限于某些特定的基因突变将成为当前NGS技术纳入临床实践重要抉择。”文章的作者写道。
  来源：Implementation of next generation sequencing into pediatric hematology-oncology practice: moving beyond actionable alterations doi:10.1186/s13073-016-0389-6

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