【Cancer Research】通过肿瘤的甲基化模式确定生物标志物，有助预测肿瘤免疫环境的类型和患者预后

《Cancer Research》杂志上的一项新研究“Tumor Expression Quantitative Trait Methylation Screening Reveals Distinct CpG Panels for Deconvolving Cancer Immune Signatures”中，Moffitt癌症中心的研究人员报告了他们根据一类被称为甲基化的基因修饰鉴定出的生物标志物，可以预测肿瘤免疫环境的类型和患者预后。

https://aacrjournals.org/cancerres/article-abstract/82/9/1724/694708/Tumor-Expression-Quantitative-Trait-Methylation?redirectedFrom=fulltext

基因受到特定修饰的高度调控，这些修饰既可以促进也可以阻断其表达。一类被称为甲基化的表观遗传修饰涉及甲基化学基团附着在基因的特定区域。通常情况下，基因启动子区域较高水平的甲基化往往与较低的基因表达水平相关。最近，研究表明，遗传甲基化的模式可能是潜在的生物标志物。与常用的基因表达生物标志物相比，使用甲基化作为生物标志物具有几个优势，包括重现性和稳定性，使其易于在临床环境中使用，不同检测技术之间的变异较少，以及使用冷冻或甲醛固定并石蜡包埋的组织标本的能力。

目前，细胞溶解活性评分(CYT)是一种已得到确认的生物标志物，可根据基因表达预测是否存在肿瘤浸润淋巴细胞。肿瘤浸润淋巴细胞是一类从血液中移出并进入肿瘤的免疫细胞。肿瘤中存在大量肿瘤浸润淋巴细胞通常与患者预后改善相关。CYT通过测量基因表达模式预测是否存在肿瘤浸润淋巴细胞，尤其是细胞毒性T细胞。

在他们的研究中，Moffitt研究人员想确定一个更好的生物标志物，他们提出了基于肿瘤甲基化数量性状表达（eQTM）的概念，将基因甲基化模式与基因表达相关联，以确定潜在的生物标志物。研究人员将黑色素瘤作为一种疾病模型，并评估他们是否可以确定一种特殊的甲基化标记，可以预测肿瘤的免疫环境是什么样子和患者预后。

研究小组发现，黑色素瘤样本中的甲基化序列可以作为CYT的替代生物标志物，并预测肿瘤中免疫环境的类型。通过进行更有针对性的分析，他们确定了名为TCF7的单个基因的甲基化可以预测肿瘤中的T细胞是否具有抗肿瘤特性，他们发现TCF7标记结合CYT可以预测患者预后。具体来说，具有低TCF7标记和高CYT的黑色素瘤患者比其他标记组合具有更长的生存期。研究人员证实了低TCF7/高CYT在其他肿瘤类型中的关联，包括肾癌、食管癌、胶质瘤、肉瘤和肺癌。此外，研究人员确定TCF7标志物可以独立于其他变量预测患者预后。

“虽然还需要进行额外的研究，但这些分析表明，通过eQTM筛查来确定免疫表基因组状态可以允许对患者预后进行准确的预测。该发现解锁了个性化治疗决策的潜在新靶点，它类似于指纹或虹膜扫描，”Moffitt计算免疫学小组负责人Xuefeng Wang博士说。（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://medicalxpress.com/news/2022-05-tumor-based-methylation-patterns-cancer-biomarkers.html

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。