【Nature子刊】扩大全基因组关联研究的多样化和全面性！交叉人口荟萃分析62.8万人群，发现5000多个新的基因组位点

全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies，GWAS）是指在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如SNP或CNV等）分型，从而寻找与复杂疾病相关的遗传因素的研究方法，全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。

纵观大部分医学史，医生根据对临床症状的描述和表现，诊断出患有各种疾病的个体。近年来，利用全基因组关联研究（GWAS）进行的研究帮助科学家了解与不同疾病有关的遗传因素。10月25日，在《Nature Genetics》上最新发表的一篇文章“A cross-population atlas of genetic associations for 220 human phenotypes”中，大阪大学和哈佛医学院的研究人员领导的一个团队对来自不同人群的生物库样本进行了GWAS，以确定与各种医学适应症和特征相关的特定基因组位点。

DOI: 10.1038/s41588-021-00931-x

尽管GWAS在过去几十年中得到了密集的执行，但其广泛适用性还不够。大多数GWAS使用欧洲人口数据，表型数量相对较少，因为招募了患有某些疾病的个体参与。还缺乏一种系统的方法来解释结果并将其置于具体环境中。因此，大阪大学团队旨在解决这些限制并执行公平的GWAS。

为了实现这一目标，该团队使用日本生物库（BioBank Japan）执行了GWAS，其中包括来自180000人的医疗数据，并且是最大的非欧洲生物库之一。这包括了220种与健康相关的疾病和特征，使得这项研究非常多样化和全面，特别是在亚洲人群中。

该研究的主要作者Saori Sakaue说：“我们希望显著扩大GWAS的范围，以尽可能多地从生物库中获得有意义的见解。”

该研究的第一作者Masahiro Kanai说：“事实上，在东亚人群中，108种表型从来都不是GWAS的一部分。”

随后，研究人员与英国生物库（英国）和芬根（芬兰）进行了交叉人群荟萃分析，共涉及628000人。这项研究帮助确定了14000多个具有表型意义的基因组位点。其中，5000个位点是新发现。该团队确保他们的汇总统计数据在一个门户网站（pheweb.jp）上公开，作为全球遗传学家和研究人员的资源。

资深作者Yukinori Okada解释道：“我们认为，创造一种——让更大的遗传学群体中的其他人访问我们的数据的方法——是极其重要的。我们肯定希望促进全球合作，并希望根据我们的发现进行有意义的功能性后续实验。”

由于GWAS结果和一般疾病遗传学的复杂性，研究团队对其汇总统计数据和其他数据进行了统计反褶积。这一步很重要，因为它使研究人员能够从他们庞大的数据集中得出与疾病相关的结论。

Sakaue解释说：“反褶积使我们能够精确定位特定的遗传变异和与不同人群疾病相关的共同机制。这些机制反过来有助于从人类遗传学的角度重新评估和重组人类疾病。”

这项研究提供了突破性的结果，解决了先前GWAS中的相关倾向。研究团队的发现将使研究人员能够用一种公正的眼光通过遗传学检查人类疾病。（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://medicalxpress.com/news/2021-10-redefining-human-diseases-lens-dna.html

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。