中科普瑞-限时推出(3500/样本)850k芯片服务
导读 | Illumina InfiniumMethylationEPICBeadChip(850K甲基化芯片)服务助力科研,畅“研”一夏 3500 RMB/样本 一个样本起! 中科普瑞850K芯片服务3500 RMB豪华套餐实验服务(含)芯片实验(*不含样本抽提)基础分析(含)数据质控1. |
Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip(850K甲基化芯片)服务
助力科研,畅“研”一夏
3500 RMB/样本
一个样本起!
中科普瑞850K芯片服务 3500 RMB豪华套餐 |
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实验服务(含) |
芯片实验(*不含样本抽提) |
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基础分析(含) |
数据质控 |
1. 样本的β值密度曲线 |
2. 各样本的β值箱线图 |
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3. 样本相关性图 |
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4. PCA图 |
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差异筛选 |
1. 标准化后的甲基化位点总表 |
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2. 差异甲基化位点(DMP)列表 |
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3. 差异甲基化区域(DMR)列表 |
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4. 差异甲基化位点的染色体分布图 |
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5. 差异甲基化位点热图/散点图/火山图 |
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功能注释 |
1. DMP对应基因的GO和KEGG富集 |
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2. DMR对应基因的GO和KEGG富集 |
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高级分析(含) |
1. Functional Epigenetic Modules分析 |
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2. 拷贝数变异分析 |
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3. 甲基化与表达谱的关联分析(有对应表达谱数据) |
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高级分析 (收费项目,不含) |
1. 多组学关联分析 2. WGCNA分析 3. EWAS分析 4. 机器学习 5. Meta分析 6. 其它可定制高级分析 |
部分高级分析展示
850k芯片技术特点
1. 全面的基因组覆盖范围:检测>853,000个CpG位点,全面覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子。此外还包括CpG岛外的CpG位点,已知DMR位点,脱氧核糖核酸酶超敏位点以及miRNA启动子区域;
2. 高质量的数据:同时采用Infinium I及II探针设计,使检测范围最大化;
3. 分辨率高:单碱基分辨率,可以直接检测到发生甲基化的确切位点;
4. 重复性高: 自身技术重复相关性R2 > 0.98 ;与450K交集探针间(850K vs 450K)相关性R2 > 0.98;
5. 起始模板量低:仅需 250 ng,大大节约了样品量;
6. 检测样本类型更广:不仅可以检测全血、细胞、新鲜/新鲜冷冻的组织、而且也可检测FFPE样本。
850K芯片与WGBS参数对比
技术参数 |
850K芯片 |
WGBS |
检测物种 |
人 |
不受限 |
检测原理 |
重亚硫酸盐转化 |
重亚硫酸盐转化 |
起始量 |
250 ng |
2 μg |
分辨率 |
单碱基 |
单碱基 |
检测CpG位点 |
>85,000 |
>3,800,000 |
是否适用于FFPE |
适用 |
不适用 |
技术重复 |
R2>0.98 |
低 |
实验周期 |
20个工作日 |
30个工作日 |
实验费用 |
3.5K |
10K |
检测范围 |
已知位点 |
不受限 |
数据分析 |
简单 |
困难 |
联系我们:
上海鲸舟基因科技有限公司(中科普瑞科研服务控股子公司)
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